該技術(shù)具體操作步驟是：醫(yī)療人員從身體健康的自愿捐獻(xiàn)者收集糞便后,，先在實驗室進(jìn)行處理,，只保留糞便內(nèi)健康的微生物群。然后拿到零下80攝氏度的冰柜冷凍,，待需要移植時才解凍,。糞便移植術(shù)則是通過普通胃鏡或大腸鏡的內(nèi)窺鏡技術(shù)灌入患者腸道內(nèi)。

有報道說,，由于近年來有越來越多人對抗生素產(chǎn)生抗藥性,，雖然抗生素治療對大多數(shù)患者奏效，但感染復(fù)發(fā)率介于15％至25％,，另有約兩至三成患者對抗生素治療沒有反應(yīng),。

患者長期服用的抗生素會打亂體內(nèi)正常的微生物生態(tài)平衡，有時會無法消滅一些抗藥性強的壞細(xì)菌如艱難梭菌（clostridium difficile）,。艱難梭菌大量繁殖所產(chǎn)生的毒素會引發(fā)腸道系統(tǒng)感染,，輕微者會出現(xiàn)腹瀉和糞便出血等癥狀，嚴(yán)重者則可致命,。

當(dāng)感染艱難梭菌的患者出現(xiàn)腹瀉癥狀后,，醫(yī)生才會建議病人停止服用抗生素，或者選擇藥力更強的抗生素殺死艱難梭菌。如果不見效,，才考慮進(jìn)行糞便移植術(shù),。

受艱難梭菌感染的患者大多是有多種疾病的老人，他們的抵抗力自然較低,，很難單靠抗生素復(fù)原,。受細(xì)菌感染的腹瀉患者可在移植糞便后的兩三天內(nèi)看到效果，有報道一名接受手術(shù)患者,，從原本每天腹瀉12次減少至每天兩三次,。

由于糞便移植術(shù)仍屬于體外移植技術(shù)，因此捐獻(xiàn)者須經(jīng)過嚴(yán)格篩選,、檢測和測試,。

研究發(fā)現(xiàn)，糞便移植術(shù)對糖尿病,、肥胖癥或過敏性腸胃等病癥的效用有待觀察,，此舉可擴大糞便微生物的醫(yī)療功效。