大家在進(jìn)行差異基因表達(dá)分析時(shí),，會(huì)得到一批顯著差異基因，接下來(lái)就需要分析這些基因參與了哪些功能,，常見(jiàn)的就是GO功能注釋和KEGG（pathway）通路富集分析,。那么，啥叫GO功能注釋呢,？啥是KEGG,？

作為小白的我真是有點(diǎn)混淆呢！今天就給大家詳細(xì)介紹一下GO/KEGG的強(qiáng)大之處,！以及我們?nèi)绾螐倪@批差異基因中如何得知他們參與的功能與通路,。

GO（gene ontology）

先說(shuō)說(shuō)GO，GO（gene ontology）分別從功能,、參與的生物途徑,、細(xì)胞中的定位，對(duì)基因產(chǎn)物進(jìn)行了簡(jiǎn)單注釋,。所以通過(guò)GO富集分析可粗略的了解基因富集在哪些生物學(xué)功能,、途徑或細(xì)胞定位。

KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）

再來(lái)說(shuō)說(shuō)KEGG,，大多數(shù)聽(tīng)說(shuō)過(guò)KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）的人都會(huì)把它當(dāng)做一個(gè)基因通路（Pathway）的數(shù)據(jù)庫(kù),，其實(shí)它的功能遠(yuǎn)不止于此。KEGG是一個(gè)整合了基因組,、化學(xué)和系統(tǒng)功能信息的綜合數(shù)據(jù)庫(kù),。KEGG擁有好多子數(shù)據(jù)庫(kù)，而其中有一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)叫做KEGG Pathway,，專(zhuān)門(mén)存儲(chǔ)不同物種中基因通路的信息,，也是大家用的最多的一個(gè)，所以,，久而久之,，KEGG就被大家當(dāng)做是一個(gè)通路數(shù)據(jù)庫(kù)了。

現(xiàn)在問(wèn)題來(lái)了，我們手握這么一批差異基因該如何知道他們參與的功能和通路呢,？所以主角閃亮登場(chǎng),，就是今天要給大家介紹的，可以找到差異基因參與的功能與通路的在線(xiàn)分析工具——DAVID與KOBAS,。

GO與KEGG富集分析,，往往同時(shí)出現(xiàn)在不同場(chǎng)合，DAVID其實(shí)就可以做GO與KEGG富集分析,，但相比之下,，KOBAS畫(huà)出的圖更賞心悅目，但KOBAS不支持直接輸入gene symbol ,，所以我們常常聯(lián)合DAVID和KOBAS一起進(jìn)行使用,。

話(huà)說(shuō)David到底有多神奇呢？據(jù)統(tǒng)計(jì)僅DAVID這一個(gè)軟件就發(fā)表了10篇sci文章,，其中5分以上7篇,，累計(jì)影響因子將近85分。其他用DAVID進(jìn)行分析并發(fā)表的文章就更不計(jì)其數(shù)了,。DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)分為幾塊,，分別是功能分析、ID轉(zhuǎn)換,、基因功能分類(lèi),、基因查找等。DAVID需要用戶(hù)提供感興趣的基因列表,，在基因背景下,，使用提供的分析工具，提取該列表中含有的生物信息,。這里說(shuō)的基因列表和背景文件的選取對(duì)結(jié)果至關(guān)重要,。我們得知他們參與的功能和通路后，可根據(jù)kegg/go結(jié)果來(lái)選擇自己的研究方向啦,。那么集萬(wàn)千優(yōu)點(diǎn)于一身的“大衛(wèi)”,，該如何操作使用呢？

今天給大家推送的就是關(guān)于DAVID&KOBAS的使用方法,，希望能夠幫助大家在科研工作中少走彎路,，都能早早的順利發(fā)表自己文章。以下為課程目錄,。

DAVID使用教程（自制視頻教學(xué)&PPT）

• DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介
• DAVID功能注釋
• DAVID基因ID轉(zhuǎn)換

KOBAS數(shù)據(jù)庫(kù)使用教程（自制視頻教學(xué)&PPT）

• KOBAS數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介
• KOBAS功能注釋
• KOBAS基因ID轉(zhuǎn)換