平均熒光強度(Mean Fluorescence Intensity, MFI)描述偶聯(lián)抗體的信號強弱的一種方法,。它常用的三種表示形式：幾何平均熒光強度（Geometric Mean Fluorescence Intensity）、中位數(shù)平均熒光強度（Median Mean Fluorescence Intensity）及算數(shù)平均熒光強度（Mean Fluorescence Intensity）,。平均熒光強度在流式分析中是最易被誤解或誤用的工具,。

三種熒光強度對應(yīng)統(tǒng)計學(xué)中幾何指數(shù)，均值指數(shù)或中位數(shù)指數(shù),。因此,，幾何平均熒光強度受異常值（無論值偏高或者偏低）的影響。算數(shù)平均熒光強度是熒光強度的平均值,，它偏向于高平均熒光強度的一側(cè),。中位數(shù)平均熒光強度設(shè)定為50％; 其中50％的細(xì)胞高于或低于中點。中位數(shù)平均熒光強度受數(shù)據(jù)的傾斜,、極端值等影響很小,。一般來說,，中位數(shù)平均熒光強度是最安全的MFI指標(biāo)。下圖顯示了CD45-A405,、CD69-PE兩種信號的熒光強度,。對于hCD4 A405，使用幾何平均熒光強度,、中值平均熒光強度和算數(shù)平均熒光強度的變化不大（都在1900左右）,，因為直方圖是一個緊密的峰值（峰值成正態(tài)分布）。相反,，hCD69 PE具有更廣泛的分布,，因此，幾何MFI（8917）,，中位數(shù)（12,784）和均值（16,809）的值差異大,。幾何平均熒光強度最低，中位數(shù)平均熒光強度居中,，算數(shù)平均熒光強度最高,。通常，中值平均熒光強度可能是描述信號強度的最佳參數(shù),。

使用平均熒光強度常見的誤區(qū)

1.對于陰性峰與陽性峰具有明顯分群的樣本,，使用百分比將產(chǎn)生更容易解釋和更具有統(tǒng)計學(xué)意義的數(shù)據(jù)（如圖）。

2.比較不同實驗的數(shù)據(jù)：由于熒光強度對實驗條件（如抗體稀釋,、串聯(lián)染料降解,、激光波動等）比較敏感，因此在多個實驗中比較任何類型的熒光強度都很危險

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