胃酸在本病的發(fā)病中起重要作用，抑酸治療是本病的主要療法,，質(zhì)子泵藥物（PPI）是最佳選擇,。質(zhì)子泵抑制劑相比傳統(tǒng)的抑酸藥，抑制胃酸分泌的作用強(qiáng)而持久，同時可以使胃蛋白酶的分泌減少,。常用的質(zhì)子泵抑酸藥物有埃索美拉唑,、蘭索拉唑、奧美拉唑,、雷貝拉唑,、泮托拉唑等。質(zhì)子泵抑制劑治療8周,，可以使96%的糜爛性食管炎患者治愈,，也能很好的緩解胃食管反流病的癥狀，但有10%~15%的病人不能緩解,。長期質(zhì)子泵抑制劑治療應(yīng)根據(jù)癥狀控制情況,，逐步減量直到采用最小有效劑量。質(zhì)子泵抑制劑治療一定要正規(guī),，食管外癥狀緩解較慢,。對所有食管外綜合征患者，經(jīng)驗(yàn)性1天2次足量質(zhì)子泵抑制劑治療8~12周后,，建議降階梯維持治療,，維持治療應(yīng)選擇最低質(zhì)子泵抑制劑的劑量來滿足充分的癥狀緩解。不良反應(yīng)主要為惡心,、脹氣,、腹瀉、便秘,、上腹痛等,。皮疹、谷丙轉(zhuǎn)氨酶（ALT）和膽紅素升高也有發(fā)生,，一般是輕微和短暫的,，大多不影響治療。

胃食管反流是一種動力障礙性疾病,，常存在食管,、胃運(yùn)動功能異常，質(zhì)子泵抑制劑治療無效時,，可應(yīng)用促動力藥,。對于伴隨腹脹、噯氣等動力障礙癥狀的患者,，效果明顯優(yōu)于抑酸劑,。

抑酸劑治療無效，且經(jīng)食管測壓證實(shí)有食管動力異常的患者,，可試用促動力藥聯(lián)合抑酸劑治療,。

巴雷特食管是胃食管反流嚴(yán)重的并發(fā)癥，食管下端有不正常的柱狀上皮覆蓋，有發(fā)生腺癌的可能,。因其有惡變的可能,，應(yīng)進(jìn)行內(nèi)鏡隨訪及活檢，以早期發(fā)現(xiàn)異型增生及腺癌,。當(dāng)患者有低度異型增生時,，可采用大劑量的質(zhì)子泵抑酸藥治療。中重度異型增生或出現(xiàn)結(jié)節(jié)狀增生時可行內(nèi)鏡下治療甚至局部食管切除,。