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山東人酒量其實一般,?最大規(guī)模中國人基因庫研究結(jié)果首發(fā)

 西窗聽雨 2020-05-12

為什么有些人更易患癌?哪些地區(qū),、民族的人喝酒厲害,?這些可能都與某些特定基因相關(guān)。

首次全部中國自主創(chuàng)建最大規(guī)模的中國人基因庫結(jié)果發(fā)表于國產(chǎn)期刊,。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院內(nèi)分泌科領(lǐng)銜的ChinaMAP(中國代謝解析計劃)聯(lián)盟攜全國29家研究機(jī)構(gòu)和醫(yī)院,,日前在中科院上海生命科學(xué)研究院主辦的《Cell Research》雜志首次報道了對覆蓋全國27個省份和直轄市,8個民族,,超過1萬人的高深度全基因組測序數(shù)據(jù)和表型的系統(tǒng)性分析,。

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院在其官方微信公眾號上說,這一研究成果是通過中國人自己的儀器,、平臺,、分析方法,對中國人的基因組特征進(jìn)行深入,、廣泛的研究,,具有前所未有的重要意義。

日本人群與中國北方漢族人群聚類完全重疊

長期以來,,中國人的很多遺傳疾病研究,,都直接應(yīng)用外國人的數(shù)據(jù)和結(jié)論。但由于不同地域人群和種族之間的歷史淵源和遺傳背景存在著巨大差異,,如果把具有其他人群偏向性的知識和結(jié)論直接用作中國人的疾病風(fēng)險評估,、遺傳咨詢或診斷治療依據(jù),并不完善和可靠,。

“用中國人自己的數(shù)據(jù)組建中國人自己的精準(zhǔn)醫(yī)療體系,。”由此出發(fā),,國家代謝性疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心(上海)基于上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院牽頭開展的多項覆蓋全國的隊列研究,,依托轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國家重大科技基礎(chǔ)設(shè)施(上海)和醫(yī)學(xué)基因組學(xué)國家重點實驗室,,實施了中國代謝解析計劃ChinaMAP (China Metabolic Analytics Project),。

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院內(nèi)分泌科主任王衛(wèi)慶介紹,,研究團(tuán)隊對隊列中代表中國不同地區(qū)和民族的10588人DNA樣本進(jìn)行了40×深度全基因組測序,完成了高質(zhì)量的中國人群遺傳變異數(shù)據(jù)構(gòu)建,、中國人群體結(jié)構(gòu)分析,、基因組特征比較以及變異頻譜和致病性變異解析。在ChinaMAP一期數(shù)據(jù)庫中,,包含1.36億個基因多態(tài)性位點SNP和1千萬個插入或缺失位點(NDEL),,其中一半是在國際通用的多個數(shù)據(jù)庫中均沒有的新位點。

研究覆蓋中國7大地理區(qū)域,,包括了56個民族中人口最多的漢族,、壯族、回族,、滿族,、苗族、彝族,、藏族和蒙古族,,顯示了中華民族跨地理區(qū)域人群遺傳背景的多樣性和復(fù)雜性。

研究團(tuán)隊首次揭示了漢族人群可顯著分成7個亞群:北方漢族(北京,、天津,、河南、河北,、山東,、遼寧、吉林,、黑龍江,、山西),西北漢族(甘肅,、陜西),,東部漢族(江蘇、浙江,、上海,、安徽),中部漢族(湖北),,南方漢族(貴州,、四川、重慶、湖南,、云南,、江西),東南漢族(福建)和嶺南漢族(廣東,、廣西),。

少數(shù)民族中,藏族,、彝族,、蒙古族、苗族和壯族都有著獨(dú)特的人群聚類,,而滿族和北方漢族相近,,回族和西北、北方漢族相近,。不同地域人群的變異特征也與中國歷史上的人口遷徙和變遷相關(guān),,例如河西走廊是絲綢之路中不同民族遷徙的交通要道,歷史上包括粟特人等許多民族曾在此經(jīng)商生活,。

研究揭示,現(xiàn)代河西走廊地區(qū)的人具有的基因多態(tài)性位點數(shù)量更多更復(fù)雜,。與全世界其他人群相比,,中國人的遺傳特征與歐洲、非洲,、南亞和拉丁美洲人群之間存在著巨大差異,,與非洲人群差距最大,而與東亞人群非常相似,。研究者在成分分析中發(fā)現(xiàn),,日本人群與中國北方漢族人群聚類完全重疊。

山東人酒量并不突出,,易臉紅應(yīng)少喝酒

ChinaMAP對中國人的營養(yǎng)代謝和藥物代謝相關(guān)遺傳特征也進(jìn)行了分析比較,。對受到廣泛關(guān)注的酒精代謝能力,從總體上看,,北方人的酒量比南方人相對更好,,藏族、蒙古族,、彝族和河南人酒量居于全國前列,。與一般認(rèn)識不同的是,山東人酒量實際并不突出,,福建人和廣東人的酒量排在全國最后,。

ChinaMAP證實,導(dǎo)致喝酒臉紅和酒精代謝能力差的乙醛脫氫酶2基因rs671變異是東亞人特異性的,在中國人群中的攜帶者(純合子比例4.50%,,雜合子比例34.27%)遠(yuǎn)高于全球其他人群,。rs671變異也是誘發(fā)食管癌發(fā)生的重要風(fēng)險因素,所以喝酒臉紅應(yīng)少喝酒,。

眾所周知,,不少遺傳性疾病是寫在基因密碼當(dāng)中的。上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院80后博導(dǎo)曹亞南介紹,,中國人群中先天性甲狀腺功能減低癥,、慢性胰腺炎、遺傳性掌跖角化癥等疾病的致病基因變異攜帶者較歐美人群顯著更多,,且具有地域分布特征,。

疾病相關(guān)變異位點在中國人群與歐美人群中的頻率差異,說明我國的遺傳咨詢和解讀,,對重要性不確定的基因變異(VUS)的研究,,以及相關(guān)臨床指南和路徑制定,需要依據(jù)中國人自己的大樣本和高質(zhì)量數(shù)據(jù),。

另外,,研究團(tuán)隊也對抗凝藥華法林的減量使用、抗血小板藥物氯吡格雷的適用人群分類,、他汀類降脂藥副作用風(fēng)險人群進(jìn)行了分析,。例如,對于高脂血癥常用的降脂藥辛伐他汀,,中國人中有超過20%的個體存在橫紋肌溶解這一不良反應(yīng)的風(fēng)險,,提示了針對我國人群特征的藥物基因組研究和藥物基因檢測的重要性。

代謝性疾病,,特別是Ⅱ型糖尿病和肥胖,,已成為中國和世界范圍內(nèi)發(fā)病率最高的重大慢病。但是,,歐洲人群中最顯著的Ⅱ型糖尿病遺傳風(fēng)險TCF7L2基因變異(如rs7903146)在中國人中的頻率卻很低,,可見在代謝特征和疾病研究中僅參考和驗證歐美人群的結(jié)果是不可行的。

在體重指數(shù)BMI相關(guān)分析中,,研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)了東亞人群新的特異性的CADM2基因位點,,CADM2在動物研究中已證實參與調(diào)節(jié)體重和能量穩(wěn)態(tài)。FTO等在歐美人群中發(fā)現(xiàn)的重要肥胖相關(guān)基因位點,,在ChinaMAP研究結(jié)果中并不顯著,。

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院在官方微信公眾號上說,ChinaMAP以覆蓋中國各地區(qū)的研究隊列為基礎(chǔ)建立了高質(zhì)量中國人群數(shù)據(jù)庫,,通過高深度全基因組數(shù)據(jù)和精細(xì)表型分析,,可為疾病機(jī)制研究,、預(yù)防、遺傳咨詢和公共衛(wèi)生管理提供依據(jù),。

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