全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序,。 1986年， Renato Dulbecco是最早提出人類基因組測序的科學(xué)家之一,。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,，對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛(wèi)生研究院（NIH）,，分別在1986年與1987年加入人類基因組計劃,。除了美國之外，日本在1981年就已經(jīng)開始研究相關(guān)問題,，但是并沒有美國那樣積極,。到了1988年,，詹姆士·華生（DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)者之一）成為NIH的基因組部門主管。1990年開始國際合作,。1996年,，多個國家召開百慕達會議，以2005年完成測序為目標,，分配了各國負責(zé)的工作,，并且宣布研究結(jié)果將會及時公布，并完全免費,。

應(yīng)用領(lǐng)域

(1) 全基因組范圍內(nèi)多性狀的定位,；

(2) 目標性狀的生物學(xué)基礎(chǔ)研究。

產(chǎn)品優(yōu)勢

(1) 高通量檢測全基因組SNP并進行關(guān)聯(lián)分析,，掃除定位盲點,；

(2) 重重篩選SNP，多重檢驗顯著性,，保證結(jié)果準確性,；

(3) 同時對多種性狀進行定位；

(4) 定位精度最多可達單基因水平,。

標準信息分析

(1) 已有參考基因組序列的動植物自然群體,；

(2) 樣本間無明顯的亞群分化（如生殖隔離等）；

(3) 所研究表型性狀遺傳力較強,。

(4) ≥200個樣本,；

(5) 基于SNP：≥5 X/個體；

(6) 基于CNV：≥30X/個體 10~20W Tags,；

(7) 平均8 X/Tag；

(8) 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估,；

(9) 與參考基因組比對,；

(10) SNP、CNV檢測及注釋 SNP檢測及注釋,；

高級信息分析

(1) 構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,；

(2) 群體主成分分析；

(3) 連鎖不平衡分析,；

(4) 性狀關(guān)聯(lián)分析,；

(5) 目標性狀相關(guān)區(qū)域基因功能注釋；

(6) 構(gòu)建單體型圖譜,。