最近研讀《全球基因治療研究報(bào)告》(750頁),，希望體會(huì)一下“基因治療時(shí)代”的到來,。正準(zhǔn)備躊躇滿志擁抱“基因時(shí)代”，《自然》又刊發(fā)了新觀點(diǎn)：關(guān)于人類基因新理論又辯論起來了,！我們對(duì)基因知之甚少,！至今無人知曉有多少,。

第九屆中美臨床與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國際論壇：

座談交流

從《全球基因治療研究報(bào)告》看“基因治療時(shí)代”到來，

如何準(zhǔn)備和參與,？如何領(lǐng)跑,？

從腫瘤到遺傳病的基因治療，

中美各自優(yōu)勢(shì)在哪里,？

如何合作共贏,？

基因治療意味著趨向精準(zhǔn)，

是否人人獲益,？

如何破解天價(jià)基因藥的窘境,？

在過去20年里，科學(xué)家完成了人類全基因組測(cè)序和疾病基因突變測(cè)序,。遺憾的是至今基因?qū)W家和醫(yī)學(xué)家仍無法確定哪些基因或突變涉及哪一疾病或特征,，詮釋測(cè)序結(jié)果仍然莫衷一是。

盡管科學(xué)家完成了人類全基因編碼測(cè)序工作,，詮釋基因編碼依然是個(gè)“謎”,！

據(jù)說最初嘗試把人類基因編碼解密的設(shè)想是一幫來自著名冷泉港實(shí)驗(yàn)室的科學(xué)家和遺傳學(xué)家，他們聚在酒吧里喝酒閑侃突發(fā)奇想,。今天再看是否就是無稽之談,？或許我們根本無法解密人類的遺傳基因密碼。

2000年,，當(dāng)人類基因組測(cè)序項(xiàng)目書還起草時(shí),，還是遺傳學(xué)家和生物醫(yī)學(xué)家在一起打賭猜測(cè)“人類到底有多少基因？賭注從數(shù)萬上升至數(shù)十萬美金,。

20年后的今天,，基因?qū)W家仍然無法回答“人類到底有多少基因？” 最重要的是,，這個(gè)問題的答案直接影響了理解哪些基因突變與疾病相關(guān),？誰又是主謀？參考：|必讀|重新思考癌癥的起源: 是“基因病”, 還是“代謝性疾病”

最近BioRxiv基因數(shù)據(jù)庫中又公布了幾百人生物樣本數(shù)據(jù)信息,，包括近5,000個(gè)以前從來未發(fā)現(xiàn)過的基因,，其中有近1200個(gè)基因具有指導(dǎo)合成蛋白質(zhì)的功能，這使得具有指導(dǎo)蛋白質(zhì)制造功能的基因超過了21,000個(gè)基因編碼序列,。

這一結(jié)果讓許多遺傳學(xué)家更難想象究竟還有多少新基因編碼尚未被確定出來,。這也讓整個(gè)醫(yī)學(xué)界深感“基因治療時(shí)代”或許為時(shí)尚早。我們對(duì)識(shí)別新基因（具有指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成功能）猶如瞎子摸象,，甚至確定一個(gè)基因編碼具有什么生物學(xué)功能還很幼稚無知。

美國約翰·霍普金斯大學(xué)計(jì)算生物學(xué)家Steven Salzberg教授不無感慨地說“科學(xué)家們一刻不停地努力了20年,，至今仍沒有確切答案”,。

由于采用不同的基因測(cè)序技術(shù)和分析方法,，除了常識(shí)性標(biāo)準(zhǔn)化誤差，最新數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和計(jì)算方法為定義基因編碼和測(cè)序確立了共識(shí)性標(biāo)準(zhǔn)（建議）,。

例如,，Salzberg領(lǐng)導(dǎo)的研究小組應(yīng)用來自基因型組織表達(dá)(GTEx)項(xiàng)目的數(shù)據(jù)，該項(xiàng)目有上百個(gè)人體 30多種不同組織的RNA測(cè)序編碼數(shù)據(jù),。RNA是DNA和蛋白質(zhì)之間的“中介”,。

研究人員希望借此來確定編碼蛋白質(zhì)的基因編碼，以及在細(xì)胞中那些不發(fā)揮重要作用的基因,。他們組裝了GTEx的900億多個(gè)小RNA片段,，并與人類基因組編碼進(jìn)行比對(duì)。

但是,，僅僅一段DNA被表達(dá)為RNA并不一定意味著它是一個(gè)功能性基因編碼,。為此，他們又進(jìn)一步比較其他物種基因組編碼,，由此來推斷生物相關(guān)共享的基因編碼,，那些共有的基因很可能因進(jìn)化而被保留下來。

Salzberg教授說“或許多少年后,，我們才能理解人類基因與蛋白質(zhì)直接的對(duì)應(yīng)關(guān)系,，包括編碼序列等?！?/span>

棘手問題依然棘手難解

許多科學(xué)家表示,，需要更多證據(jù)確定所謂指導(dǎo)蛋白質(zhì)的基因編碼的準(zhǔn)確性。EBI計(jì)算生物學(xué)家Adam Frankish和他的小組在測(cè)驗(yàn)100個(gè)由Salzberg團(tuán)隊(duì)確定的蛋白質(zhì)編碼基因,。通過反復(fù)評(píng)估,，只有一個(gè)似乎是真正的蛋白質(zhì)編碼基因。這簡(jiǎn)直是彼此開玩笑或南轅北轍,、互不相信,。全球其他基因?qū)W家的相互驗(yàn)證結(jié)果也總是磨棱兩可的結(jié)果。

原因或問題可能出在哪兒,？首先是定義基因的不精確和不斷變化,。生物學(xué)家過去把基因視為編碼蛋白質(zhì)的DNA序列，后來明白了,，一些非編碼RNA分子在細(xì)胞中也具有重要作用,。

判斷哪些是重要的 - 應(yīng)該被視為基因？仍然有爭(zhēng)議,，這就是今天生物基因?qū)W領(lǐng)域的真實(shí)現(xiàn)狀,，新的辯論又開始了。

最后，生物學(xué)家,、遺傳學(xué)家,，基因?qū)W家和醫(yī)學(xué)家達(dá)成共識(shí)：“生物，特別是人類遺傳物質(zhì)和機(jī)制極為復(fù)雜,，我們所知僅是皮毛而已,。”