歡迎各位來到“circRNA研究報(bào)道匯總”欄目，本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻(xiàn)21篇,，下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進(jìn)展,。

1、ILC2s產(chǎn)生的IL-13通過circPan3促進(jìn)腸道干細(xì)胞自我更新

文獻(xiàn)標(biāo)題：IL-13 secreted by ILC2s promotes the self-renewal of intestinal stem cells through circular RNA circPan3

期刊：Nature Immunology  

影響因子：21.8

通訊作者單位：中科院生物物理所

腸干細(xì)胞（ISCs）通過干細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)維持,，以在體內(nèi)平衡下精確調(diào)節(jié)自我更新和分化,。然而，腸道免疫細(xì)胞調(diào)節(jié)ISCs自我更新的方式還不清楚,。該研究發(fā)現(xiàn)小鼠和人Lgr5陽性腸干細(xì)胞存在的免疫細(xì)胞相關(guān)的環(huán)狀RNA circPan3（源自Pan3基因轉(zhuǎn)錄物）高表達(dá)。Lgr5陽性腸干細(xì)胞中circPan3敲低可削弱干細(xì)胞的自我更新能力和以依賴于免疫細(xì)胞的方式再生腸上皮細(xì)胞形成類器官能力也下降,。進(jìn)一步機(jī)制研究表明,，circPan3在腸干細(xì)胞中結(jié)合IL-13Rα1（編碼細(xì)胞因子IL-13受體的α1亞基）的mRNA以增加其穩(wěn)定性,，維持IL-13Rα1在腸干細(xì)胞中的表達(dá)。2型固有淋巴樣細(xì)胞（ILC2）分泌IL-13維持腸干細(xì)胞自我更新中非常重要,，IL-13與IL-13Rα1結(jié)合可促進(jìn)IL-13-IL-13R通路活化,，cicrPan3升高激活的IL-13-IL-13R信號(hào)傳導(dǎo)，其反過來通過STAT6磷酸化激活,，啟動(dòng)下游轉(zhuǎn)錄因子Foxp1的表達(dá),，F(xiàn)oxp1可使β-catenin核轉(zhuǎn)位，激活Wnt/β-catenin通路,，維持腸干細(xì)胞自我更新,。

圖注：circPan3促進(jìn)腸道干細(xì)胞自我更新的分子機(jī)制示意圖

2、ncx1基因的環(huán)狀轉(zhuǎn)錄物通過靶向miR-133a-3p介導(dǎo)缺血性心肌損傷,。

文獻(xiàn)標(biāo)題：A circular transcript of ncx1 gene mediates ischemic myocardial injury by targeting miR-133a-3p.

期刊：Theranostics   

影響因子：8.537

通訊作者單位：青島大學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究所

環(huán)狀RNA（circRNA）是一類新發(fā)現(xiàn)的RNA,，構(gòu)成哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組的重要部分，并在心血管系統(tǒng)中大量表達(dá),。然而,，這些circRNA在缺血性心臟病中的調(diào)節(jié)功能仍然很大程度上未知。在這里,，我們研究了由鈉/鈣交換蛋白1（ncx1）基因轉(zhuǎn)錄的circRNA在缺血性心肌損傷過程中在氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的心肌細(xì)胞凋亡中的作用,，命名為circNCX1。circNCX1表達(dá)水平響應(yīng)活性氧（ROS）刺激而增加,，并通過充當(dāng)內(nèi)源性miR-133a-3p海綿促進(jìn)心肌細(xì)胞凋亡,。由于circNCX1與miR-133a-3p的競(jìng)爭性結(jié)合，miR-133a-3p對(duì)促凋亡基因細(xì)胞死亡誘導(dǎo)蛋白（CDIP1）的抑制活性降低,。敲除小鼠心肌細(xì)胞和心臟組織中的circNCX1降低了CDIP1的水平并減弱了細(xì)胞凋亡和I/R（心肌缺血再灌注）損傷,。我們的研究結(jié)果揭示了circRNA在調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞凋亡中的新作用以及circNCX1/miR-133a-3p/CDIP1軸作為治療心血管疾病的治療靶標(biāo)的效力。

圖注：驗(yàn)證circNCX1與miR-133a-3p互作,。A,E圖:AGO2免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)（AGO2-IP ）表明circNCX1和miR-133a-3p與AGO2結(jié)合,；B:生信預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)circNCX1含有8個(gè)miR-133a-3p結(jié)合位點(diǎn)；C,，D圖:生物素標(biāo)記的miR-133a-3p探針或circNCX1探針可通過鏈霉素親和捕獲下對(duì)方,，表明兩者互作；F:FISH實(shí)驗(yàn)表明circNCX1與miR-133a-3p共定位,；G,H圖：過表達(dá)或shRNA敲低circNCX1后qPCR檢測(cè)miR-133a-3p的表達(dá)水平未發(fā)生顯著變化,；I圖：100μΜ H2O2處理H9c2細(xì)胞后，qPCR檢測(cè)miR-133a-3p的表達(dá)情況,；J圖：小鼠缺血性心臟組織中miR-133a-3p表達(dá)情況檢測(cè),。這些結(jié)果顯示circNCX1充當(dāng)miR-133a-3p的海綿而不調(diào)節(jié)miR-133a-3p的表達(dá)水平。

圖注：miR-133a-3p通過靶向CDIP1抑制心肌細(xì)胞凋亡,。A：targetscan預(yù)測(cè)到cdip1基因3’UTR存在保守性miR-133a-3p結(jié)合位點(diǎn),；B,C圖：100 μM H2O2處理H9c2 細(xì)胞和缺血性心臟組織,，CDIP1蛋白水平逐步增加；D圖：100 μM H2O2處理H9c2 細(xì)胞同時(shí)過表達(dá)miR-133a-3p,，CDIP1的表達(dá)水平相應(yīng)下調(diào),；E圖：熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)證明miR-133a-3p可直接靶向調(diào)控CDIP1；F圖：siRNA敲低CDIP1可降低100 μM H2O2誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的能力,，如果同時(shí)抑制miR-133a-3p則可恢復(fù)H2O2誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的能力,，表明miR-133a-3p通過靶向CDIP1抑制心肌細(xì)胞凋亡。

3,、circAGFG1充當(dāng)miR-195-5p的海綿,，通過調(diào)節(jié)CCNE1表達(dá)促進(jìn)三陰性乳腺癌進(jìn)展。

文獻(xiàn)標(biāo)題：The circRNA circAGFG1 acts as a sponge of miR-195-5p to promote triple-negative breast cancer progression through regulating CCNE1 expression.

期刊：Mol Cancer   

影響因子：7.776

通訊作者單位：重慶醫(yī)科大學(xué)

該研究由重慶醫(yī)科大學(xué)陳俊霞教授團(tuán)隊(duì)完成,，研究者首先通過RNA測(cè)序分析4對(duì)TNBC（三陰性乳腺癌）組織和相鄰瘤旁組織中circRNA的表達(dá)譜,，篩選到circAGFG1分子并使用定量實(shí)時(shí)PCR和原位雜交來確定兩個(gè)TNBC組中circAGFG1的水平和預(yù)后值。結(jié)果表明TNBC中circAGFG1明顯上調(diào),，其水平與TNBC患者的臨床分期,，病理分級(jí)和預(yù)后不良有關(guān)。circAGFG1可以促進(jìn)TNBC細(xì)胞增殖,，遷移和侵襲以及體內(nèi)腫瘤的發(fā)生和轉(zhuǎn)移,。機(jī)制分析顯示，circAGFG1可作為miR-195-5p的ceRNA（競(jìng)爭性內(nèi)源RNA）,，以減輕miR-195-5p對(duì)其靶基因細(xì)胞周期蛋白E1（CCNE1）的抑制作用,，circAGFG1通過circAGFG1 / miR-195-5p / CCNE1軸促進(jìn)TNBC進(jìn)展，可作為治療TNBC患者的新診斷標(biāo)志物或靶點(diǎn),。

圖注：A圖：火山圖展示RNA-seq測(cè)序分析TNBC組織中circRNA差異表達(dá)情況,，紅色點(diǎn)代表上調(diào)的circRNA，綠色點(diǎn)（下調(diào)的circRNA）,，藍(lán)色點(diǎn)（沒有差異）,；B,C圖：熱圖展示差異顯著前10的circRNA和mRNA表達(dá)情況；D,E圖：KEGG信號(hào)通路和GSEA富集分析結(jié)果表明差異circRNA及mRNA主要與細(xì)胞周期信號(hào)通路相關(guān),。

圖注：circAGFG1促進(jìn)TNBC細(xì)胞增殖,。a圖：circAGFG1過表達(dá)和干擾載體構(gòu)建（circRNA pLCDH-ciR載體由吉賽生物提供）；b和c圖：qRT-PCR檢測(cè)TNBC細(xì)胞轉(zhuǎn)染circAGFG1過表達(dá)和干擾載體后,，circAGFG1的表達(dá)水平,；d圖：CCK8實(shí)驗(yàn)表明過表達(dá)circAGFG1可促進(jìn)TNBC細(xì)胞增殖，反之shRNA敲低circAGFG1可抑制細(xì)胞增殖,；e和f圖：EdU實(shí)驗(yàn)結(jié)論與CCK8相一致,。

圖注：a圖：生信預(yù)測(cè)circAGFG1和miR-195-5p結(jié)合位點(diǎn)；b和c圖：FISH實(shí)驗(yàn)檢測(cè)circAGFG1和miR-195-5p在細(xì)胞和組織中有共定位；d圖：miR-195-5p在TNBC癌組織中低表達(dá),；e和f圖：TCGA數(shù)據(jù)庫分析TNBC中miR-195-5p的表達(dá)水平在癌癥中也是低表達(dá),，低表達(dá)對(duì)應(yīng)低生存時(shí)間。

圖注：e和h圖：熒光素酶報(bào)告基因表明circAGFG1和miR-195-5p有直接結(jié)合關(guān)系,；i和j圖：AGO2-RIP實(shí)驗(yàn)；k圖：RNA pulldown,，實(shí)驗(yàn)均表明circAGFG1和miR-195-5p直接結(jié)合,；l圖：過表達(dá)或敲低circAGFG1后miR-195-5p的表達(dá)改變情況；m圖：20個(gè)TNBC組織中circAGFG1和miR-195-5p表達(dá)水平的pearson相關(guān)性計(jì)算表明兩者呈負(fù)相關(guān),。

參考文獻(xiàn)列表