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宏轉錄組學揭示海洋水體中微生物獨特的小RNA

 tyg0705 2018-03-21

研究背景:

使用全RNA表達的宏轉錄組研究可以揭示最自然的微生物群落組成,,同時也包含了轉錄本的全部信息,。


研究方法:

研究人員獲取通過對海洋水體進行宏轉錄組測序獲得了大量DNA序列信息。包括了大量已知sRNA和未知的psPNA,。


1.前二十種sRNA的豐度分布與注釋


研究結果:這些psRNA通過和微生物基因比對,,map到了基因間區(qū),并且二級結構指向了功能調控基因,。通過測序深度的分析,,將這些psRNA分配到對應物種中,發(fā)現(xiàn)其分布很廣泛,,但不同組別間的差異又指示參與了生態(tài)適應的過程,。


結論:使用宏基因組學的方法可以揭示新的信息,包括最自然狀態(tài)下,,微生物物種的分布豐度,,sRNA的組成以及可能參與的代謝過程。


原文鏈接:

Metatranscriptomicsreveals unique microbial small RNAs in the ocean’s water column

http://www./nature/journal/v459/n7244/full/nature08055.html

Nature 459, 266-269 (14 May 2009) | doi:10.1038/nature08055;Received 31 October 2008; Accepted 9 April 2009


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