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臨床綜述 l 2022線粒體疾病-機制和病理生理學(xué)**

 CK醫(yī)學(xué)Pro 2023-04-19 發(fā)布于北京

我科進修培訓(xùn)的優(yōu)勢可能在于內(nèi)分泌全病種的規(guī)范培訓(xùn),注意不同時限進修的職稱限制:

  • 1年期和半年期的進修生有機會跟隨不同的主管,、主診醫(yī)生實踐內(nèi)分泌代謝病學(xué)的不同病種,,覆蓋常見病和多數(shù)少見疾病類型;
  • 亞專科學(xué)習(xí)可能不適合半年-1年制進修,;
  • 需要注意,,3-6個月時長的進修申請需要博士畢業(yè)或副高以上職稱;
  • 3個月時長的進修是參觀性質(zhì),,需要一定水平的專業(yè)基礎(chǔ)
CK注:1例高度疑似線粒體疾病的住院患者,,有各種相關(guān)表現(xiàn);從2009年在我院初次住院,,至今已歷10余年,。內(nèi)分泌代謝病醫(yī)生從專科的角度去討論相關(guān)的糖尿病或者其他內(nèi)分泌紊亂無可厚非,,但往往忽略從整個線粒體疾病的視角去分析:

臨床綜述 l 2022
線粒體疾病
機制和病理生理學(xué)

編譯/陳康



線粒體疾病是一組以線粒體功能障礙為特征的遺傳性疾病,。線粒體是除紅細胞外普遍存在的細胞器,是各種細胞代謝途徑(包括氧化磷酸化,、脂肪酸氧化,、Krebs循環(huán)、尿素循環(huán),、糖異生和酮生成)中中間代謝的重要整合部位【Mol. Aspects Med. 25, 365–451 (2004)】,。

線粒體在其他重要的細胞過程中也發(fā)揮重要作用,包括(非寒戰(zhàn))產(chǎn)熱,、氨基酸代謝,、脂質(zhì)代謝,、血紅素和鐵硫簇的生物合成,、鈣穩(wěn)態(tài)和細胞凋亡【Biochemistry 45, 2524–2536 (2006);BMC Evol. Biol. 9, 4 (2009),;Science 313, 314–318 (2006),;Cell 148, 1145–1159 (2012)】

線粒體疾病的病理生理學(xué)是復(fù)雜的,,涉及線粒體DNA (mtDNA)和核DNA (nDNA)的遺傳突變,。這種復(fù)雜的遺傳學(xué)意味著線粒體疾病可以具有任何遺傳模式,包括nDNA突變的常染色體和X連鎖遺傳以及mtDNA突變的母系遺傳,。還發(fā)現(xiàn)了由從頭突變引起的罕見散發(fā)病例,。在mtDNA突變患者中,由于單個細胞中存在多個mtDNA基因組,,遺傳和臨床表現(xiàn)進一步復(fù)雜化,,這通常會導(dǎo)致突變和野生型基因組的混合,稱為異源性(異質(zhì)性/heteroplasmy)(知識框 1),。異質(zhì)水平在確定細胞功能障礙的程度方面至關(guān)重要,。通常,線粒體疾病會導(dǎo)致氧化磷酸化(細胞產(chǎn)生ATP的過程)的主要缺陷,但其他因素,,如Krebs循環(huán)和葉酸循環(huán)的功能障礙,、酶中間體的缺乏和有毒物質(zhì)的積累等,也可能在疾病中發(fā)揮作用,。

知識框1:線粒體DNA異源/異質(zhì)性

大多數(shù)致病性線粒體DNA (mtDNA)突變是異質(zhì)的,,在單個細胞內(nèi)有突變和野生型mtDNA的混合物。高水平的異質(zhì)指的是具有高水平的突變mtDNA和低水平的野生型mtDNA的細胞,,而低水平的異質(zhì)指的是具有低水平的突變mtDNA但高水平的野生型mtDNA的細胞,。對線粒體疾病患者單細胞的研究表明,突變和野生型mtDNA水平對于確定細胞表型非常重要,。例如,,如果細胞含有高水平的突變mtDNA和低水平的野生型mtDNA(即高水平異源性),則細胞會出現(xiàn)呼吸缺陷,。出現(xiàn)這種缺陷的閾值取決于精確的突變情況和細胞類型:通常,,需要高百分比水平的突變mtDNA (>50%)才能導(dǎo)致細胞缺陷,但一些mtDNA突變僅在以非常高的水平存在時才產(chǎn)生缺陷(通常為mt-tRNA突變),,而其他突變(如單個,、大規(guī)模mtDNA缺失)在mtDNA缺失60%時才產(chǎn)生缺陷。

線粒體疾病具有臨床異質(zhì)性,,可發(fā)生于任何年齡,,并可表現(xiàn)為廣泛的臨床癥狀。線粒體疾病可以涉及任何器官或組織,,特征性地涉及多系統(tǒng),,通常影響高度依賴有氧代謝的器官,并且通常為進行性,,具有高并發(fā)癥發(fā)生率和死亡率【Lancet Neurol. 9, 829–840 (2010)】,。

與線粒體疾病相關(guān)的一些臨床特征可分為特定綜合征,例如Leigh綜合征(也稱為亞急性壞死性腦脊髓病)和Alpers-hutten locher綜合征,。線粒體疾病臨床表現(xiàn)的異質(zhì)性意味著這些疾病的診斷和治療都極其困難,。除了對組織活檢進行組織化學(xué)和生化分析外,診斷通常還依賴于基因檢測,。線粒體疾病患者的管理包括降低并發(fā)癥發(fā)生率和死亡率的策略,、器官特異性并發(fā)癥的早期治療以及可能的干預(yù)策略。

近年,,在對線粒體疾病的分子基礎(chǔ)及其遺傳病因的理解方面已經(jīng)取得了相當(dāng)大的進展,。此外,下一代測序(NGS)技術(shù)已經(jīng)改變了對由nDNA突變引起的線粒體疾病的診斷,,并且對于某些條件,,已經(jīng)將診斷成功率從<20%增加到> 60%。然而,只有在對患者進行細致的臨床和生化特征分析后,,才有可能做到這一點,。

線粒體生物發(fā)生和生物化學(xué)

健康的線粒體功能需要超過1500種蛋白質(zhì)【Cell 134, 112–123 (2008);Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 11, 25–44 (2010)】,。13種蛋白質(zhì)由mtDNA編碼,,其余的由nDNA編碼,在細胞質(zhì)中翻譯,,這些蛋白質(zhì)通過復(fù)雜的導(dǎo)入機制跨線粒體膜導(dǎo)入,。只有約100蛋白直接參與氧化磷酸化和ATP的產(chǎn)生(圖1)。氧化磷酸化需要通過線粒體呼吸鏈(也稱電子傳遞鏈)將電子傳遞給分子氧,,呼吸鏈包括四個多亞基復(fù)合物(也稱復(fù)合物I–復(fù)合物IV)和兩個可移動的電子載體泛醌(也稱輔酶Q10,、輔酶Q或CoQ)及細胞色素c。呼吸鏈產(chǎn)生跨膜質(zhì)子梯度,,通過復(fù)合物V(也稱ATP合酶)合成ATP,。一些研究表明,呼吸鏈復(fù)合體通常形成更大的結(jié)構(gòu),,稱為呼吸超級復(fù)合體(也稱為呼吸體),。呼吸體中一個復(fù)合體的缺陷可能對其他復(fù)合體產(chǎn)生連鎖效應(yīng)【Science 340, 1567–1570 (2013)】

圖1:氧化磷酸化的示意圖

氧化磷酸化是細胞用來氧化營養(yǎng)物質(zhì),,從而以ATP形式釋放能量的代謝途徑,。呼吸途徑包括呼吸鏈的復(fù)合物I-IV和復(fù)合物V(一種ATP合酶)。復(fù)合物I (NADH:輔酶Q氧化還原酶)通過輔酶Q10(也稱為CoQ)從其泛醌(CoQ,;q)形成泛醌醇(QH2),,在線粒體內(nèi)膜上產(chǎn)生電化學(xué)梯度。復(fù)合物II(琥珀酸-CoQ氧化還原酶)將Krebs循環(huán)(也稱為三羧酸(TCA)循環(huán))與呼吸鏈錯綜復(fù)雜地聯(lián)系在一起,。復(fù)合物II氧化琥珀酸鹽,,同時減少其泛酮中的CoQ(CoQ;q)形成泛醇(QH2),。復(fù)合物III(泛醇-細胞色素c氧化還原酶)通過氧化泛醇并產(chǎn)生電化學(xué)梯度來催化細胞色素c的還原。復(fù)合物IV(細胞色素c氧化酶)負責(zé)呼吸鏈的末端酶促反應(yīng),,將電子(e)轉(zhuǎn)移至分子氧并產(chǎn)生電化學(xué)梯度,。復(fù)合物V將跨膜電化學(xué)質(zhì)子(H+)梯度能轉(zhuǎn)化為機械能,催化ADP與磷酸鹽(P)之間的化學(xué)鍵能形成ATP,。

目前認為,,線粒體的起源是需氧細菌在10億多年前侵入了原始真核細胞并與之形成共生關(guān)系,即以ATP的形式交換能量,,以便自己能夠定居于細胞中,。但這種“內(nèi)共生假說”沒有得到廣泛認可,且受到了質(zhì)疑【Nature. 1998;392(6671):37】

平均而言,,每個人體細胞中含有成百上千個線粒體,。成熟紅細胞例外,它們完全依賴于無氧代謝,,不含有線粒體,。

雖然線粒體最初被視為單獨、孤立的細胞器,,但如今認識到線粒體形成了一個動態(tài)連接的網(wǎng)絡(luò)(又稱網(wǎng)格或者合胞體)【Nature. 2014;505(7483):335】

線粒體呼吸鏈是活性氧(ROS)的重要來源,,尤其是通過復(fù)合物I和復(fù)合物III。盡管線粒體中包括超氧化物歧化酶在內(nèi)的多種酶參與ROS處置,,ROS在線粒體生物發(fā)生的生理調(diào)節(jié)中正在發(fā)揮作用,,但過量的ROS可能會損傷脂質(zhì)膜、蛋白質(zhì)和核酸,,并在線粒體疾病的發(fā)病機制中發(fā)揮作用,。

線粒體總體的功能是作為進行有氧代謝和氧化磷酸化產(chǎn)能所必需的胞內(nèi)細胞器,而氧化磷酸化通過呼吸鏈實現(xiàn),。但是,,線粒體并非僅僅是細胞中產(chǎn)生ATP的“發(fā)電站”。線粒體也參與其他幾種代謝途徑,,包括β-氧化,、三羧酸循環(huán)及鐵-硫簇合成。而且,,線體可維持,、復(fù)制并轉(zhuǎn)錄自身DNA,并將mRNA翻譯為蛋白質(zhì),。線粒體的另一個重要功能是轉(zhuǎn)運和裝配蛋白質(zhì),,因為線粒體所需的大多數(shù)蛋白質(zhì)是由細胞核DNA編碼并在細胞質(zhì)溶膠中翻譯。線粒體網(wǎng)絡(luò)的持續(xù)重塑也是線粒體的一個功能,。另外還發(fā)現(xiàn)線粒體參與細胞凋亡,、活性氧(reactive oxygen species, ROS)產(chǎn)生、鈣穩(wěn)態(tài),、脂質(zhì)膜維持和免疫作用,。

線粒體DNA的復(fù)制、維持和轉(zhuǎn)錄

與細胞核DNA不同,,線粒體染色體的復(fù)制和分離未與細胞周期偶合,,可隨時發(fā)生。線粒體DNA位于線粒體基質(zhì)中稱為擬核的DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物內(nèi),。線粒體DNA復(fù)制,、維持和修復(fù)所需的蛋白質(zhì)也位于擬核內(nèi)【Nature. 2014;505(7483):335】,。這些蛋白質(zhì)由細胞核DNA編碼并轉(zhuǎn)運到線粒體內(nèi)。這些細胞核蛋白質(zhì)的功能障礙可導(dǎo)致線粒體DNA消耗,、多發(fā)性線粒體DNA缺失和/或位點特異性線粒體DNA突變【Nat Rev Neurol. 2013;9(8):429】,。 

線粒體DNA的復(fù)制由DNA聚合酶γ(polymerase gamma, POLG),、一種由POLG2編碼的輔助亞基,、twinkle及DNA2進行。用于復(fù)制的底物包括4種脫氧核苷三磷酸(dATP,、dGTP,、dCTP和dTTP),。已發(fā)現(xiàn)控制這些底物平衡的幾種酶與人類疾病有關(guān)。

mtDNA

人類mtDNA是一種雙鏈DNA分子,,編碼氧化磷酸化系統(tǒng)的13個結(jié)構(gòu)肽亞單位和線粒體內(nèi)蛋白質(zhì)合成所需的24個RNA分子【Nature 290, 457–465 (1981),;Nat. Genet. 23, 147 (1999)】圖2)。與nDNA相反,,mtDNA具有環(huán)狀結(jié)構(gòu),,缺乏內(nèi)含子-外顯子結(jié)構(gòu)。此外,,mtDNA的復(fù)制,、轉(zhuǎn)錄和翻譯都受一個非編碼區(qū)控制,稱為置換環(huán)(D環(huán)),。此外,,每個細胞內(nèi)存在多份mtDNA拷貝,總量可能在幾百份到數(shù)萬份之間,,具體取決于細胞類型,。許多線粒體疾病患者患有突變型和野生型mtDNA病(稱為異源性);突變和野生型mtDNA的比例是決定細胞是否表達生化缺陷的關(guān)鍵因素(知識框 1),。mtDNA的遺傳完全是母體遺傳,,因此在群體水平上發(fā)生的分子內(nèi)重組可以忽略不計。最后,,與nDNA相比,,mtDNA的遺傳密碼存在微妙但重要的差異。例如,,在mtDNA,,密碼子AUA和AUG編碼甲硫氨酸,密碼子UGA編碼色氨酸(不是終止密碼子,,如在nDNA),密碼子UAA和UAG是線粒體使用的唯一終止密碼子【Soc. Trans. 38, 1523–1526 (2010)】,。

圖2:人線粒體基因組
人類線粒體基因組是一個約16.6 kb的環(huán)狀雙鏈DNA分子,。它包括一個1.1 kb的非編碼區(qū),,稱為置換環(huán)(D環(huán)/ displacement loop),參與DNA轉(zhuǎn)錄和復(fù)制的調(diào)控,。復(fù)合物I中的7個亞單元(共44個),、復(fù)合物III的1個亞單元(共11個)、復(fù)合物IV中的3個亞單元(共14個)和復(fù)合物V中的2個亞單元(共16個)由線粒體DNA編碼(mtDNA),。MT-RNR1和MT-RNR2均為rRNA基因,,分別編碼12S和16S rRNA。單個字母,,如“Q”和“L”,,表示提供線粒體內(nèi)蛋白質(zhì)合成所需RNA成分的tRNA基因。OH和OL表示重鏈和輕鏈mtDNA復(fù)制的起源,。HSP,,重鏈啟動子;LSP,,輕鏈啟動子,。
Nat. Rev. Genet. 16, 530–542 (2015)
mtDNA病的致病突變可以影響呼吸鏈的結(jié)構(gòu)亞單位或線粒體蛋白質(zhì)合成機制。數(shù)百種不同的點突變和大規(guī)模mtDNA重排已被證明會導(dǎo)致疾病,。引起線粒體疾病的mtDNA突變可分為三種類型 (知識框 2,;圖3):
  • mtDNA重排(如偶發(fā)性、單個,、大規(guī)模mtDNA缺失),、

  • 參與蛋白質(zhì)合成的基因突變(如線粒體tRNA或rRNA突變)

  • 編碼結(jié)構(gòu)蛋白的基因突變(如線粒體mRNA突變)。
圖3:人類線粒體疾病相關(guān)基因及其在線粒體功能中的作用
核DNA缺陷(nDNA)可導(dǎo)致氧化磷酸化異常,、線粒體DNA (mtDNA)維持異常,、硫胺素和磷酸鹽的溶質(zhì)載體異常以及呼吸鏈缺陷等。mtDNA突變可導(dǎo)致結(jié)構(gòu)蛋白缺陷,、線粒體RNA合成缺陷和呼吸鏈缺陷【Science 349, 1494–1499 (2015),;J. Neuromuscul. Dis. 1, 119–133 (2014)】。CoQ,,輔酶Q10,;dNTP,脫氧核苷酸三磷酸,;Fe–S,,鐵-硫。

知識框2:線粒體疾病中的核基因缺陷及其功能

磷脂代謝

AGK,、SERAC1和TAZ

毒性化合物的代謝

HIBCH,、ECHS1、ETHE1和MPV17

二硫化物中繼系統(tǒng)/ Disulfide relay system

GFER

鐵-硫蛋白復(fù)合體

ISCU,、BOLA3,、NFU1和IBA57

tRNA修飾

MTO1,、GTP3BP、TRMU,、PUS1,、MTFMT、TRIT1,、TRNT1和TRMT5

氨?;?tRNA合成酶

AARS2、DARS2,、EARS2,、RARS2、YARS2,、FARS2,、HARS2、LARS2,、VARS2,、TARS2、IARS2,、CARS2,、PARS2、NARS2,、KARS,、GARS、SARS2和MARS2

釋放因子

C12orf65

伸長因子

TUFM,、TSFM和GFM1

有絲分裂核糖體蛋白

MRPS16,、MRPS22、MRP 13,、MRP12和MRPL44

mRNA加工

LRPPRC,、TACO1、ELAC2,、PNPT1,、HSD17B10、MTPAP和PTCD1

線粒體融合與分裂

OPA1和MFN2

脫氧核苷酸三磷酸合成

DGUOK,、TK2,、TYMP、MGME1,、SUCLG1,、SUCLA2、RNASEH1,、C10orf2,、POLG,、POLG2,、DNA2和RRM2B

硫胺素和磷酸鹽的溶質(zhì)載體

SLC19A3,、SLC25A3和SLC25A19

呼吸鏈亞單位
  • 復(fù)合物I: NDUFS1、NDUFS2,、NDUFS3,、NDUFS4、NDUFS6,、NDUFS7,、NDUFS8、NDUFV1,、NDUFV2,、NDUFA1、NDUFA2,、NDUFA9,、NDUFA10、NDUFA11,、NDUFA12,、NDUFA13、NDUFAF2,、NDUFAF6 和NDUFB11
  • 復(fù)合物II:SDHA,、SDHB、SDHC,、SDHD和SDHAF1
  • 復(fù)合物III: UQCRB,、BCS1L、UQCRQ,、UQCRC2,、CYC1、TTC19,、LYRM7,、UQCC2和UQCC3
  • 復(fù)合物IV: COA5,SURF1,,COX10,,COX14,COX15,,COX20,,COX6B1,F(xiàn)ASTKD2,,SCO1,,SCO2,,LRPPRC,TACO1和PET100
  • 復(fù)合物V:ATP F2,、TMEM70,、ATP5E和ATP5A1
  • 輔酶Q10缺乏:PDSS1、PDSS2,、COQ2,、COQ4、COQ6,、COQ8A,、COQ8B和COQ9(繼發(fā)性缺陷:ETFDH和APTX)
蛋白質(zhì)質(zhì)量控制和降解

FBXL4、AFG3L2和SPG7

ATP和ADP轉(zhuǎn)運
ANT1

nDNA

超過1500個不同的核基因編碼線粒體蛋白【Hum. Genet. 11, 25–44 (2010)】,,它們不僅參與氧化磷酸化,,還參與線粒體的許多其他功能。這些基因中越來越多的突變已被證明會引起線粒體疾病(知識框 2,;圖3),,并且可以具有常染色體顯性、常染色體隱性或X連鎖遺傳模式【N. Engl. J. Med. 366, 1132–1141 (2012)】,。這些孟德爾疾病雖然復(fù)雜,,但可根據(jù)線粒體和細胞功能的損傷簡化分類。nDNA突變影響線粒體的病理后果多種多樣,,包括mtDNA維持缺陷,、mtDNA翻譯缺陷和線粒體穩(wěn)態(tài)缺陷等。mtDNA維持缺陷是由于編碼參與mtDNA復(fù)制的蛋白質(zhì)的基因突變和控制復(fù)制的蛋白質(zhì)突變或脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)合成和/或挽救導(dǎo)致的,,這兩種情況都會導(dǎo)致繼發(fā)性mtDNA異常,,表現(xiàn)為mtDNA拷貝數(shù)丟失或多個mtDNA缺失。線粒體功能缺陷也可能是由于mtDNA翻譯改變所致,,這可能是由編碼翻譯和釋放因子蛋白,、線粒體tRNA修飾蛋白、線粒體mRNA加工酶,、線粒體氨?;?tRNA合成酶和有絲分裂核糖體蛋白的基因突變引起的。由nDNA突變引起的線粒體功能缺陷的其他原因包括細胞凋亡,、線粒體伴侶和線粒體代謝等【Chinnery, P. F. Mitochondrial disorders overview. GeneReviews https://www.ncbi.nlm./books/NBK1224/】圖3),。不可避免的是,mtDNA依賴于大量的核編碼蛋白進行復(fù)制和修復(fù)【Nat. Genet. 45, 214–219 (2013),;Mol. Cell 32, 325–336 (2008),;Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 13, 659–671 (2012).】知識框 2)。由于這些基因突變導(dǎo)致的mtDNA復(fù)制或修復(fù)的中斷可以定性地表現(xiàn)為在患者壽命期間可能出現(xiàn)的多點突變或大規(guī)模mtDNA缺失的產(chǎn)生【Hum. Mol. Genet. 16, 1400–1411 (2007)】,或定量地通過線粒體基因組的接近完全的缺失(稱為mtDNA耗竭)【Am. J. Hum. Genet. 48, 492–501 (1991)】,,或兩者都有【J. Clin. Invest. 111, 1913–1921 (2003)】,。編碼在必需線粒體過程中起作用的蛋白質(zhì)的nDNA突變被認為表現(xiàn)為與mtDNA相關(guān)線粒體障礙類似的多種臨床綜合征【Science 349, 1494–1499 (2015)】

全文約10000字

陳康 2023-04



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