之前的幾期課堂講座給大家分享了ELISA實(shí)驗(yàn)的原理,,操作步驟以及實(shí)驗(yàn)中的常見問題(感興趣的小伙伴可以去視頻專區(qū)收看),近期又收到部分小伙伴的反饋問題,,主要集中在數(shù)據(jù)處理上,。小編看了也覺得比較可惜,整個ELISA實(shí)驗(yàn)做得不錯,,可惜在最后的數(shù)據(jù)處理上犯了錯誤,,直接導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果出了大問題,可謂功虧一簣,。接下跟著小編進(jìn)行一次實(shí)戰(zhàn)案例的分析,,詳細(xì)了解一下愛必信ELISA試劑盒的數(shù)據(jù)處理過程吧~
圖一. 客戶提供原始OD值圖(涉及未發(fā)表數(shù)據(jù),,部分隱去,,部分略作處理) 圖二. 客戶處理的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖 客戶反饋,部分?jǐn)?shù)據(jù)OD出現(xiàn)負(fù)值,,無法處理,,覺得試劑盒有問題。小編接到這個case之后,,簡單的看了一下客戶的數(shù)據(jù),,就發(fā)現(xiàn)幾個明顯的數(shù)據(jù)處理問題,而根據(jù)客戶的原始OD數(shù)據(jù),,初步判斷,,試劑盒是正常的,并且實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)還比較可靠,。不知道是否有聰明的小伙伴已經(jīng)從這個數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了問題呢,?沒關(guān)系,跟著小編一起來抽絲剝繭的詳細(xì)分析一下吧~ 1. OD值出現(xiàn)負(fù)值 大量樣品孔的讀值為負(fù)數(shù),,但接近零點(diǎn),,小編看了一下客戶標(biāo)曲的0點(diǎn)OD值接近0,,初步判斷客戶是用空白孔進(jìn)行校準(zhǔn),但空白孔由于操作污染等原因,,OD值偏高,,進(jìn)而導(dǎo)致樣品孔OD值為負(fù)。跟客戶溝通之后,,確實(shí)是進(jìn)行了空白孔校準(zhǔn),。 溝通之后,確認(rèn)原始空白孔讀值為0.0962,,明顯偏高,,正常OD450的空白孔讀值應(yīng)為0.06左右。 在這里,,小編建議有條件的小伙伴,,盡量要用我們推薦的雙波長校正法,使用570或630nm波長進(jìn)行校正,,OD450
- OD570/630即為校正后的OD值,,可直接用于計(jì)算,也可根據(jù)數(shù)據(jù)質(zhì)量,,再進(jìn)行空白校正,。如沒有雙波長的酶標(biāo)儀,讀取OD450數(shù)據(jù)后,,應(yīng)先判斷數(shù)據(jù)質(zhì)量,,再進(jìn)行空白校正。 小編將空白校正進(jìn)行補(bǔ)回,,得到的OD450原始數(shù)據(jù)如下:至此,,樣品孔數(shù)據(jù)出現(xiàn)負(fù)值這一問題解決。 圖三. 經(jīng)還原處理的OD450原始數(shù)據(jù)圖
處理完了負(fù)值問題,,還有一個很明顯的問題就是,,客戶的標(biāo)曲擬合問題。我們這款試劑盒(Mouse TNF alpha ELISA Kit,,abs520010)標(biāo)曲最高點(diǎn)是2000 pg/ml,,客戶給我的截圖(圖二)只到250 pg/ml,再仔細(xì)研究一下,,發(fā)現(xiàn)客戶的擬合方式用的竟然是直線擬合,。跟客戶溝通之后,確認(rèn)原因,,客戶選擇直線擬合,,高點(diǎn)不符合擬合方式,R2值過低,,所以客戶自己把上面高濃度的點(diǎn)去掉了,,只選取到250 pg/ml,,進(jìn)行直線擬合。在這里,,小編強(qiáng)調(diào)一下,, 愛必信ELISA試劑盒推薦擬合方式為四參數(shù)擬合,,四參數(shù)擬合,,四參數(shù)擬合,重要的事情說三遍,。不要再用其他稀奇古怪的擬合方式進(jìn)行擬合啦,。就像這個客戶犯的錯誤,雖然看似250 pg/ml以下的點(diǎn)可以用直線擬合,,但是表達(dá)含量較高的樣品,,OD值高時,就不符合他擬合的這條直線了,,會導(dǎo)致結(jié)果出現(xiàn)嚴(yán)重偏差,。由于0孔出現(xiàn)問題,小編在擬合標(biāo)曲時,,將OD值最低的孔作為空白孔,,TNF-α在正常樣品中表達(dá)含量極低,可視為0,,擬合曲線如下: 圖四. 四參數(shù)擬合的曲線圖及方程 回歸計(jì)算之后得到樣品濃度,,部分無法計(jì)算出的樣品孔,表達(dá)含量低于0點(diǎn),,按0計(jì)算即可,。 |
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