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設(shè)計新一代的細(xì)胞療法

 小藥說藥 2022-06-08 發(fā)布于浙江
前言

以細(xì)胞為基礎(chǔ)的治療,,包括將細(xì)胞作為活性藥物來治療疾病,,近年來在臨床應(yīng)用和醫(yī)藥市場的擴(kuò)張方面都經(jīng)歷了爆炸性增長。特別是,,一些療法已經(jīng)進(jìn)入了商業(yè)應(yīng)用,,2017年FDA批準(zhǔn)tisagenlecleucel和Axicabatagene ciloleucel分別用于治療急性淋巴細(xì)胞白血?。?/span>ALL)和大B細(xì)胞淋巴瘤(LBCL)。最近的其他成功包括批準(zhǔn)使用患者來源的角膜緣干細(xì)胞修復(fù)受損的角膜上皮,以及使用成人干細(xì)胞治療與克羅恩病相關(guān)的瘺管,。目前,臨床試驗數(shù)量不斷擴(kuò)大,,商業(yè)上批準(zhǔn)的治療方法也越來越多,。

然而,盡管最近取得了顯著的臨床和商業(yè)成功,,但基于細(xì)胞的療法仍然面臨著許多挑戰(zhàn),,限制其廣泛轉(zhuǎn)化和商業(yè)化。這些挑戰(zhàn)包括確定適當(dāng)?shù)募?xì)胞來源,,生產(chǎn)出足夠可行,、有效和安全的產(chǎn)品,以滿足患者和疾病的特定需求,,以及可擴(kuò)展制造流程的開發(fā),。面對這些障礙,科學(xué)家們正在通過使用由新一代工程學(xué)方法,,包括基因組和表觀基因組編輯,、合成生物學(xué)以及生物材料的應(yīng)用,以驅(qū)動前沿基礎(chǔ)研究加以解決,。

細(xì)胞療法的優(yōu)勢和挑戰(zhàn)

人們對于細(xì)胞治療的持續(xù)熱情很大程度上源于重新賦予固有細(xì)胞功能的前景,,以實現(xiàn)超越其他治療模式的安全性和有效性。相比而言,,盡管生物制劑(包括重組蛋白和其他細(xì)胞衍生生物分子)可以利用大分子的識別能力來實現(xiàn)高度的靶向特異性,,但它們?nèi)菀桩a(chǎn)生不利的藥代動力學(xué)(PK)和藥效學(xué)(PD)特性,從而限制其安全性和有效性,。

細(xì)胞療法具有獨(dú)特的內(nèi)在特征,,有可能提高對疾病的療效。例如,,細(xì)胞可以在特定組織或器官中自然遷移,、定位甚至增殖,。此外,細(xì)胞可以主動感知來自小分子,、細(xì)胞表面標(biāo)記蛋白甚至物理力的各種外部信息,。因此,基于細(xì)胞的療法具有高度復(fù)雜的感知和反應(yīng)功能,,可以通過檢測相關(guān)的分子線索和提供包括激活內(nèi)在反應(yīng)或治療性轉(zhuǎn)基因表達(dá)在內(nèi)的多因素輸出反應(yīng)來動態(tài)跟蹤疾病狀態(tài),。最后,由于細(xì)胞能夠在體內(nèi)存活,、消耗營養(yǎng)物質(zhì)并通過分泌因子的產(chǎn)生影響其外部環(huán)境,,因此基于細(xì)胞的治療可用于維持長期的內(nèi)源性藥物輸送。

盡管針對各種適應(yīng)癥的細(xì)胞治療正在取得進(jìn)展,,但開發(fā)新產(chǎn)品仍然是一項艱巨的任務(wù),,因為針對特定疾病的治療策略必須克服一系列重大挑戰(zhàn),才能成功生產(chǎn)出具有臨床和商業(yè)可行性的產(chǎn)品,。

這些挑戰(zhàn)包括:

  • 需要確定細(xì)胞來源,,以產(chǎn)生具有穩(wěn)健和穩(wěn)定特性的產(chǎn)品,并且出于工程目的,,易于進(jìn)行基因操作,。

  • 基于細(xì)胞的產(chǎn)品需要具有足夠的活力,以確保足夠的治療作用持續(xù)時間,。

  • 必須通過改變現(xiàn)有的細(xì)胞特性或設(shè)計新的特性來實現(xiàn)可預(yù)測和確定的治療效力水平,。

  • 細(xì)胞的PK/PD特性必須與疾病的特定生理需要相匹配。

  • 必須確保細(xì)胞治療產(chǎn)品的安全性和致瘤性,,以限制宿主免疫系統(tǒng)的不良反應(yīng)并防止腫瘤形成,。

  • 必須開發(fā)可擴(kuò)展的制造工藝,以高效且經(jīng)濟(jì)的方式生產(chǎn)出足夠數(shù)量的細(xì)胞,,供給藥患者使用,。

細(xì)胞治療的過去和現(xiàn)在

以細(xì)胞為基礎(chǔ)的人類療法最早開始于20世紀(jì)50年代的骨髓移植形式,用于血源性癌癥患者,。這些治療的成功,,是細(xì)胞治療疾病潛力的證據(jù),為近幾十年來以臍帶血來源的HSC和造血祖細(xì)胞(HPC)為來源的治療批準(zhǔn)鋪平了道路,。這些產(chǎn)品在臨床上廣泛使用,,包括迄今為止FDA批準(zhǔn)的多種基于細(xì)胞的療法。

但是,,這些治療方法在商業(yè)化轉(zhuǎn)化方面遇到了巨大障礙,,包括確定易于采購和制造的細(xì)胞來源,以及解決它們與宿主免疫系統(tǒng)的相互作用,。這些挑戰(zhàn)對安全性和有效性構(gòu)成了持久的障礙,,導(dǎo)致在過去十年之前,,只有少數(shù)基于細(xì)胞的新療法獲得批準(zhǔn)進(jìn)入市場,。

第一個突破性的非HPC產(chǎn)品是前列腺癌治療,,從患者身上分離的樹突狀細(xì)胞在體外暴露于重組腫瘤抗原,然后重新引入以促進(jìn)T細(xì)胞介導(dǎo)的抗腫瘤反應(yīng),。這種sipuleucel-T療法在2010年獲得FDA批準(zhǔn)時被吹捧為世界上第一種“個性化”癌癥療法,,但由于療效不一致和報銷不確定,使其使用受到限制,,這是制造過程的高成本和技術(shù)復(fù)雜性導(dǎo)致的后果,。其他早期進(jìn)入市場的藥物包括使用患者和供體來源的成纖維細(xì)胞局部治療組織損傷,以及使用患者來源的軟骨細(xì)胞修復(fù)關(guān)節(jié)軟骨,。

在FDA對第一個CAR-T療法的監(jiān)管批準(zhǔn)后,,過去十年中,細(xì)胞療法的商業(yè)化進(jìn)展顯著加快,。目前,,已有5個針對難治性多發(fā)性骨髓瘤,以及ALL和LBCL的的CAR-T產(chǎn)品獲批上市,。更多的使用各種效應(yīng)細(xì)胞,,例如NK細(xì)胞,正在進(jìn)行多種固體和血液腫瘤的臨床試驗,,其中一些報告了突破性的成功,。

除了癌癥療法繼續(xù)獲得最多的關(guān)注,幾個新興領(lǐng)域的臨床成功也引起了人們的興趣,。這些包括自身免疫疾病,、中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)和神經(jīng)退行性疾病、心血管疾病和各種孤兒病的治療,。其中一些療法是利用間充質(zhì)干細(xì)胞(MSCs)開發(fā)的,,治療克羅恩病相關(guān)瘺管的darvadstrocel,是少數(shù)商業(yè)化MSC產(chǎn)品之一,。另一種著名的產(chǎn)品是remestemcel-L,,它使用供體來源的、培養(yǎng)擴(kuò)增的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞治療GvHD,。

目前,,越來越多的療法正在通過臨床試驗取得進(jìn)展,這些療法使用來自多能干細(xì)胞的細(xì)胞產(chǎn)品,。來自誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(IPSC)的視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞被用于治療急性黃斑變性和Stargardt病,。中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病是此類療法的另一個活躍領(lǐng)域,有幾個研究正在使用IPSC生成多巴胺能神經(jīng)元以用于帕金森病,,還有一些基于干細(xì)胞的方法正在進(jìn)行中風(fēng),、癲癇,、脊髓損傷、阿爾茨海默病,、多發(fā)性硬化和疼痛的臨床前研究,。

細(xì)胞工程學(xué)創(chuàng)新

目前,人們正在探索細(xì)胞工程學(xué)科的創(chuàng)新,,包括基因組和表觀基因組編輯,、合成生物學(xué)以及生物材料,以應(yīng)對細(xì)胞治療的重大挑戰(zhàn),。其中一些方法已成功用于生產(chǎn)商業(yè)化產(chǎn)品,,但許多方法仍處于臨床前階段。

基因組和表觀基因組編輯

CRISPR/CAS9作為可編程工具在活細(xì)胞中設(shè)計人類基因組和表觀基因組,,推動了細(xì)胞治療學(xué)的最新進(jìn)展,。Cas9介導(dǎo)的非同源末端連接(NHEJ)已被用于沉默致病位點(diǎn)、去除有害插入物和賦予對病毒的抗性,。

除了Cas9介導(dǎo)的NHEJ靶向單個基因座,,同時靶向多個基因座的復(fù)合方法近年來也取得了實質(zhì)性進(jìn)展。例如,,利用同時靶向T細(xì)胞受體(TCR),、β2-微球蛋白(β2m)和PD-1基因的Cas9 mRNA和gRNAs進(jìn)行基于CRISPR–Cas9的多重基因組編輯,已與慢病毒載體CAR結(jié)合使用,,以生成缺乏TCR,、HLA I類分子和PD1的異基因CAR-T細(xì)胞,這為通用CAR-T細(xì)胞的研究打開了大門,。重要的是,,這些類型的組合策略對于解決細(xì)胞治療面臨的一些重大挑戰(zhàn)至關(guān)重要,尤其是通過降低自體細(xì)胞源的免疫原性和增強(qiáng)工程細(xì)胞的活性,,從而提高患者的安全性和治療效力,。

除了正在進(jìn)行的臨床試驗和創(chuàng)建新的CAR平臺之外,基因組編輯在開發(fā)用于治療的“現(xiàn)成”工程細(xì)胞方面也發(fā)揮了重要作用,。例如,,經(jīng)過編輯以去除CD7和TRAC的人類T細(xì)胞顯示出對抗T細(xì)胞急性淋巴細(xì)胞白血病(T-ALL)的效力,,而沒有異種GvHD的證據(jù),。在細(xì)胞分化之前進(jìn)行基因組編輯是另一種選擇,例如,,破壞IPSC中的HLA基因已被證明是增強(qiáng)免疫兼容性的有效方法,,敲除B2M并同時過表達(dá)CD47的類似策略也產(chǎn)生了免疫原性顯著降低的IPSC 。基于人類iPSC的現(xiàn)成療法正在取得快速進(jìn)展,,實體瘤和晚期血液惡性腫瘤的臨床試驗正在進(jìn)行中(NCT03841110和NCT04023071),。在臨床環(huán)境中使用基因組編輯的這些令人興奮的進(jìn)展已擴(kuò)展到許多嚴(yán)重適應(yīng)癥,包括細(xì)菌感染(NCT04191148),、β-地中海貧血和鐮狀細(xì)胞?。?/span>NCT03655678;EDIT-301),、B型血友?。?/span>NCT02695160)和II型粘多糖病II(NCT03041324)。

此外,,基于CRISPR/CAS9的表觀基因組編輯工具已用于模擬基因表達(dá)和表觀基因組失調(diào)的幾種人類疾病和疾病治療。最近值得注意的例子包括神經(jīng)肌肉組織和酶紊亂,,以及腎病和糖尿病,。隨著這些精確編程人類基因表達(dá)和人類表觀基因組的新技術(shù)不斷涌現(xiàn)和成熟,當(dāng)最先進(jìn)的基于細(xì)胞的療法和常規(guī)基因組編輯相結(jié)合時,,它們無疑將成為下一代細(xì)胞藥物的組成部分,。

合成生物學(xué)

過去二十年來,合成生物學(xué)領(lǐng)域不斷涌現(xiàn),,其目標(biāo)是通過應(yīng)用定量設(shè)計規(guī)則,,使基因工程結(jié)果更加精確、可預(yù)測和可重復(fù),。盡管它在微生物系統(tǒng)方面取得了最早的突破,,但近年來該領(lǐng)域在人類細(xì)胞工程方面也取得了重大進(jìn)展。通過精確控制治療性轉(zhuǎn)基因表達(dá)或分泌治療因子的傳遞,,或通過編程細(xì)胞來感知與特定組織或疾病狀態(tài)相關(guān)的生物分子,,并通過改變細(xì)胞行為作出反應(yīng),可以增強(qiáng)基于細(xì)胞的治療,。

最近利用合成生物學(xué)解決過繼性T細(xì)胞治療中的特異性和活性的成功證明了這一系列方法,。在這一領(lǐng)域最成功的應(yīng)用之一是一種蛋白質(zhì)安全殺傷開關(guān),該開關(guān)被設(shè)計用于引起植入細(xì)胞的凋亡,。該開關(guān)的嵌合設(shè)計以人caspase9與修飾的人FK結(jié)合域融合為特征,,能夠在施用小分子藥物AP1903后二聚并激活凋亡信號。雖然最初開發(fā)該開關(guān)是為了在干細(xì)胞移植過程中消除同種異體反應(yīng)性T細(xì)胞,,但隨后其被用于CAR-T治療的臨床試驗,,以限制CRS中效應(yīng)器的增殖(NCT03696784)。

CAR-T合成生物學(xué)最近的一個重要焦點(diǎn)是制定策略以增強(qiáng)腫瘤靶向特異性,。一個例子是受體介導(dǎo)的基因調(diào)節(jié)回路設(shè)計,,其中融合單鏈抗體的工程化嵌合Notch受體在與相鄰細(xì)胞表面的配體結(jié)合時被觸發(fā),導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄激活劑的蛋白水解釋放和轉(zhuǎn)基因表達(dá),。該系統(tǒng)最初被設(shè)計為在第二個配體存在下表達(dá)CAR,,從而實現(xiàn)抗原結(jié)合的雙特異性識別,。synNotch的進(jìn)一步發(fā)展,有可能區(qū)分特定腫瘤和旁觀者組織,。

合成生物學(xué)的另一個主要重點(diǎn)是開發(fā)閉環(huán)調(diào)節(jié)回路,,用于監(jiān)測生理或疾病狀態(tài)特征,并對治療結(jié)果作出反應(yīng),。利用轉(zhuǎn)基因報告來改變天然信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的策略已經(jīng)得到利用,。一個例子是兩階段細(xì)胞因子轉(zhuǎn)換回路,該回路在第一階段將TNF-α依賴性NF-κB信號轉(zhuǎn)換為IL-22生成,,然后激活細(xì)胞因子受體并通過STAT3發(fā)出信號,,驅(qū)動抗炎細(xì)胞因子IL-10和IL-4的轉(zhuǎn)錄生成和分泌。在小鼠體內(nèi)試驗中,,含有該回路的細(xì)胞可以減輕小鼠銀屑病模型中的炎癥,。類似地,人們構(gòu)建了β-細(xì)胞模擬細(xì)胞,,該細(xì)胞引入一個回路,,通過將糖酵解介導(dǎo)的鈣離子進(jìn)入與驅(qū)動胰島素表達(dá)和分泌的轉(zhuǎn)錄回路的誘導(dǎo)相聯(lián)系來感知葡萄糖。當(dāng)植入糖尿病小鼠模型時,,工程細(xì)胞以葡萄糖反應(yīng)的方式分泌胰島素,,從而糾正胰島素缺乏,并降低高血糖,。

生物材料

半透性生物材料和水凝膠已用于改善治療細(xì)胞的傳遞,、活性、保留和安全性,。從可降解水凝膠到不可降解塑料和金屬等,,人們探索了一系列生物材料,以改善輸送和活性,,促進(jìn)細(xì)胞在特定體腔內(nèi)的保留,,促進(jìn)控釋,并實現(xiàn)可回收性以提高安全性,。

細(xì)胞治療中同種異體細(xì)胞的排斥反應(yīng),,限制了現(xiàn)成的細(xì)胞治療產(chǎn)品的開發(fā)。然而,,介導(dǎo)同種異體細(xì)胞排斥反應(yīng)的免疫機(jī)制需要細(xì)胞-細(xì)胞接觸,。目前,人們在積極探索一種策略,,即在半多孔膜中使用同種異體細(xì)胞的細(xì)胞封裝來實現(xiàn)免疫隔離,。這些努力的目標(biāo)是將移植細(xì)胞從患者自身的免疫系統(tǒng)中隔離,同時允許可溶性因子的雙向運(yùn)輸,保證葡萄糖和氧氣等營養(yǎng)物質(zhì)的流入,,以支持移植細(xì)胞的長期存活,,以及產(chǎn)生的治療性蛋白質(zhì)的輸出。通過使用海藻酸鈉水凝膠促進(jìn)大鼠胰島的免疫隔離,,首次證明了在動物中的可行性,。這項研究表明,短期(數(shù)周)移植的同種異體細(xì)胞在免疫活性動物中具有功能,。近年來,,許多膠囊化細(xì)胞產(chǎn)品已在臨床上進(jìn)行了廣泛的細(xì)胞治療應(yīng)用評估,包括眼科學(xué),、內(nèi)分泌學(xué),、腫瘤學(xué)和神經(jīng)病學(xué)。

小結(jié)

縱觀細(xì)胞治療研究的最新進(jìn)展,,很明顯,,基因組和表觀基因組編輯、合成生物學(xué)以及生物材料介導(dǎo)的免疫調(diào)節(jié),,將在創(chuàng)建新細(xì)胞治療產(chǎn)品管線方面發(fā)揮越來越大的作用,從而提高患者的安全性,、有效性和可及性,。最近的科學(xué)進(jìn)步不僅證明了這些領(lǐng)域開發(fā)的技術(shù)的潛在影響,而且還確定了克服目前限制細(xì)胞療法更廣泛商業(yè)化的重大挑戰(zhàn)的潛在途徑,。因此,,技術(shù)創(chuàng)新是未來影響細(xì)胞治療產(chǎn)品進(jìn)步的關(guān)鍵,這些創(chuàng)新使得更容易采購和制造的同種異體產(chǎn)品具有更大的效力和生存能力,。

參考文獻(xiàn):

1Engineering the next generation of cell-based therapeutics. Nat Rev Drug Discov.2022 May 30 : 1–21.

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