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Nature Neurosci綜述:MIT馮國(guó)平教授“重新定義”丘腦的功能單位,提出兩個(gè)關(guān)鍵概念

 brainnews 2022-04-19

丘腦參與了包括感覺處理,、注意力,、決策和記憶在內(nèi)的多種腦功能。傳統(tǒng)上,,我們認(rèn)為丘腦不同的核團(tuán)組織決定了其功能多樣性,。近來,麻省理工學(xué)院馮國(guó)平教授研究團(tuán)隊(duì)于2022年2月在Nature Neuroscience發(fā)表綜述文章,,使用先進(jìn)的表達(dá)譜研究揭示了丘腦核團(tuán)內(nèi)和跨核團(tuán)的單細(xì)胞水平基因表達(dá)梯度,,并結(jié)合解剖學(xué)追蹤和生理分析,提出了以前未被認(rèn)知的異質(zhì)性,,提出亞群子網(wǎng)絡(luò)兩個(gè)關(guān)鍵概念,。

馮國(guó)平教授團(tuán)隊(duì)根據(jù)獨(dú)特的輸入-輸出連接模式和基因表達(dá)重新定義了丘腦的功能單位,,并認(rèn)為由遺傳學(xué)、連接性和計(jì)算交叉定義的丘腦子網(wǎng)絡(luò)更適合進(jìn)行功能水平的描述,;適當(dāng)?shù)臄_動(dòng)產(chǎn)生的行為表型也支持子網(wǎng)絡(luò)這一概念,。文章提供了幾個(gè)丘腦子網(wǎng)絡(luò)的例子,并針對(duì)這個(gè)新的視角如何推動(dòng)基礎(chǔ)神經(jīng)科學(xué)進(jìn)步,,揭示具有治療潛力的獨(dú)特靶點(diǎn)提出建議,。

團(tuán)隊(duì)介紹:

通訊作者馮國(guó)平,Ph.D,麻省理工學(xué)院腦與認(rèn)知科學(xué)系麥格文腦研究所神經(jīng)科學(xué)客座教授。致力于了解調(diào)節(jié)大腦中突觸發(fā)育和功能的機(jī)制,,以及突出功能障礙如何導(dǎo)致精神疾病,。其實(shí)驗(yàn)室使用基因動(dòng)物工程模型,將尖端技術(shù)和多學(xué)科方法相結(jié)合,,截至神經(jīng)發(fā)育和精神疾病的神經(jīng)生物學(xué)機(jī)制,。

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嚙齒動(dòng)物中不同的丘腦核團(tuán)

丘腦是哺乳動(dòng)物前腦的中心結(jié)構(gòu),,接受各種皮質(zhì)和皮質(zhì)下結(jié)構(gòu)的輸入,大致可分為背側(cè)和腹側(cè)亞區(qū),。丘腦背側(cè)大多為興奮性神經(jīng)元,主要投射到皮質(zhì),、杏仁核和紋狀體,,而腹側(cè)丘腦不投射到皮層。

傳統(tǒng)上,,丘腦根據(jù)尼氏染色和粗略的輸入-輸出連接模式被劃分為單獨(dú)的核團(tuán),;丘腦背側(cè)約有50個(gè)不同的興奮性核團(tuán),可分為七個(gè)主要分區(qū):前部,、內(nèi)側(cè)部,、外側(cè)部、腹側(cè)部,、板內(nèi)組,、中線組和后部組。高比例的抑制性神經(jīng)元位于丘腦腹側(cè)的丘腦網(wǎng)狀核(TRN)中,。

圖1:嚙齒類動(dòng)物不同的丘腦核團(tuán)


細(xì)胞類型,、亞群和子網(wǎng)絡(luò)

此篇綜述首先明確定義了三個(gè)關(guān)鍵術(shù)語。

1,、“細(xì)胞類型”,,是通過單一方法識(shí)別的特征,在單個(gè)丘腦核團(tuán)中,,根據(jù)形態(tài)學(xué),、神經(jīng)化學(xué)或生理學(xué)來定義的,。例如,形態(tài)學(xué)可以根據(jù)胞體大小和樹突分支模式的不同來識(shí)別神經(jīng)元,,神經(jīng)化學(xué)可以表明細(xì)胞類型是興奮性的還是抑制性的,,生理學(xué)可以利用不同的感覺反應(yīng)模式來識(shí)別神經(jīng)元。

2,、“亞群”,,現(xiàn)代基因圖譜的出現(xiàn)使“亞群”的識(shí)別成為可能:即共享特定模式的細(xì)胞群

3,、“子網(wǎng)絡(luò)”,,將一個(gè)或多個(gè)具有特定功能的亞群定義為“子網(wǎng)絡(luò)”。由于每個(gè)神經(jīng)元或亞群通常具有多個(gè)輸入和輸出,,因此在不同的功能子網(wǎng)絡(luò)中使用相同的亞群很可能是一種常見而有效的功能電路組裝方法,。例如,對(duì)于給定的功能,,亞群A可以與亞群B形成子網(wǎng)絡(luò),,但是與亞群X形成子網(wǎng)絡(luò)以服務(wù)不同的功能。這一定義是前瞻性的,,需要未來的實(shí)驗(yàn)來繼續(xù)驗(yàn)證和完善,。

圖2:從丘腦核團(tuán)到子網(wǎng)絡(luò)

單個(gè)核團(tuán)、細(xì)胞類型,、亞群和子網(wǎng)絡(luò)之間的關(guān)系,。


丘腦神經(jīng)元的抑制性

丘腦神經(jīng)元表現(xiàn)出異質(zhì)性的觀點(diǎn)很早就被認(rèn)識(shí)到了。這種異質(zhì)性可以在形態(tài)學(xué),、輸入和輸出,、生理和神經(jīng)遞質(zhì)定位的水平上觀察到。

3-1 形態(tài)學(xué)

早期高爾基染色根據(jù)細(xì)胞形態(tài)區(qū)分丘腦神經(jīng)元并分為三種類型:

1,、“Buschzell”的大型神經(jīng)元,,它有許多短小的放射狀樹突和大量的棘狀附屬物。

2,、“Strahlenzell”的大型神經(jīng)元呈星狀輻射,,樹突較少,較短,,樹突分支點(diǎn)附近有葡萄狀的特征附屬物,。

3、小中間神經(jīng)元有很少的長(zhǎng)而光滑的樹突和短軸突,。較大的興奮性神經(jīng)元投射到母核外的皮層,,缺乏局部連通性,而較小的中間神經(jīng)元只表現(xiàn)出局部連通性。

隨后的研究顯示,,丘腦神經(jīng)元之間存在進(jìn)一步形態(tài)學(xué)差異以及輸入-輸出模式,、生理和基因表達(dá)變化等。

3-2 生理學(xué)

基于以上發(fā)現(xiàn),,研究人員進(jìn)一步觀察丘腦核的電生理差異,。雖然丘腦主細(xì)胞被認(rèn)為在感覺核中具有相似的內(nèi)在特性,但它們的動(dòng)作電位參數(shù)存在實(shí)質(zhì)性的差異,。來自三個(gè)運(yùn)動(dòng)相關(guān)丘腦核團(tuán)中央內(nèi)側(cè)核團(tuán)(CM),、腹前核團(tuán)(VA)和腹外側(cè)核團(tuán)(VL))的全細(xì)胞記錄顯示,電生理膜和突觸特性沿CM到VA到VL核團(tuán)的梯度變化,。

盡管之前的研究揭示了丘腦神經(jīng)元的電生理異質(zhì)性,,但這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),丘腦核的單細(xì)胞生理特性沿著一個(gè)連續(xù)統(tǒng)存在,,而不是形成獨(dú)特的,、離散的輪廓(圖3b)。然而,,這一觀察結(jié)果的功能意義尚未揭示,。

該研究還將這些生理觀察結(jié)果與分級(jí)轉(zhuǎn)錄譜(圖3c)和形態(tài)學(xué)差異聯(lián)系起來,表明細(xì)胞形態(tài)學(xué),、末端樹枝化,、輸入類型和電生理特性是表征丘腦細(xì)胞多樣性的有效方法。關(guān)于丘腦主要神經(jīng)元的基本內(nèi)在特征,,它們的兩種不同的放電模式強(qiáng)直和爆裂-這些模式中的異質(zhì)性與軀體發(fā)育形態(tài)學(xué)差異存在關(guān)聯(lián),。

圖3:丘腦神經(jīng)元的多樣性

3-3 神經(jīng)遞質(zhì)和受體

神經(jīng)遞質(zhì)及其受體的定位差異提示基因表達(dá)譜的變化可能是丘腦核團(tuán)的一種組織原則。一組鑒定出四個(gè)轉(zhuǎn)錄因子基因,,它們?cè)谂d奮性丘腦核內(nèi)差異表達(dá),。一組不同的基因被鑒定為抑制性丘腦核,。因?yàn)檫@些候選基因可能反映了興奮核或抑制核之間共享的不同亞群,,許多研究小組試圖識(shí)別丘腦核和亞群特異性分子標(biāo)記。

基因表達(dá)的差異導(dǎo)致了丘腦核分類的核心-矩陣?yán)碚?/span>:?jiǎn)蝹€(gè)核中的神經(jīng)元核心以特定區(qū)域的方式投射到皮質(zhì)的中間層,,并有助于基本感覺,,而每個(gè)核中的神經(jīng)元矩陣投射到皮質(zhì)的淺層,覆蓋廣泛區(qū)域,,并參與感官體驗(yàn)不同方面的整合,。丘腦核的這種核心-基質(zhì)分類已被用于了解人類皮質(zhì)中功能連接的整體模式。

最近,,一個(gè)研究小組利用了艾倫大腦研究所的原位雜交數(shù)據(jù)庫(kù),,該數(shù)據(jù)庫(kù)覆蓋了大部分小鼠基因組,并鑒定了丘腦復(fù)合體不同部位表達(dá)的基因,。一組六個(gè)基因可以組合使用來定義大多數(shù)丘腦核,。從概念上講,這項(xiàng)研究表明,,丘腦核可分為九組(圖4),,且不同于經(jīng)典的丘腦核組(圖1)。然而,,在沒有功能數(shù)據(jù)的情況下,目前尚不清楚擬議的丘腦核群是否比經(jīng)典的核群有所改善,。

雖然基因表達(dá)差異顯然有助于確定假定的亞群體,,但馮國(guó)平教授團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,將基因表達(dá)與形態(tài)學(xué),、連接性和生理學(xué)相結(jié)合的綜合方法是確定亞群體和子網(wǎng)絡(luò)的更好策略,。

圖4:六個(gè)基因可以組合使用來定義丘腦核團(tuán)


丘腦神經(jīng)元的單細(xì)胞異質(zhì)性

近來,,高通量scRNA-seq技術(shù)已經(jīng)能夠?qū)?fù)雜組織中的數(shù)萬個(gè)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行RNA分析,。Drop-seq分析了大約89000個(gè)丘腦神經(jīng)元,,主要發(fā)現(xiàn)了兩種細(xì)胞類型:一種表達(dá)Rora(編碼維甲酸相關(guān)孤兒受體-α),另一種表達(dá)Gad2(編碼谷氨酸脫羧酶2),。

根據(jù)艾倫研究所的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)中,Rora在大多數(shù)興奮性丘腦神經(jīng)元中表達(dá),,而Gad2表達(dá)在已知的含有抑制性神經(jīng)元的細(xì)胞核(TRN和LGN)中富集,。這些神經(jīng)元細(xì)胞類型可以進(jìn)一步細(xì)分為11個(gè)假定的亞群(圖5a),這與小鼠丘腦亞群的歷史觀點(diǎn)非常不同。

對(duì)于Rora和Gad2細(xì)胞類型,,基因表達(dá)譜確定了幾個(gè)明顯獨(dú)特的神經(jīng)元亞群。然而,,每種細(xì)胞類型中的大多數(shù)亞群被分組在一起(圖5a),,表明某種程度的共享基因表達(dá),。

基于投影的scRNA-seq根據(jù)皮質(zhì)靶識(shí)別出不同的多核亞群,這些亞群顯示出跨核的基因表達(dá)梯度,,并表明不同丘腦核的邊界包含獨(dú)特的中間亞群,。

雖然這些中間亞群的功能含義尚不清楚,但可能反映了丘腦核團(tuán)及其亞群形成的發(fā)育過程,。從視覺,、軀體感覺和運(yùn)動(dòng)前腦區(qū)域逆行標(biāo)記丘腦核團(tuán)得到五個(gè)主要亞群(圖5B),,且這與經(jīng)典的丘腦核群(圖1)不同,。

這些scRNA-seq方法揭示了基因表達(dá)的梯度,表明這可能是丘腦核的一個(gè)子集的固有特征,,可以用來增強(qiáng)我們對(duì)這種結(jié)構(gòu)中的細(xì)胞類型和亞群的理解,。

圖5:丘腦神經(jīng)元的單細(xì)胞異質(zhì)性


丘腦子網(wǎng)絡(luò)的識(shí)別

歷史主流觀點(diǎn)認(rèn)為每個(gè)核團(tuán)支持特定的功能,。然而,隨著丘腦聯(lián)合核團(tuán)執(zhí)行許多不同功能的證據(jù)逐漸明顯,馮國(guó)平教授團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,,丘腦每個(gè)核團(tuán)可能存在異質(zhì)性,,為不同的功能貢獻(xiàn)提供一個(gè)細(xì)胞水平的框架。

核團(tuán)內(nèi)異質(zhì)性的一個(gè)例子是PVT,。這個(gè)核團(tuán)參與許多不同的功能,。例如,PVT對(duì)恐懼記憶至關(guān)重要,,它調(diào)節(jié)阿片類藥物戒斷誘導(dǎo)的癥狀的表達(dá),,葡萄糖反應(yīng)中PVT神經(jīng)元控制尋找蔗糖的行為,,PVT回路由突顯處理和(或)清醒招募等,。

追蹤研究表明,,前部PVT(aPVT)后部PVT(pPVT)具有不同的輸入-輸出連接性,。具體地說,aPVT和pPVT分別以下緣皮質(zhì)和前緣皮質(zhì)為靶點(diǎn),,它們又分別反過來支配aPVT和pPVT,。這表明這兩個(gè)PVT亞群形成了獨(dú)立的丘腦-皮質(zhì)丘腦環(huán)(圖6a,b)

單細(xì)胞電生理記錄發(fā)現(xiàn)TRN中有兩個(gè)神經(jīng)元亞群:腹側(cè)TRN神經(jīng)元具有典型的爆發(fā)式放電,背側(cè)TRN神經(jīng)元缺乏爆發(fā)式放電,。基于連通性,、電生理學(xué)和對(duì)軀體感覺行為的貢獻(xiàn),已經(jīng)確定了兩個(gè)抑制性TRN子網(wǎng)絡(luò),。

最近,,一項(xiàng)對(duì)小鼠TRN神經(jīng)元的scRNA-seq研究表明,,兩個(gè)負(fù)相關(guān)基因表達(dá)譜的轉(zhuǎn)錄梯度和TRN神經(jīng)元的電生理特性都存在梯度,揭示了基因表達(dá)與生理之間的聯(lián)系,。在這種梯度的兩端的神經(jīng)元表達(dá)相互排斥的標(biāo)記Spp1(編碼分泌的磷蛋白1)和Ecel1(編碼內(nèi)皮素轉(zhuǎn)換酶樣1)(圖6c-e),。這兩個(gè)TRN亞群在調(diào)節(jié)睡眠方面顯示出不同的功能作用,。

研究表明,,集中在核心區(qū)的神經(jīng)元表現(xiàn)出高爆發(fā)放電,,可能與Spp1+亞群有關(guān),而低爆發(fā)放電神經(jīng)元可能對(duì)應(yīng)于Ecel1+亞群,。另一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),,Calbindin(CB)和SST也標(biāo)記了不同的核型和殼型TRN亞群。這些研究表明,,TRN神經(jīng)元表現(xiàn)出基因表達(dá)的梯度,,因此在極端的神經(jīng)元產(chǎn)生不同的核和殼樣子網(wǎng)絡(luò)。

圖6:丘腦中的子網(wǎng)絡(luò)


子網(wǎng)絡(luò)可能是丘腦單個(gè)核團(tuán)的一般特征

TRN和PVT是兩個(gè)具有明顯子網(wǎng)絡(luò)的單個(gè)丘腦核團(tuán)的例子,,也有相當(dāng)多的證據(jù)表明其他丘腦核團(tuán)內(nèi)存在異質(zhì)性,。因?yàn)檫@種異質(zhì)性是構(gòu)成子網(wǎng)絡(luò)的必要構(gòu)件,所以很可能其他單獨(dú)的丘腦核團(tuán)也由多個(gè)子網(wǎng)絡(luò)組成,。

這篇綜述重點(diǎn)介紹了幾個(gè)興奮性核團(tuán)內(nèi)的細(xì)胞和功能多樣性,。以PF為例,PF最為人所知的是它通過投射到背側(cè)紋狀體參與運(yùn)動(dòng)功能,,包括行為靈活性,。一項(xiàng)追蹤研究表明,不同的PF種群分別投射到紋狀體和丘腦底核,,這是PF內(nèi)異質(zhì)性的最早跡象之一,。

最近的一份報(bào)告發(fā)現(xiàn),PF-丘腦下核的投射(而非PF-紋狀體的投射)有助于運(yùn)動(dòng)的啟動(dòng),,這為兩個(gè)亞群在功能上的不同提供了證據(jù),,因此可能形成兩個(gè)不同的子網(wǎng)絡(luò)。

之前的多項(xiàng)研究在形態(tài)學(xué),、電生理特性,、分子、空間位置,、連接性和投射區(qū)域等不同方面表明PF包含離散的亞群,,從內(nèi)側(cè)PF到外側(cè)PF的生理特性沿著梯度變化,類似于基于投射的丘腦scRNA-seq研究中確定的生理梯度,。

它們的大腦皮層投射也不同,。在前扣帶回和島葉皮質(zhì)的下緣下部、腹側(cè)部可見內(nèi)側(cè)PF軸突,。中央PF投射到與內(nèi)側(cè)PF相同的區(qū)域,,但也投射到運(yùn)動(dòng)和味覺皮質(zhì),而外側(cè)PF投射到軀體感覺和味覺皮質(zhì),。

由于這些投射模式實(shí)驗(yàn)沒有使用遺傳學(xué)方法來靶向TNC+中央PF或SPON1+外側(cè)PF亞群,,因此這篇綜述提出,,未來的工作必須弄清楚中央和外側(cè)PF的投射是否分別與TNC+和SPON1+PF神經(jīng)元的投射緊密匹配。 

此外,,它們的輸入也不同,,PFC軸突優(yōu)先定位于內(nèi)側(cè)PF,運(yùn)動(dòng)皮質(zhì)軸突定位于中央PF,,軀體感覺軸突定位于外側(cè)PF,。這些發(fā)現(xiàn)表明,前額葉是異質(zhì)性的,,包含亞群(包括一個(gè)新的“中央前額葉”亞群),,這些亞群被組織成平行和獨(dú)立的聯(lián)合、邊緣和軀體感覺回路(圖7),。

在運(yùn)動(dòng)行為中操縱這三個(gè)不同的PF亞群,,特別是中央PF神經(jīng)元,將有助于識(shí)別潛在的功能差異,,并且確定這些差異如何映射到內(nèi)側(cè)軸將是有趣的,。這種功能數(shù)據(jù)是將這三個(gè)不同的PF亞群鏈接到一個(gè)或多個(gè)子網(wǎng)絡(luò)所必需的。目前,,尚不清楚這三個(gè)遺傳上可識(shí)別的PF亞群與先前基于形態(tài)學(xué)和/或電生理學(xué)對(duì)PF細(xì)胞多樣性的描述的對(duì)應(yīng)關(guān)系,。

圖7:從scRNa-seq到三個(gè)不同的PF亞群


未來方向

現(xiàn)代單細(xì)胞圖譜顯示丘腦神經(jīng)元表現(xiàn)出基因表達(dá)梯度,這為鑒定新的亞群鋪平了道路,。雖然現(xiàn)有研究才剛剛開始將不同的丘腦亞群與功能聯(lián)系起來,,但這樣的研究已經(jīng)加強(qiáng)了我們對(duì)丘腦回路如何控制廣泛的皮質(zhì)過程以及許多其他功能的理解。有趣的是,,遺傳梯度似乎是哺乳動(dòng)物大腦中的一個(gè)共同特征,,正如最近對(duì)海馬體和杏仁核神經(jīng)元的轉(zhuǎn)錄圖譜所證明的那樣。

基因表達(dá)梯度將為編碼來自外部世界的信息提供更大的動(dòng)態(tài)范圍,,而外部世界本身在本質(zhì)上是連續(xù)的,。在生命早期,這些梯度可能允許不同的核根據(jù)它們的連通性和功能貢獻(xiàn)發(fā)展一個(gè)或多個(gè)子網(wǎng)絡(luò),。此外,,由于大腦皮質(zhì)由基因表達(dá)梯度組成,因此丘腦輸入有可能表現(xiàn)出梯度,,從而與不同的皮質(zhì)亞群形成丘腦皮質(zhì)環(huán)路,。

令人興奮的未來研究方向包括調(diào)查這些丘腦亞群的發(fā)育,這些細(xì)胞變異的梯度是否在發(fā)育過程中或在行為訓(xùn)練之后表現(xiàn)出活動(dòng)依賴的變化,,以及這些亞網(wǎng)絡(luò)是否會(huì)因疾病狀態(tài)而改變,。在丘腦疾病模型中應(yīng)用特定于網(wǎng)絡(luò)的操控可以促進(jìn)新的治療策略的發(fā)展。


參考文獻(xiàn)

Roy, D.S., Zhang, Y., Halassa, M.M. et al. Thalamic subnetworks as units of function. Nat Neurosci 25, 140–153 (2022). https:///10.1038/s41593-021-00996-1

編譯作者:Zouki(brainnews創(chuàng)作團(tuán)隊(duì))

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