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如何了解一個基因的功能

 醫(yī)學數(shù)據(jù)庫百科 2021-07-28

我們研究一個基因的時候,,首先還是要知道這個基因的功能的。之前介紹很多數(shù)據(jù)庫都可以用來查詢基因的功能,。比如最經(jīng)典的genecards數(shù)據(jù)庫介紹或者ncbi-gene數(shù)據(jù)庫介紹在這兩個基因綜合信息查詢數(shù)據(jù)庫當中,,我們可以了解目標基因的綜合的功能。

一般來說一個基因的功能和這個基因所在的通路有關(guān),。因此基于通路數(shù)據(jù)庫來查詢基因的功能也是可以的,。而 KOBAS (http:///kobas/)是一個可以通過輸入目標基因在相對應(yīng)的通路數(shù)據(jù)庫當中進行分析的工具。

另外需要注意的是KOBAS一個支持可以多物種多輸入選項的工具,。所以如果是研究其他物種的也是可以使用的哈,。

基因功能預測

Annotation當中,我們可以輸入想要分析的基因即可,。

在經(jīng)過簡單的等待之后,,就可以獲得輸入基因在通路等富集數(shù)據(jù)庫當中的功能介紹。

富集分析

當然除了基因注釋的功能,。這個數(shù)據(jù)庫還可以進行基因的富集分析和富集分析的可視化,。當然這些功能的我們之前介紹的富集分析功能當中也都要類似的功能的。這里就不做具體的介紹了,。

其他可能想要了解的富集分析工具

WebSestalt-富集分析軟件

CPA-多種算法富集分析數(shù)據(jù)庫

gprofiler-多ID富集分析

SIGNAL-通路與PPI聯(lián)合分析數(shù)據(jù)庫

GeneTrail-多組學數(shù)據(jù)富集分析數(shù)據(jù)庫

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