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冷凍電鏡助力破譯大腦的分子密碼

 昵稱535749 2020-11-29

中科院之聲

中國(guó)科學(xué)院官方賬號(hào)~11-27 20:21

大腦中有上千億個(gè)神經(jīng)細(xì)胞,,又叫神經(jīng)元,它們之間通過(guò)百萬(wàn)億個(gè)突觸聯(lián)結(jié)形成復(fù)雜有序的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)與環(huán)路,。神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中高度有序的神經(jīng)活動(dòng)則構(gòu)成了認(rèn)知,、思維、意識(shí)和語(yǔ)言等高級(jí)腦功能的基礎(chǔ),。就像通訊系統(tǒng)中,信息的收發(fā)和存儲(chǔ)依賴于通訊網(wǎng)絡(luò)的基站,,神經(jīng)信息的傳遞與存儲(chǔ)的最基本結(jié)構(gòu)與功能單元?jiǎng)t是神經(jīng)突觸,。

突觸功能的發(fā)揮則依賴于突觸中大量蛋白分子的協(xié)調(diào)工作,其中一種特殊的蛋白分子叫受體分子,,也就是信息的接收器,。當(dāng)信息傳遞到突觸時(shí),突觸前神經(jīng)元就會(huì)釋放信號(hào)分子(神經(jīng)遞質(zhì))到突觸間隙,,突觸后神經(jīng)元上的受體就會(huì)接受信號(hào)分子,,使下一級(jí)神經(jīng)元產(chǎn)生興奮或抑制。這些受體蛋白在突觸中的功能結(jié)構(gòu)狀態(tài)以及它們?cè)谕挥|中的數(shù)量和排列方式直接影響著大腦信息傳遞的效能,。突觸又能夠根據(jù)神經(jīng)活動(dòng)的強(qiáng)弱而改變自身傳遞效能,,亦即突觸可塑性,在這一過(guò)程中,,突觸中的蛋白分子數(shù)量和分布會(huì)發(fā)生變化,,而記憶很可能恰恰就存儲(chǔ)于突觸中受體蛋白的組織和分布變化中。

精確解析突觸的蛋白分子結(jié)構(gòu)和組織架構(gòu),、及其在神經(jīng)活動(dòng)或異常過(guò)程中的變化無(wú)疑是解密大腦奧妙的一個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié),,也是腦科學(xué)與腦疾病研究中最基礎(chǔ)的核心研究方向之一。對(duì)大腦中各類受體蛋白為主的分子機(jī)器的作用機(jī)理進(jìn)行解密,,通俗講既是破譯大腦的分子密碼,。

“眼見(jiàn)為實(shí)”,借助成像手段直接透視生命體系中的物質(zhì)組成與結(jié)構(gòu)和內(nèi)在規(guī)律,,一直是生命科學(xué)研究的不二之法,。神經(jīng)突觸的大小在幾百納米的尺度(大概是頭發(fā)絲直徑的百分之一)。突觸中的分子就更小了,,通常在幾個(gè)納米左右,。在這個(gè)尺度下,只有光學(xué)顯微鏡和電子顯微鏡能夠具備這種成像條件,。光學(xué)顯微鏡由于光波長(zhǎng)(200-600納米)的限制,,仍舊沒(méi)有辦法觀測(cè)到突觸中的納米尺度的分子。電子顯微鏡所采用的電子波長(zhǎng)經(jīng)過(guò)加速后可達(dá)0.002納米,能夠觀察到高分辨的分子乃至原子信息,。更進(jìn)一步,,冷凍電鏡技術(shù)使得我們可以直接觀察被快速冷凍固定(零下180°左右)在近生理狀態(tài)下的樣品。

冷凍電鏡(CryoEM)技術(shù)的快速發(fā)展,,一方面使得眾多通過(guò)分離純化后的蛋白質(zhì)等生物大分子近原子分辨三維結(jié)構(gòu)得以解析,,正因?yàn)槿绱?017年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)?lì)C發(fā)給三位冷凍電鏡技術(shù)的開(kāi)拓者。另一方面,,基于最新的冷凍電鏡斷層三維成像技術(shù)(CryoET)能夠?qū)Ρ4嬖诮頎顟B(tài)下細(xì)胞和組織樣本進(jìn)行納米分辨率的三維成像,,為在神經(jīng)突觸及其它細(xì)胞區(qū)室中原位解析蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)和組織架構(gòu)帶來(lái)了新的契機(jī)。

近日,,中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)與中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院雙聘教授畢國(guó)強(qiáng)和劉北明團(tuán)隊(duì),,與美國(guó)加州大學(xué)洛杉磯分校周正洪教授合作,通過(guò)發(fā)展前沿冷凍電鏡細(xì)胞原位成像技術(shù),,首次解析了抑制性突觸中GABAA受體的原位三維結(jié)構(gòu),,并首次闡釋了抑制性突觸中受體蛋白和骨架蛋白層級(jí)化的組織規(guī)則。研究成果以 Mesophasic organization of GABAA receptors in hippocampal inhibitory synapses為題發(fā)表在Nature Neuroscience上(DOI: 10.1038/s41593-020-00729-w).

在前期的工作中,,研究人員將大鼠胎鼠的海馬體神經(jīng)細(xì)胞解離并直接培養(yǎng)在冷凍電鏡的樣品載網(wǎng)上(類似于光學(xué)顯微鏡成像使用的載玻片),,經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的培養(yǎng)后神經(jīng)細(xì)胞之間能夠形成突觸連接,進(jìn)而形成微型的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),。這種樣品可以直接通過(guò)投入式快速冷凍固定,,既是將電鏡載網(wǎng)直接投入到液氮冷卻的液態(tài)乙烷中,這樣在幾十毫秒內(nèi),,神經(jīng)細(xì)胞被冷凍固定到-180°以下,,樣品內(nèi)部近生理狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)得以保存,從而實(shí)現(xiàn)了對(duì)細(xì)胞的瞬間“定格”,。這種樣品可以直接傳輸?shù)嚼鋬鲭婄R中進(jìn)行冷凍電鏡斷層三維成像(將樣品進(jìn)行傾轉(zhuǎn),,同時(shí)收集不同角度的二維投影),經(jīng)過(guò)后期三維重構(gòu)處理,,即可重現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)分子水平的三維結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié),,進(jìn)而實(shí)現(xiàn)了對(duì)細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)的“回放”。

利用這種手段并結(jié)合自主研發(fā)的新型冷凍光電關(guān)聯(lián)顯微成像技術(shù),,研究人員開(kāi)創(chuàng)性地對(duì)神經(jīng)突觸超微結(jié)構(gòu)與功能進(jìn)行研究,,解析了首個(gè)完整神經(jīng)突觸的高精度三維結(jié)構(gòu),并實(shí)現(xiàn)了對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)中兩類最主要突觸-興奮性與抑制性突觸的精確區(qū)分以及結(jié)構(gòu)特征的定量化分析(Tao, Liu et al. 2018a; Tao, Liu et al. 2018b; Liu, Tao et al. 2019; Sun, Liu et al. 2019),。

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圖1. 冷凍電鏡斷層原位成像技術(shù)解析神經(jīng)突觸受體蛋白原位結(jié)構(gòu)與組織分布

在此基礎(chǔ)上,,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)展了一種基于過(guò)采樣與自動(dòng)分類的冷凍電鏡斷層三維成像亞區(qū)域圖像處理方法,實(shí)現(xiàn)了對(duì)細(xì)胞斷層三維重構(gòu)圖像中無(wú)標(biāo)記和無(wú)模板依賴的蛋白質(zhì)自動(dòng)識(shí)別和三維重構(gòu)分析,?;谶@一方法,,研究團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)了對(duì)抑制性突觸中GABAA受體的自動(dòng)化識(shí)別并解析了其19?分辨率的原位三維結(jié)構(gòu),這是目前已報(bào)道的首個(gè)突觸原位受體蛋白結(jié)構(gòu),。

進(jìn)一步,,通過(guò)對(duì)GABAA受體在突觸中的空間分布進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)這些受體在抑制性突觸中呈現(xiàn)層級(jí)狀的組織分布特性:GABAA受體之間可以形成具有距離固定(11nm間距)而相對(duì)角度可變的雙分子復(fù)合物,;這種雙分子復(fù)合物進(jìn)一步組成具有較低熵并且具備自組織特性的二維網(wǎng)絡(luò),;最后形成具有清晰邊界并介于固、液之間的“介態(tài)”相分離狀態(tài)(mesophasic organization),。這些組織形式可以通過(guò)突觸后支架蛋白和受體之間靈活的相互作用而形成,,并且與突觸前囊泡釋放位點(diǎn)存在對(duì)應(yīng)關(guān)系。

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圖2. 抑制性突觸中受體等蛋白分子與細(xì)胞器組織分布的三維可視化

(圖片版權(quán):陶長(zhǎng)路,、劉云濤,、畢國(guó)強(qiáng);圖片制作:王國(guó)燕,、馬燕兵)

抑制性突觸中受體蛋白的這種半穩(wěn)定的組織架構(gòu)很好地體現(xiàn)了神經(jīng)突觸既能保持信息傳遞穩(wěn)定性又具備可塑性的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),從分子組織結(jié)構(gòu)層面很好地解釋了學(xué)習(xí)與記憶的結(jié)構(gòu)機(jī)理,。通過(guò)應(yīng)用與發(fā)展前沿細(xì)胞原位冷凍電鏡斷層成像技術(shù)這種全新的嘗試,,實(shí)現(xiàn)了對(duì)突觸生理狀態(tài)下分子水平結(jié)構(gòu)與功能探究的突破,為破解大腦的分子密碼邁出了關(guān)鍵的一步,。

參考文獻(xiàn):

1. Tao, C. L., et al. (2018). "Differentiation and Characterization of Excitatory and Inhibitory Synapses by Cryo-electron Tomography and Correlative Microscopy." JNeurosci 38(6): 1493-1510.

2. Tao, C. L., et al. (2018). "Accumulation of Dense Core Vesicles in Hippocampal Synapses Following Chronic Inactivity." Front Neuroanat 12: 48.

3. Liu, Y. T., et al. (2019). "Postsynaptic protein organization revealed by electron microscopy." Curr Opin Struct Biol 54: 152-160.

4. Sun, R., et al. (2019). "An efficient protocol of cryo-correlative light and electron microscopy for the study of neuronal synapses." Biophysics Reports 5(3): 111-122.

作者:劉云濤,、陶長(zhǎng)路、畢國(guó)強(qiáng)

來(lái)源:中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)

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