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做外泌體RNA的注意了!即使無外泌體的血清也可能干擾你細(xì)胞外泌體RNA組成,!

 hzangs 2020-11-06

做外泌體RNA的注意了!


即使去除外泌體的血清也可能干擾你細(xì)胞外泌體的RNA組成??!

胎牛血清(FBS)已在真核細(xì)胞培養(yǎng)中使用了幾十年了。然而,,很少有人關(guān)注FBS的RNA對培養(yǎng)的細(xì)胞會產(chǎn)生什么樣的生物學(xué)效應(yīng),。來自哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員用RNA測序,證明了FBS含有蛋白質(zhì)編碼和調(diào)控的多種RNA,,包括mRNA,、miRNA、rRNA和snoRNA等,。它們中的大多數(shù)(>70%)仍然存在于細(xì)胞外囊泡(EV)和細(xì)胞間通訊研究中常使用的長時間超速離心得到的無囊泡FBS(vesicle-depleted FBS, vdFBS)中,。FBS相關(guān)的RNA會在分離細(xì)胞外膜泡RNA(exRNA)時一同被分離出來,,這會對下游RNA分析造成干擾,。許多進化上保守的FBS源的RNA種類會被錯誤地認(rèn)為是人或小鼠細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄本。值得注意的是,在FBS中含量豐富的一些miRNAs,,如miR-122,、miR-451A和miR-1246,先前已被報道為在培養(yǎng)細(xì)胞來源的細(xì)胞外膜泡中富含的miRNAs,,這可能是胎牛血清中miRNAs造成的假象。對公開可用的exRNA數(shù)據(jù)庫的分析支持FBS污染的概念,。此外,,F(xiàn)BS轉(zhuǎn)錄本可被培養(yǎng)的細(xì)胞吸收,并影響高度敏感的基因表達(dá)譜技術(shù)的結(jié)果,。因此,,實驗設(shè)計過程中采取減少FBS源RNA干擾的預(yù)防措施是非常有必要的。

參考文獻(xiàn):Wei, Z., et al. (2016). "Fetal Bovine Serum RNA Interferes with the Cell Culture derived Extracellular RNA." Sci Rep 6: 31175.

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