三腦理論是由美國(guó)心理學(xué)家保爾.麥克萊恩（Paul McLean）在1950s建立的學(xué)說(shuō),，來(lái)源于比較神經(jīng)解剖學(xué)和行為相關(guān)的研究。他認(rèn)為：人類(lèi)顱腔內(nèi)有三個(gè)腦,，它們是人類(lèi)進(jìn)化不同階段的產(chǎn)物,，按照出現(xiàn)順序依次覆蓋在已有的腦層之上，如同考古遺址一樣,，形成“三位一體”的構(gòu)造,。這三個(gè)腦的運(yùn)行就像“三臺(tái)互聯(lián)的生物電腦，各自擁有獨(dú)立的智能,、主體性,、時(shí)空感與記憶”。他將這三個(gè)腦分別稱(chēng)作爬行動(dòng)物腦----腦干和小腦,，哺乳動(dòng)物腦----邊緣系統(tǒng),，和人類(lèi)腦----新腦皮層,。每個(gè)腦通過(guò)神經(jīng)與其他兩個(gè)相連，但各自作為獨(dú)立的系統(tǒng)分別運(yùn)行,，各司其職,。

 在胚胎發(fā)展中，動(dòng)物趨向于重復(fù)或重演它們祖先在進(jìn)化中所遵循的程序,。人類(lèi)胎兒在子宮內(nèi)發(fā)育中,，就經(jīng)歷了同魚(yú)、爬蟲(chóng)動(dòng)物和非靈長(zhǎng)目哺乳動(dòng)物非常相似的階段,。而且胎兒腦的發(fā)育也是由內(nèi)向外,，從神經(jīng)框架，爬蟲(chóng)復(fù)合體,，邊緣系統(tǒng)到新腦皮質(zhì),。后三個(gè)即為人類(lèi)擁有的三層大腦。

人腦的最下一層,，是爬行動(dòng)物腦（(R-Complex)（原始本能腦）,，它是從爬行動(dòng)物那里繼承下來(lái)的部分，是人類(lèi)進(jìn)化過(guò)程中最先出現(xiàn)的腦成分,，亦稱(chēng)腦干,、原腦皮層，或“基礎(chǔ)腦”,，包括腦干和小腦,。它控制著身體的肌肉、平衡與自動(dòng)機(jī)能,，諸如呼吸與心跳,，睡眠和喚醒。這個(gè)部分在腦內(nèi)一直保持活躍狀態(tài),，即使在深度睡眠中,，它也不會(huì)休息。它控制著我們維持生存的本能性機(jī)械行為,，主要任務(wù)是維護(hù)個(gè)體生存, 特點(diǎn)是喜歡固定模式,，抗拒轉(zhuǎn)變。原始本能腦指揮的是人體植物神經(jīng)系統(tǒng),，它們的工作是無(wú)意識(shí)進(jìn)行的,，是人感覺(jué)不到的。

第二層,，哺乳動(dòng)物腦 (Limbic)（情感類(lèi)腦），或稱(chēng)邊緣腦,、舊大腦皮層,、中間腦,。包括下丘腦、海馬體以及杏仁核,。它是從哺乳動(dòng)物遺傳下來(lái)的部分,，它是情緒的運(yùn)作中心, 有基本的價(jià)值判斷,喜樂(lè)避苦，與情感,、直覺(jué),、哺育、搏斗,、逃避,、性行為等緊密相關(guān)。

人類(lèi)以上兩層腦與其它高等動(dòng)物相比,，顯已退化,。這是人類(lèi)高級(jí)精神活動(dòng)的新腦皮層高度發(fā)展的必然結(jié)果。

最上一層,，即人類(lèi)腦（Neocortex）（智力腦）,，或稱(chēng)新腦皮層、大腦皮層,。它大約是在一億五千萬(wàn)年以前被分化出來(lái)的,。然而，只是在二千萬(wàn)至二千五百萬(wàn)年以前當(dāng)人科動(dòng)物出現(xiàn)時(shí),，新腦皮層才逐漸獲得區(qū)別人腦和動(dòng)物腦的初級(jí)結(jié)構(gòu),，及至到古人類(lèi)出現(xiàn)時(shí)，新腦皮層才高度發(fā)展起來(lái),。它是尼人到智人階段進(jìn)化的產(chǎn)物,。新腦皮層基本上是按枕、頂,、顳,、額葉這樣的順序發(fā)展的，而額葉前區(qū)則是新腦皮層發(fā)展最晚的部分,，是人類(lèi)的最主要的特征和智力的功能區(qū),。新腦皮層包括左右腦半球，占全腦重量八成左右,。它對(duì)應(yīng)的是高階認(rèn)知功能,，包括語(yǔ)言區(qū)、視覺(jué)區(qū),、記憶區(qū)等,。它是我們大腦中最新結(jié)構(gòu)。它掌管人類(lèi)抽象的思維活動(dòng)，并能通過(guò)復(fù)雜的分析性行為,，來(lái)產(chǎn)生創(chuàng)造性的想象和思考,。

由于不同的屬性，大腦的三層結(jié)構(gòu)之間對(duì)同一問(wèn)題會(huì)產(chǎn)生不同的價(jià)值取向,，使人產(chǎn)生心理矛盾和沖突,。通常表現(xiàn)為：有時(shí)候我們從一方面進(jìn)行排斥的東西，在另一方面來(lái)看似乎是可以接受,，甚至還會(huì)是很受吸引,。有時(shí)你可以討厭一個(gè)人的說(shuō)話(huà)方式，但又忍不住想要多留他一會(huì),，感受他迷人的思想魅力,；有時(shí)做某事可能讓你感到痛苦，但為了生活,，你還是得主動(dòng)地做下去,；有時(shí)盡管你出于教養(yǎng)，在困難面前極其平靜和鎮(zhèn)定,，而內(nèi)心卻充滿(mǎn)恐慌和不安,，等等。

三腦理論有很高的醫(yī)學(xué)和心理價(jià)值,，至今仍是RPT（筆者注：reference point therapy生命原點(diǎn)療法,、參照點(diǎn)療法）的一個(gè)重要理論。

在弗洛伊德學(xué)說(shuō)的實(shí)證性遭到越來(lái)越多的人質(zhì)疑的時(shí)候,，三腦學(xué)說(shuō)的出現(xiàn),，及時(shí)從神經(jīng)解剖學(xué)的角度為他做了一定的理論支持。無(wú)疑,，基礎(chǔ)腦和中間腦管控對(duì)應(yīng)的正是我們所探討的潛意識(shí)系統(tǒng),，大腦新皮層管控對(duì)應(yīng)的正是我們所探討的意識(shí)（包括前意識(shí)）系統(tǒng)。自此,，自我,、本我和超我也總算在實(shí)證的三腦理論中有了自己的位置和歸宿。上帝還是偏愛(ài)弗洛伊德的,。