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劉如謙放大招:超越CRISPR,實現(xiàn)堿基任意轉換與增刪,,可修正89%的人類遺傳病

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-10-22

2019年10月21日,,單堿基編輯技術開創(chuàng)者,Broad研究所劉如謙(David R. Liu)教授在Nature雜志發(fā)表題為:Search-and-replace genome editing without double-strand breaks or donor DNA 的研究論文,。

該研究開發(fā)了一種全新的精準基因編輯工具——先導編輯(Prime Editor),,無需依賴DNA模板便可有效實現(xiàn)所有12種單堿基的自由轉換,而且還能有效實現(xiàn)多堿基的精準插入與刪除(最多插入44個堿基,,或刪除80個堿基),。

Nature 雜志評論這一技術是“超精確的新型基因編輯工具”, Science 雜志評論它是“超越CRISPR的重大突破,,哈佛大學教授,,CRISPR先驅(qū)喬治·丘奇(George Church)盛贊這一成果:朝著正確方向邁出的一大步”。

先導編輯(Prime Editor),,將Cas9酶藍色)和逆轉錄酶紅色)結合成復合物,,在gRNA(綠色)的引導下,將該復合物帶到DNA雙螺旋(黃色紫色)的特定位置,,并保留在該位置插入新DNA序列,。

CRISPR基因編輯技術是一種在2012年被發(fā)明的極其強大的基因組編輯工具,2013年2月,,張鋒等人首次將CRISPR技術用于人類細胞的基因編輯,,很快取得了一系列輝煌的成果,目前CRISPR基因編輯技術已經(jīng)開始用于人類遺傳病治療的臨床試驗,。但是,,目前CRISPR基因編輯技術仍然顯得有些笨拙
CRISPR基因編輯有時會改變它不應該改變的基因,,也就是所謂的脫靶效應,,此外,CRISPR基因編輯依賴于DNA雙鏈斷裂,,從而可能導致基因編輯后的細胞出現(xiàn)不可預期的混亂,這些缺陷的存在限制了其在基礎研究和農(nóng)業(yè)中的使用,,并在醫(yī)學上構成安全隱患,。
2016年4月20日,,劉如謙等人Nature 發(fā)表論文,首次可以通過可靠,、可預測的方法,,實現(xiàn)對改變活細胞基因組中的單個堿基進行修改,。

2017年10月25日,劉如謙等人進一步升級,,開發(fā)出了單堿基編輯器(Base Editor),將Cas9APOBEC(胞嘧啶脫氨酶)整合,能夠在不造成DNA雙鏈斷裂的情況下,,將A-T堿基對轉換為G-C堿基對,,實現(xiàn)對基因組點突變的定點矯正修復。

許多遺傳性疾病是由單個堿基突變導致的,,因此,,單堿基編輯器的出現(xiàn),為治療許多單堿基遺傳病提供了強大的方法,,劉如謙也因此被 Nature 評為“2017年影響世界十大科學人物”,。

但是,單堿基編輯器有局限性,,并不能任意編輯所有堿基,而且,2019年3月1日,,中國科學家楊輝,、高彩霞各自在 Science 發(fā)表研究論文,,證實單堿基編輯器存在嚴重的意料之外的脫靶效應,,這也為原本前景樂觀的單堿基編輯技術蒙上了一層陰影,。詳情:中國團隊證實單堿基編輯存在嚴重脫靶效應
不能任意編輯所有堿基,,存在脫靶效應,,這是單堿基編輯技術面臨的兩大問題,,為了解決這兩個問題,,許多卓越的科學家在不懈努力,以期開發(fā)出效果更好,、脫靶性更低的單堿基編輯系統(tǒng),。
為了解決這兩個問題,,劉如謙團隊在Cas9酶gRNA兩方面進行了重大改造:
一是改造gRNA,,在其3’末端增加了一段RNA序列,,形成所謂的pegRNA
二是改造Cas9酶,將Cas9酶的變體(H840A突變型,只切斷含PAM的靶點DNA鏈)逆轉錄酶融合,,形成融合蛋白復合體,。
pegRNA的3’端序列有雙重角色,,一段序列作為引物結合位點(PBS),與斷裂的靶DNA鏈3’末端互補以起始逆轉錄過程,另一端序列則是逆轉錄的模板(RT模板),其上攜帶有目標點突變或插入缺失突變以實現(xiàn)精準的基因編輯。

劉如謙團隊對 Prime Editor 在人類和小鼠細胞中進行了175種以上的基因編輯實驗,,成功修復了導致鐮狀細胞性貧血癥Tay-Sachs病的基因突變,。
鐮狀細胞性貧血癥,是一種常染色體顯性遺傳病,,因編碼血紅蛋白的基因中發(fā)生了AT的單堿基突變,,導致血紅蛋白β-肽鏈第6位氨基酸谷氨酸變成纈氨酸,構成鐮狀血紅蛋白,,取代了正常血紅蛋白,。該疾病的純合子很難存活到成年。
Tay-Sachs病,,是一種常染色體隱性遺傳病,,因HEXA基因發(fā)生突變,多出4個堿基,,導致HEXA基因編碼的脂質(zhì)分解酶失活,,從而導致神經(jīng)節(jié)苷脂在大腦中聚集至中毒水平,通?;颊咧荒艽婊钪羶扇龤q,,該疾病在猶太人中發(fā)病率相對較高。
這兩種遺傳病,,使用傳統(tǒng)的基因組編輯系統(tǒng)要么無法修復,,要么效率低下,。
而劉如謙團隊使用 Prime Editor 成功修復了這兩種基因突變,,不僅效率大大提高,,而且脫靶效應更低,,劉如謙團隊在論文中表示,,該技術“原則上可以修復75000種已知致病性人類遺傳變異的89%”,。
為了促進先導編輯(Prime Editor)發(fā)展,,進一步檢驗和改進這種新型基因編輯方式,,劉如謙團隊已向?qū)W術界和非盈利組織免費公開這一系統(tǒng),。
據(jù)了解,,劉如謙已圍繞這項新堿基編輯工具Prime Editor創(chuàng)建了新公司 Prime Medicine 這也是劉如謙作為創(chuàng)始人或聯(lián)合創(chuàng)始人的第七家科技公司,。
之前劉如謙張鋒等人已聯(lián)合創(chuàng)建了三家基因編輯領域公司:基因編輯醫(yī)療公司Editas Medicine,、單堿基編輯公司Beam Therapeutis、基因編輯農(nóng)業(yè)公司Pairwise Plants,。

張鋒教授(左),、David Liu教授(中),、J. Keith Joung教授(右)

其中,Editas Medicine已經(jīng)成功上市,,Beam Therapeutis也已經(jīng)提交上市申請,,Pairwise Plants已獲得數(shù)千萬美元融資。

給跪了,。,。

論文鏈接:

https://www./articles/s41586-019-1711-4

本文由BioWorld公眾號原創(chuàng)

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