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導(dǎo)讀 1 研究內(nèi)容： 結(jié)核性腦膜炎（TBM）是結(jié)核病中最嚴(yán)重的肺外結(jié)核類型,，有超過一半患者因TBM死亡或者殘疾，早期診斷及治療是良好預(yù)后的關(guān)鍵因素,。疾病癥狀相似,、病原體類型多樣、培養(yǎng)和抗酸染色等檢測方法學(xué)陽性率低等諸多因素導(dǎo)致TBM診斷存在困難,。  mNGS用于結(jié)核性腦膜炎（TBM）的診斷價值探究 近來已有多篇mNGS協(xié)助臨床診斷病毒,、細(xì)菌和真菌性腦膜炎的文章發(fā)表。目前缺乏mNGS在TBM診斷方面的探究,。因此,，本文重點(diǎn)關(guān)注mNGS在TBM方面的診斷價值。 2 研究設(shè)計 研究者入組23例2015年12月-2018年10月南方醫(yī)院和協(xié)和醫(yī)院診斷為TBM的患者,，其中12例確診為TBM，11例基于評分系統(tǒng)以及抗結(jié)核的療效臨床診斷為TBM,。另外,，研究者選取6例細(xì)菌、真菌,、病毒性或自身免疫性腦膜炎患者作為mNGS 方法的陽性或?qū)φ?。與不同的結(jié)核診斷方法學(xué)相比，回顧性探究和評估m(xù)NGS在TBM方面的診斷價值,。  研究設(shè)計示意圖 3 研究成果 在23例TBM入組患者中,，有18例mNGS陽性，陽性率為78.26%,，1例培養(yǎng)陽性,，陽性率為4.35%; 22例進(jìn)行一次或多次抗酸染色的患者，8例陽性,，陽性率為36.36%; 19例進(jìn)行PCR的患者,，3例陽性，陽性率為15.79%,。  不同方法學(xué)診斷TBM的陽性率 結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群mNGS檢出陽性的樣本序列數(shù)從1-185條不等,，有12個樣本序列數(shù)低于20條，與其它細(xì)菌,、真菌或病毒性腦膜炎患者的mNGS檢測結(jié)果相比,，整體序列偏低。先前已有針對結(jié)核分枝桿菌,，將mNGS報陽的閾值調(diào)低至1條的報道,，考慮到結(jié)核分枝桿菌在細(xì)胞內(nèi)寄生,，腦脊液載量低、以及污染的可能性相對較低等因素,，本文也遵循了1條報為陽性的閾值判定原則,。  mNGS檢出結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群的序列數(shù)分布圖 4 總結(jié)討論 本文進(jìn)行了一項(xiàng)關(guān)于mNGS用于TBM診斷的回顧性研究，結(jié)果表明mNGS該項(xiàng)研究中的陽性率最高（78.26%）,，研究者指出mNGS有望作為結(jié)核性腦膜炎的一線診斷方法,，與傳統(tǒng)方法學(xué)聯(lián)合，將會最大化提升檢測陽性率,。 大咖點(diǎn)評  mNGS 新技術(shù)是TBM分子診斷的又一利器,。mNGS成本的降低或納入醫(yī)保可保障疑似顱內(nèi)感染患者享受新技術(shù)的福利,，同時也保障新技術(shù)在大數(shù)據(jù)中得到更客觀的評價,。然而目前該方法的局限性還不能滿足結(jié)核耐藥性的判別。期待方法本身技術(shù)革新能提高覆蓋度及敏感性,，并提供耐藥性信息,。 胡亞芳教授（原文通訊作者） ? ? ? ? ? ? ? ? ?南方醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科  既往研究成果主要集中在案例報道和小樣本的方法學(xué)評估，2019年關(guān)于方法學(xué)評估的研究將會持續(xù)進(jìn)行,，將會進(jìn)一步細(xì)分到不同的感染領(lǐng)域,。未來方向以大樣本和大數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，對mNGS的現(xiàn)有流程進(jìn)行不斷的優(yōu)化和標(biāo)準(zhǔn)化,，同時微生物專家,、臨床專家、生物信息學(xué)專家及相關(guān)技術(shù)專家需加強(qiáng)溝通,，共同分析檢驗(yàn)報告的臨床意義與診斷價值,，進(jìn)一步提高mNGS在疑難感染中的精準(zhǔn)診斷價值。 顧兵教授（原文編輯） 徐州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院檢驗(yàn)科  結(jié)核診斷技術(shù)在持續(xù)創(chuàng)新深入中,，從宏基因組學(xué)測序到基因編輯診斷工具發(fā)展,，8月下旬，微遠(yuǎn)基因與華山醫(yī)院感染科合作的基因編輯(CRISPR)技術(shù)用于結(jié)核病診斷的文章被《Emerging Microbes&Infections》雜志接收,。未來該技術(shù)在結(jié)核性腦膜炎診斷價值研究也值得期待,。 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?李永軍（原文作者之一） 微遠(yuǎn)基因  參考文獻(xiàn) [1]??Chen, Y., Wang, D., Wu, Y., Zhao, D., Zhang, J., Xie, H., ... & Zhang, J. (2019). The feasibility of metagenomic next-generation sequencing to identify pathogens causing tuberculous meningitis in cerebrospinal fluid.?Frontiers in Microbiology,?10, 1993. IDseq?為疑難危重感染保駕護(hù)航 IDseq?從海量宏基因組數(shù)據(jù)中探明感染微生物，實(shí)現(xiàn)感染性疾病病原體的快速,、準(zhǔn)確和全面鑒定,，輔助臨床感染診療，為疑難危重感染保駕護(hù)航,。  我們深深明了,，每一份珍貴標(biāo)本的背后， 都有一位亟待救治的病患,。 |
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