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今日《自然》:單細(xì)胞測序揭秘人腦細(xì)胞“風(fēng)味食譜”

 昵稱535749 2019-08-22
2019-08-22 07:51

今日,,頂尖學(xué)術(shù)期刊《自然》上線一項(xiàng)腦科學(xué)重磅研究。美國艾倫腦科學(xué)研究所(Allen Institute for Brain Science)的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)利用單細(xì)胞測序,,鑒定出人類大腦皮質(zhì)一個腦區(qū)的75種細(xì)胞類型,。與最常用的模式生物——小鼠進(jìn)行比較的結(jié)果,揭示了腦細(xì)胞在進(jìn)化過程中的顯著保守特征,,也突顯了人類腦細(xì)胞獨(dú)具特色的性質(zhì),。

同期《自然》以《神經(jīng)元風(fēng)味食譜》(A cookbook for neuronal flavours)為題,對這項(xiàng)研究作出評述:

“創(chuàng)作一道新菜時,,大廚必須對各種食材做出挑選和組合,,以求達(dá)到想要的口味和口感。類似地,,成千上萬個基因通過不同組合的基因表達(dá)(即制造出基因產(chǎn)物),,創(chuàng)造并維持了各類腦細(xì)胞的不同‘風(fēng)味’……這項(xiàng)研究通過分析大腦單個細(xì)胞中的基因表達(dá),展示出一本‘食譜’,,上面列出了人類大腦皮質(zhì)各類神經(jīng)細(xì)胞的分子配方,。”

大腦皮質(zhì),,主管我們的思維和眾多高級認(rèn)知活動,,很可能正是人之所以異于禽獸的關(guān)鍵。過去的研究表明,,人類大腦皮質(zhì)包含160億個神經(jīng)元,,還有610億個非神經(jīng)元細(xì)胞,組成了優(yōu)美的6層結(jié)構(gòu),,可按解剖結(jié)構(gòu)或功能分為近百個區(qū)域,。

隨著技術(shù)手段的進(jìn)步,科學(xué)家對人腦細(xì)胞不斷有新的認(rèn)識,。例如就在一年前,,艾倫腦研究所與其合作伙伴就在人腦中發(fā)現(xiàn)一種過去不知道的“玫瑰果神經(jīng)元”,似乎是其他動物都沒有的,。更透徹地理解腦細(xì)胞的分子類型,,將幫助我們解開腦的奧秘,理解人何以為人,。

圖片來源:Pixabay

在這項(xiàng)研究中,,科學(xué)家們鑒定了大腦皮質(zhì)顳中回(middle temporal gyrus)內(nèi)的細(xì)胞類型。一些癲癇患者的這一腦區(qū)會通過手術(shù)切除,,因此科學(xué)家可以檢驗(yàn)活體組織進(jìn)行后續(xù)研究分析,。

由于從人腦組織中分離出完整細(xì)胞一直存在巨大的技術(shù)難度,為克服這個障礙,,研究人員從尸檢和手術(shù)獲得的人腦樣品中分離出了單個細(xì)胞核,。運(yùn)用單核RNA測序(snRNA-seq)技術(shù),,測量RNA轉(zhuǎn)錄分子的水平,從而破譯每個細(xì)胞核里的基因表達(dá)信息,。

從人腦顳中回(MTG)分離神經(jīng)元和非神經(jīng)元的細(xì)胞核做RNA測序分析的流程示意圖(圖片來源:參考資料[1])

將近1.6萬個細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行詳細(xì)統(tǒng)計(jì)后,,研究人員鑒定出75種不同的細(xì)胞類型。其中,,包括24種興奮性神經(jīng)元,,45種抑制性神經(jīng)元,以及6種非神經(jīng)元細(xì)胞,。

前面說過,,大腦皮層可分為6層。當(dāng)把神經(jīng)元的特殊標(biāo)志分子和每一個細(xì)胞在大腦皮層中的分布位置結(jié)合起來分析后,,研究人員有了意外的發(fā)現(xiàn),!大部分興奮性神經(jīng)元類型的分布并不局限于大腦皮質(zhì)的某個單層,而是跨層分布,。這個結(jié)果挑戰(zhàn)了過去對細(xì)胞類型與位置關(guān)系的假設(shè),。 

興奮性神經(jīng)元在大腦皮質(zhì)各層中的分布(圖片來源:參考資料[1])

在獲得人腦細(xì)胞類型的數(shù)據(jù)后,研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步將其與小鼠大腦皮層單細(xì)胞RNA測序數(shù)據(jù)集做了比較,,為細(xì)胞類型的演化提供洞見,。

人和小鼠同為哺乳動物,大腦皮層的基本結(jié)構(gòu)相似,。作為最受歡迎的模式動物之一,,小鼠為我們理解大腦的秘密提供了豐富的數(shù)據(jù)。對比結(jié)果也顯示,,人類擁有的大部分細(xì)胞類型在小鼠腦內(nèi)都能找到對應(yīng),。

人和小鼠共有的腦細(xì)胞具有不同的基因表達(dá)特征(圖片來源:參考資料[2])

但研究者注意到,對應(yīng)細(xì)胞類型之間,,基因表達(dá)水平有著很大差異。

其中,,大腦中的免疫細(xì)胞——小膠質(zhì)細(xì)胞,,在人和鼠之間的基因表達(dá)差異最為明顯。而神經(jīng)遞質(zhì)5-羥色胺的受體家族是兩個物種之間差異第二大的基因,。

這些過去未曾揭示的區(qū)別提醒疾病研究者,,以小鼠為模型研究神經(jīng)免疫疾病或神經(jīng)精神疾病時不可忽視物種之間的差異,需要考慮我們?nèi)祟愄赜械摹按竽X配方”,。

參考資料:

[1] Rebecca Hodge et al., (2019) Conserved cell types with divergent features in human versus mouse cortex. Nature. DOI: 10.1038/s41586-019-1506-7

[2] Matthew G. Keefe, Tomasz J. Nowakowski (2019) A cookbook for neuronal flavours. Nature. DOI: 10.1038/d41586-019-02343-8

本文來自微信公眾號:學(xué)術(shù)經(jīng)緯(ID:Global_Academia),,作者:學(xué)術(shù)經(jīng)緯

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