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生存分析數(shù)據(jù)中的Buckley-James Multiple Regression Model

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-02-23

一、模型簡介

目前,,生存分析領(lǐng)域,,最常用的是Cox比例風(fēng)險回歸模型,該模型具有良好的特性,,不僅可以分析各種自變量對生存時間的影響,,而且對基準風(fēng)險分布不作任何要求(半?yún)?shù)模型)。Cox模型使用時要滿足一定的條件,,其中最為大家熟知的“PH比例風(fēng)險”假定,專業(yè)點講,,就是在時間t,協(xié)變量x作用下,,個性風(fēng)險率相對于基準風(fēng)險率之比與時間無關(guān),,不隨時間t的變化而變化;通俗點說,就是生存曲線要平行不能交叉,。如果違反“PH假定”Cox模型不再適用,,需要其他方法替代。本文介紹一種替代模型Buckley-James模型,。該模型是由Buckley James1979年提出,,該模型具有線性回歸模型的特點,其參數(shù)估計方法是最小二乘法的一種校正,,通用引用一個偽隨機變量,,使其滿足一般的正則條件下,能夠用于具有右刪失數(shù)據(jù)的分析,。而且,,在1993,Hillis等人證明Buckly-James模型的參數(shù)估計要比其他模型的參數(shù)估計優(yōu)越。

二,、 模型適用條件

因BJ模型是線性回歸模型的改進,,故其需滿足線性回歸模型的適用條件(1)線性;

(2)方差齊,。

檢驗是否滿足上述條件的方法:

(1)修正殘差圖判定法;

(2)樣條函數(shù)判定法,。

三,、模型原理

該模型假定生存時間T,,或者其簡單變換與協(xié)變量x之間呈線性關(guān)系。即:

 

由于生存時間存在右刪失,,所以數(shù)據(jù)中只能觀測到刪失時間,,因此上式不再適用,通常的最小二乘也無法估計出模型的參數(shù),,為此,,Buckly-James引入了一個偽隨機變量:

 

這里是指示變量。同時也證明了如下線性關(guān)系:

 

所以BJ模型實際是一種將因變量Y改進后(考慮刪失情況)的線性回歸模型,,該模型對生存時間分布不作任何要求,。線性回歸系數(shù)估計用到了高斯的最小二乘法,BJ模型系數(shù)估計用到的是校正后的最小二乘法,。

有研究顯示,,連續(xù)性自變量對BJ模型估計值的影響可以忽略,而當自變量為分類變量時,,BJ估計值的偏倚是比較大的,。提示在實際應(yīng)用時,尤其是單個自變量的情形下,,要謹慎考慮分類自變量估計值的準確性,,為此可以考慮用Bootstrap法估計參數(shù)值并得到可信區(qū)間。

四,、模型應(yīng)用案例基于R軟件

這里以一份口咽癌數(shù)據(jù)為例:

 數(shù)據(jù)包含195條觀測13個變量,,涉及研究對象性別,年齡,、分期等臨床指標和患者生存時間和生存狀態(tài),;

(1)先讀入并打包數(shù)據(jù)

(2)建立BJ模型:

BJ模型的建立和cox模型非常像,也會報告模型各指標系數(shù)及是否有意義的變量。

與線性回歸分析一樣,,對建立的模型做模型是否有意義的假設(shè)檢驗,,假設(shè)檢驗會給出ANOVA分析結(jié)果,從上述的結(jié)果可見模型中只有T分期有意義,,年齡和性別無意義,。

做模型的summary(f1),可以發(fā)現(xiàn)年齡AGE、T分期和生存時間成反比

利用BJ模型結(jié)果做出的Nomogram結(jié)果與Summary表型出一致的結(jié)果,。

五,、總結(jié)

BJ模型作為回歸模型的一種,自然也有回歸模型的基本功能,,如因素篩選,、預(yù)測等等。

在應(yīng)用時除了要求線性和方程齊(本篇未展示檢驗過程)要求外,,還需考慮一定的刪失比,。

與COX模型相比,,選擇方案如下:

當數(shù)據(jù)不滿足COX回歸的PH假定(生存曲線相交),BJ模型是Cox模型很好的補充,。




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