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實驗萬事屋作品 我叫沙良赟，是莫愁師姐的師弟,，也是林師兄的師弟,。 實驗萬事屋作品 每次我看文獻，都會遇到這樣的問題,，我發(fā)覺是我的打開方式不太對勁,。因為一打開，看到大部分什么深入機制研究的文章里,，都有這樣的圖,，絕壁是我打開方式不對。 實驗萬事屋作品 實驗萬事屋作品 好吧,，我知道CNS里面是不會有雙色球的……這種東西實在是太難看懂了吧,，到底要腫么來看這樣的雙色球，呃，不是,，是CoIP圖呢,？ 實驗萬事屋作品 師姐，這爛七八九糟的圖到底要腫么看呢,？ 實驗萬事屋作品 莫愁：呃,，看這樣的圖，先給你做個智力題吧,。請聽題： 實驗萬事屋作品 有A,、B、C三個人,，他們在拍照。三個人在一起可以拍到合影,，B不在的時候,，A和C只能各自拍風景或者自拍；B在的時候,，A可以拍到B和C,，C也能。問,，他們仨是什么樣的蛋白復合體,？ 實驗萬事屋作品 沙師弟：呃，師姐,，這種智力題好像簡單點了,，如果這三個都是蛋白的話，也就是說應該是A和C是通過B才能在一起的,，是這個意思么,？ 實驗萬事屋作品 莫愁：答對了。所以我們看到這樣的CoIP圖片的時候,，首先要看的是,，上方“+”和下方顯示條帶的差異性，比如剛才那個簡單的智力題,，我把它畫成簡單的CoIP圖片的話,，會是這個樣子： 實驗萬事屋作品 實驗萬事屋作品 但仔細看加入的蛋白不同來看表達的話，就可以看到： 實驗萬事屋作品 實驗萬事屋作品 當看到條帶和加入的蛋白之間有差異的時候,，我們就應該知道,，其中必然是有對蛋白互作結(jié)構有解釋的地方。從這種細節(jié)上,，我們可以判斷出,，這個CoIP圖片所要表達的意思。 實驗萬事屋作品 我們實際來看個例子，這是GD（IF=12.639）上的一篇文章里的CoIP圖,。（想看這篇文獻的就回復“GD”看看吧） 實驗萬事屋作品 實驗萬事屋作品 對比一下加入的蛋白和下面產(chǎn)生的條帶,，我們能明顯看到，A圖顯示的是：PIP1是POT1及TIN2蛋白形成復合體的一個關鍵,；B圖顯示的是：TIN1又是TRF1和PIP1蛋白形成復合體的一個關鍵,。 實驗萬事屋作品 通過這樣的CoIP結(jié)果，就可以得出以下這樣的四個蛋白形成復合體的結(jié)構了,，就像下面這樣： 實驗萬事屋作品 實驗萬事屋作品 好了,，大概明白應該咋看CoIP圖了么，小林子,？ 實驗萬事屋作品 沙師弟：師姐,，我是小沙（ps：我還是這么沒有存在感么……） 實驗萬事屋作品 …華麗麗的分割線… 實驗萬事屋作品 李莫愁博士：要看懂CoIP圖也需要一點點的小邏輯，但你的邏輯推理能力真的能辣么過關么,？想看這篇文獻的就回復“GD”看看吧,。有師弟師妹要問了：能作出A和B拍照這樣的就能搞清楚文獻的邏輯了咩？別開玩笑了,，就那點邏輯推理基本上三分以下的夠用,，要是CNS的話就要費盡了。為了演示以下CNS需要什么樣的邏輯嗎,，那我們現(xiàn)在來做個小型的測試,，熬一熬腦子。題目如下： 實驗萬事屋作品 1,、在細胞里,，五個亞細胞結(jié)構，這五個亞細胞結(jié)構已經(jīng)按照順序進行排列,； 2,、每個亞細胞結(jié)構表達著不同的蛋白； 3,、每個蛋白有不同的信號通路,，不同的修飾，不同的功能,； 4,、戊蛋白在細胞核內(nèi)表達 5、丙蛋白有糖基化修飾 6,、甲蛋白參與Wnt通路 7,、線粒體排序在溶酶體的左邊（亞細胞結(jié)構排序的左面） 8、線粒體里的蛋白參與P53信號通路 9,、參與炎癥反應的蛋白,，有甲基化的修飾 10、細胞質(zhì)中的蛋白與細胞的遷移侵襲有關 11、排序在中間的亞細胞結(jié)構中的蛋白參與NF-kB信號通路 12,、丁蛋白在排序為1的亞細胞結(jié)構中表達 13,、與增殖相關的蛋白所處的細胞器，在磷酸化修飾的蛋白的隔壁（亞細胞結(jié)構排序的隔壁） 14,、有泛素化修飾的蛋白,，所處的細胞器，在與細胞遷移相關的蛋白的隔壁（亞細胞結(jié)構排序的隔壁） 15,、m-TOR參與自噬功能 16,、乙蛋白有促細胞凋亡功能 17、丁蛋白在細胞膜的隔壁（亞細胞結(jié)構排序的隔壁） 18,、與增殖相關的蛋白有個參與MAPK通路的鄰居（亞細胞結(jié)構排序的隔壁） 實驗萬事屋作品 問題是：哪個蛋白有乙?；揎棧?/strong> 實驗萬事屋作品 能答上來么,？答得上來就直接回復答案吧,，基本上就能無障礙地理清楚文獻的邏輯結(jié)構了。答不上來,？那就看我們明天詳細分析吧……好了，今天就策到這里了…… |
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