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2018年12月甲基化研究集錦

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-01-11

2018年12月10日,,來自澳大利亞的Richard B. Lock研究團隊,,在Cancer Cell雜志發(fā)表了Lymphocyte-Specific Chromatin Accessibility Pre-determines Glucocorticoid Resistance in Acute Lymphoblastic Leukemia的文章,,整合了DNase-seq,,ChIP-seq,ATAC-Seq以及甲基化測序技術(shù),,從表觀遺傳的角度,,闡述了ALL對于糖皮質(zhì)激素耐藥的的可能原因。

原文出處:https:///10.1016/j.ccell.2018.11.002


另外一篇同期刊發(fā)在Cancer Cell的文章Enhancer Architecture and Essential Core Regulatory Circuitry of Chronic Lymphocytic Leukemia,,也通過整合CRISPR-screening 以及ChIP-seq,,ATAC-Seq等多組學(xué)手段,找到了對于CLL(慢性淋巴細胞白血病,,Chronic lymphoblastic leukemia , ALL)細胞增殖至關(guān)重要的轉(zhuǎn)錄因子PAX5,,同時證明了BET bromodomain的抑制可以破壞CLL core regulatory circuitry從而發(fā)揮較強的抗腫瘤活性,。

原文出處:https:///10.1016/j.ccell.2018.11.001

Cell Rep |研究發(fā)現(xiàn)環(huán)境應(yīng)激引起抑郁行為表觀新機制

2018年12月11日,國際權(quán)威雜志Cell Reports上發(fā)表的題為“Ten-eleven translocation proteins modulate the response to environmental stress in mice”的文章,,揭示了外界環(huán)境刺激引起抑郁發(fā)生的表觀遺傳學(xué)新機制,。該研究由蘇州大學(xué)徐興順教授課題組和美國Emory大學(xué)金鵬教授課題組的研究人員合作完成。

該合作研究發(fā)現(xiàn):外界環(huán)境刺激造成小鼠出現(xiàn)抑郁樣行為以及前額葉皮層出現(xiàn)DNA 5hmC修飾的顯著下降,。進一步研究發(fā)現(xiàn),,Tet1基因敲除小鼠對外界刺激存在抵抗,不容易產(chǎn)生抑郁樣行為,,而Tet2基因敲除小鼠,,即使不予外界刺激也表現(xiàn)出明顯抑郁樣癥狀。Tet1和Tet2催化的同一個DNA5hmC修飾反應(yīng),,但Tet1/2基因敲除小鼠卻表現(xiàn)出相反的行為表現(xiàn),;提示不同Tet酶介導(dǎo)的DNA 5hmC修飾參與小鼠抑郁樣行為但存在不同的機制。

原文出處: https:///10.1016/j.celrep.2018.11.061

CELL DEATH DIS |甲基化敏感的Sp1介導(dǎo)ZNF132表觀遺傳沉默促進食管鱗狀細胞癌進展

2018年12月18日,,Cell Death & Disease雜志發(fā)表題為“Epigenetic silencing of ZNF132 mediated by methylation-sensitive Sp1 binding promotes cancer progression in esophageal squamous cell carcinoma”的文章,。腫瘤抑制基因的表觀遺傳改變是人食管鱗狀細胞癌(ESCC)中最重要的指標(biāo)之一。在本研究中,,作者通過綜合計算分析鑒定了一種新的ESCC高甲基化生物標(biāo)志物ZNF132,,用于全面的全基因組DNA甲基化微陣列數(shù)據(jù)集。通過甲基化目標(biāo)亞硫酸氫鹽測序(MTBS)檢測了91例中國漢族ESCC患者和鄰近正常組織中ZNF132的高甲基化狀態(tài),。同時,,在固體組織和癌細胞系中證實了由高甲基化介導(dǎo)的ZNF132基因沉默。此外,,他們發(fā)現(xiàn)體外過表達ZNF132在ESCC細胞中可顯著降低細胞在裸鼠模型中生長,,遷移和侵襲以及細胞致瘤性的能力。他們用染色質(zhì)免疫沉淀試驗驗證了ZNF132啟動子區(qū)域中的Sp1結(jié)合位點,,并證明高甲基化狀態(tài)可以降低Sp1轉(zhuǎn)錄因子活性,。研究結(jié)果表明,ZNF132在ESCC作為腫瘤抑制基因的發(fā)展中起重要作用,,并支持由DNA高甲基化介導(dǎo)的Sp1結(jié)合衰變和基因沉默引起的潛在機制,。

原文出處:https://www./articles/s41419-018-1236-z


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公司是十萬人甲基化組計劃(表觀星圖計劃)項目實施方,擁有專業(yè)的多組學(xué)技術(shù)服務(wù)團隊,,成熟的團隊和技術(shù)平臺提供基因組,、轉(zhuǎn)錄組、表觀基因組,、代謝組等多組學(xué)的實驗分析和生信分析,,以及多維度因果關(guān)聯(lián)分析,為廣大醫(yī)學(xué)和生物學(xué)研究人員提供專業(yè)的一站式服務(wù),。

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