這篇文章題目：ZNF154 is a promising diagnosis biomarker and predicts biochemical recurrence in prostate cancer

文章來源：https://www.ncbi.nlm./pubmed/?term=ZNF154+is+a+promising+diagnosis+biomarker+and+predicts+biochemical+recurrence+in+prostate+cancer

發(fā)文套路：

1,、從TCGA和GEO上下載甲基化數(shù)據(jù)和RNAseq數(shù)據(jù)

2、對(duì)甲基化數(shù)據(jù)做差異分析，篩選出有差異的基因

3,、在眾多的基因中,，發(fā)現(xiàn)ZNF154最值得后續(xù)分析

4、拿ZNF154到Oncomine中驗(yàn)證,，發(fā)現(xiàn)也是有差異的

5,、甲基化位點(diǎn)與mRNA的表達(dá)水平相關(guān)性分析

6、對(duì)ZNF154做共表達(dá)分析,，對(duì)前100個(gè)共表達(dá)基因做功能分析

7,、收集病人樣本，進(jìn)行定量PCR,，發(fā)現(xiàn)ZNF154也是有差異的

8,、繪制ROC曲線，確定診斷價(jià)值

9,、ZNF154甲基化與臨床性狀的相關(guān)性分析

11,、進(jìn)行Cox回歸分析

11、進(jìn)行生存分析,，確定各位點(diǎn)甲基化水平預(yù)后價(jià)值

最終,，發(fā)現(xiàn)ZNF154能夠作為診斷前列腺癌生物標(biāo)志物，并且能夠預(yù)測(cè)復(fù)發(fā)