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DIANA-LncBase V2來(lái)源于DIANA tools,，是一個(gè)集合了miRNA和lncRNA相關(guān)研究的數(shù)據(jù)庫(kù),，網(wǎng)址鏈接：http://carolina.imis./diana_tools/web/index.php?r=site%2Findex。DIANA tools具體可分為miRGen, lncBase, mirPath, mirExTra, microT-CDS五個(gè)不同的工具模塊,，而我們今天要用的是其中用來(lái)預(yù)測(cè)lncRNA-miRNA結(jié)合關(guān)系的模塊： 進(jìn)入該模塊,，可以發(fā)現(xiàn)，該數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)可以有兩種方式來(lái)看lncRNA和miRNA是否有結(jié)合可能性,，分別是基于實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)的“Exprimental module”和純預(yù)測(cè)的“Prediction module”,。  以Prediction module”為例，我們進(jìn)去可以看到,，可以進(jìn)行miRNA輸入或者lncRNA輸入：  或者,，當(dāng)我們只知道有個(gè)lncRNA的基因組注釋信息時(shí)，也沒(méi)關(guān)系,，只要在開(kāi)始的界面進(jìn)入“Search by location”即可,，輸入具體的位置信息,，也可以： 當(dāng)我們想看看某個(gè)miRNA有哪些可能結(jié)合的lncRNA時(shí)，只要輸入miRNA名字即可：  當(dāng)我們輸入“has-miR-1231”后,，下面即顯示了可能結(jié)合的所有l(wèi)ncRNA信息：  在這里,，可以通過(guò)在左邊“Filters”中設(shè)置Threshold值來(lái)進(jìn)行進(jìn)一步篩選。 通過(guò)點(diǎn)開(kāi)每一個(gè)右邊的拓展選項(xiàng),，可以看到具體的基因信息：  關(guān)于lncRNA注釋信息,，miRNA的序列信息，有哪些“binding category”都可以看到,。點(diǎn)擊每個(gè)的右邊拓展項(xiàng),，可以看到具體的結(jié)合位置信息：  當(dāng)然，如果是通過(guò)“Exprimental module”進(jìn)行的同樣檢索,，還可以看到具體的實(shí)驗(yàn)方法來(lái)源和具體的檢測(cè)樣本來(lái)源等信息：  這是從miRNA的角度,，尋找可能結(jié)合的lncRNA。同樣,，直接輸入lncRNA,，也能反過(guò)來(lái)尋找可能結(jié)合的miRNA：  此外，當(dāng)你想明確地想知道某個(gè)miRNA和lncRNA是否有結(jié)合可能性的時(shí)候,，只要同時(shí)把兩個(gè)輸入就可以了：  |
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