1．呼吸道標(biāo)本細(xì)菌涂片：
痰標(biāo)本革蘭染色是病原學(xué)診斷的基礎(chǔ),，是指導(dǎo)臨床醫(yī)生選用抗生素的常規(guī)方法和手段,，尤其是肺炎鏈球菌和流感嗜血桿菌導(dǎo)致的CAP，痰涂片顯得尤為重要,。痰涂片用于診斷肺炎鏈球菌性CAP的敏感度為62.5%,，但其特異度為91.5%，在診斷流感嗜血桿菌肺炎中其特異度也達(dá)95.1%,，因此有學(xué)者認(rèn)為可以根據(jù)痰涂片快速檢測結(jié)果進(jìn)行針對性的抗感染治療[8],。
2．免疫層析法：
是將特異抗體固定于硝酸纖維素膜上，當(dāng)一端浸入樣品(尿液或血清)后,，樣品中相應(yīng)的抗原即與該抗體發(fā)生特異性結(jié)合后使該區(qū)域顯示一定的顏色,，從而實(shí)現(xiàn)特異性的免疫診斷。在CAP患者中,，該方法主要用于肺炎鏈球菌和肺炎軍團(tuán)菌的抗原檢測,。
肺炎鏈球菌抗原檢測主要檢測的是肺炎鏈球菌上的莢膜抗原C-多糖。對嚴(yán)重肺炎鏈球菌病和菌血癥該方法的敏感度最高,，但在感染早期可能存在假陰性[9]。建議所有的中重度CAP患者均應(yīng)檢查肺炎鏈球菌尿抗原,，其敏感度為68.5%,，特異度為84.2%[10]。其他體液包括痰,、胸腔積液和血清均可檢測到肺炎鏈球菌抗原,，且抗生素治療7d后肺炎鏈球菌尿抗原檢測的陽性率仍可達(dá)到80%～90%[11]。因此,，對于難以獲得充分痰標(biāo)本或在獲得標(biāo)本前已經(jīng)開始應(yīng)用抗生素治療的患者該方法更為適合,。
軍團(tuán)菌也是CAP的重要病原菌，臨床薈萃分析[12]發(fā)現(xiàn),，該檢測方法對血清學(xué)1型嗜肺軍團(tuán)菌具有非常好的特異性,，但其敏感度較低,。尿抗原檢測的優(yōu)點(diǎn)在于標(biāo)本獲取簡便，結(jié)果判定快速,，但陰性結(jié)果不能排除診斷,。
3．PCR技術(shù)：
定量PCR技術(shù)是在以往PCR檢測技術(shù)的基礎(chǔ)上改進(jìn)的新方法，該方法可定性也可進(jìn)行定量檢測,，還可增加CAP患者病毒的檢測率[13],。隨著定量PCR技術(shù)的逐漸成熟，也逐步用于檢測細(xì)菌,，包括肺炎鏈球菌,、流感嗜血桿菌和卡他莫拉菌等[14]，其優(yōu)點(diǎn)在于抗生素不影響其檢測結(jié)果[15],。近年來也開始應(yīng)用該技術(shù)針對非典型病原菌如對肺炎支原體的快速檢測,，其陽性率高于血清學(xué)檢測，且在疾病早期即可檢測到陽性結(jié)果,，為早期病原菌針對性治療提供了可靠依據(jù)[16],。該方法需要的樣本量小且高效快速，同時(shí)抗生素對結(jié)果判斷沒有影響,，有助于早期進(jìn)行針對性的抗感染治療,。
4．經(jīng)氣管鏡標(biāo)本快速現(xiàn)場評估(rapid on site evolution)：
該方法主要用于肺癌患者的快速病理診斷[17]，目前也逐步用于感染性疾病的快速診斷,，尤其是對于免疫低下需要進(jìn)行侵入性操作獲取病原學(xué)診斷的患者,，該方法可以快速有效做出病原學(xué)診斷，如曲霉,、白色念珠菌,、巨細(xì)胞病毒，但對于細(xì)菌感染,，除了MTB和奴卡菌外,，細(xì)胞病理診斷價(jià)值較為有限[18]。
5．基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,，MAIDI-TOF MS)：
是近年來發(fā)展的一種軟電離新型有機(jī)質(zhì)譜,，用于檢測各種特異性片段重量測定個(gè)體，能快速鑒定微生物,，可有效減少菌血癥患者病原菌檢測時(shí)間,，及時(shí)開始抗生素針對性治療，減少患者的病死率和ICU住院時(shí)間[19],。對于血培養(yǎng)陽性的患者,，24h內(nèi)接受適當(dāng)抗生素治療比例增加了11%[20]，明顯優(yōu)于傳統(tǒng)的鑒定方法,。在CAP患者的病原菌檢測中,，99.1%能有效明確其病原菌,，93.4%準(zhǔn)確鑒定到種[21]。但該方法存在局限性,，無法直接檢測來自人體無菌部位的樣品,，由于此類樣品菌量少可能低于檢測限，同時(shí)往往有蛋白雜質(zhì)干擾檢測信號,，因此必須完善質(zhì)譜前處理流程,，以盡量去除蛋白，富集細(xì)菌,，提高檢出率,。
總之，目前針對CAP病原體的檢測方法,，傳統(tǒng)的細(xì)菌痰涂片及微生物培養(yǎng)仍是臨床抗生素選擇的主要依據(jù),，但新的檢測方法在病原菌檢測中也呈現(xiàn)出重要價(jià)值，尤其是對病原菌的早期檢測,。病原學(xué)檢測方法的進(jìn)步為CAP病原學(xué)的診斷提供了新的思路,。
