蒙醫(yī)學將疾病分為陰性病,、陽性病兩大類型,。進而分為“赫依”、“希拉”,、“巴達干”病三種病質(zhì),。這三種病質(zhì)又可分為4門,404病,1116證。經(jīng)過長期臨床實踐,，將這些病證歸納為20種基本性質(zhì),。“赫依”（諸風）病的性質(zhì)是糙,、輕,、寒、細,、強,、動等6種；“希拉”(火,、熱)病的性質(zhì)是脂,、銳、熱,、輕,、臭、泄、濕等7種;“巴達干”(痰,、寒,、濕)病的性質(zhì)是脂、寒,、重,、鈍、柔,、固,、粘等7種。針對這些病質(zhì),蒙醫(yī)采取多種治療方法和手段,。

藥物治療在臨床實踐中,，主要是利用藥物的17種功能（柔、重,、溫,、脂、固,、寒,、鈍、涼,、和,、稀、燥,、淡,、熱、輕,、銳、澀,、動）去克制病證的20種基本性質(zhì),，從而達到治療的目的。其大致情況是：克制“赫依”病質(zhì),，柔→糙,、重→輕、熱→寒,、脂→細,、柔→強、固→動,；克制“希拉”病質(zhì),，淡→脂、鈍→銳、寒涼→溫熱,、和→輕,、稀→臭燥、燥澀→濕泄,；克制“巴達干”病質(zhì),，淡→脂、熱→寒,、輕→重,、銳→鈍、澀→柔,、燥→粘,、動→固。符號“→”表示克制,，前為藥物功能,，后為病證性質(zhì)。

除藥物治療以外,，蒙醫(yī)在長期的臨床實踐中還逐漸摸索出一些適合于地域和民族特點的治療方法與技術(shù),，如飲食療法，外傷與正骨療法,、正腦術(shù),、灸療、放血療法等,。

飲食療法蒙古族人民中流傳著這樣一句諺語:“病之始,，始于食不消；藥之源,，源于百煎水”,。諸如奶食、肉食,、骨湯之類,，只要食用適當，都可以起到滋補強身,、防病治病的作用,。這是古代人從長期的生活實踐中總結(jié)出來的飲食療法的前身。在《蒙古秘史》中,，就有用馬奶酒救治受傷大出血昏厥病人的記載,。元朝飲膳太醫(yī)忽思慧用漢文編著的《飲膳正要》中記載了各種食物、有關(guān)驗方和蒙古族的大量飲食療法,、營養(yǎng)保健膳食等內(nèi)容,。第三卷中按米谷品、獸品、禽品,、魚品,、果品、菜品以及料物共7類,，收載了常用食物計203種,，對這些極易得到的普通食物進行整理、歸納,、闡明了每一種食物的性,、味、有毒無毒以及效用,有相當?shù)膶嵱脙r值,，并附有170幅插圖,。書中還介紹了關(guān)于“養(yǎng)生避忌”、“妊娠食忌”,、“乳母食忌”,、“飲酒避忌”、“四時所宜”,、“五味偏走”等專題,。此外還闡述了“服藥食忌”、“食物利害”,、“食物相反”,、“食物中毒”等問題。此書一直在蒙醫(yī)飲食療法中使用,。