英王陳玉成中埋伏,、撤往桐城后,，他留下的部隊(duì)一萬兩千人,，分成了兩個(gè)部分 - 四千人在集賢關(guān)，八千人在菱湖,。隔天,，湘軍將領(lǐng)鮑超部猛然掩至集賢關(guān)，攻打那里四座陷入孤立的叛軍營壘,。六月七日（差不多是李秀成終于出現(xiàn)在武昌城外時(shí)）,，集賢關(guān)頭三座營壘投降，鮑超部殺光了營壘內(nèi)的三千守軍,。第四座營壘多撐了幾天,，逃不過同樣的下場。攻打這四座營壘時(shí),，鮑超要部隊(duì)只留一個(gè)活口：一名太平軍高階統(tǒng)兵官,，一個(gè)身經(jīng)百戰(zhàn)、受部下愛戴,、深受英王器重的軍官,。鮑超活捉他，把他押到安慶城下予以活活肢解,，讓城里守軍明白反抗的下場,。

鮑超部攻破集賢關(guān)的營壘時(shí)，曾國荃部集中兵力對付戍守菱湖水上通道的十八座營壘,。這些營壘兵力更眾,，比集賢關(guān)的營壘撐了更久，但七月初時(shí)終究糧食用盡,，示意投降,。 為消除他關(guān)于詐降的疑慮，他麾下一名營官建議讓叛軍先繳械,。七月七日,，菱湖營壘的八千叛軍交出所有武器：六千支洋步槍、八千支長矛,、一千支抬槍,、八千支明朝火繩槍，以及兩千匹馬,。

曾國荃不知如何處置這批俘虜,，“悍賊”人數(shù)幾乎和他的圍城總兵力一樣多。那位安排繳械投降的營官再度獻(xiàn)計(jì)，說最好殺光,。曾國荃告訴他：“殺亦要設(shè)法?！庇谑悄俏粻I官提議：開營門,，將俘虜一次帶進(jìn)十個(gè)，逐批砍頭,。他認(rèn)為“只半日可以殺完”,。曾國荃不忍執(zhí)行這項(xiàng)計(jì)劃，于是交給那位營官去辦,。營官回他的兵營準(zhǔn)備,，然后督斬八千名俘虜，據(jù)他自己所述,，“自辰至酉”,，只花了一天。

曾國藩為弟弟的戰(zhàn)國感到非常高興,，又燃起了攻破安慶的希望,。他寫信給曾國荃，建議他想辦法處理掉那八千具尸體,，以免引發(fā)瘟疫,。第二封信則著重于安撫弟弟因?yàn)闅⑷硕鴮?dǎo)致的內(nèi)心的不安。隔了一個(gè)星期之后,，他在第三封信里開始責(zé)備弟弟的過度疑慮：“既已帶兵,，自以殺賊為志，何必以多殺人為悔,？”

然而,，攻城仍無重大進(jìn)展。就在鮑超與曾國荃擊退來援的太平軍（并關(guān)掉城外的市場）時(shí),，有八艘外國船正從河邊給安慶守軍補(bǔ)給,。曾國藩寫信向位于武昌的湖廣總督抱怨，湖廣總督將抱怨信轉(zhuǎn)呈朝廷,。與此同時(shí),，曾國藩命炮艇開始為行經(jīng)安慶的所有外國船護(hù)航，但他也并不敢擊沉外國商船,。

在這件事情上,，北京新成立的總理各國事務(wù)衙門立了大功。通過恭親王奕和卜魯斯的斡旋,，英國官方警告各國商人,，清廷打算攻擊試圖闖越安慶封鎖線的任何船只，如果真發(fā)生此事，英國海軍既不會(huì)保護(hù)他們,，也不會(huì)要求損害賠償,。物資運(yùn)送就此停止。

同時(shí),，在格外酷熱的這一年盛夏,，英王最后一次嘗試解安慶之圍。英王拼死欲救出城里的家人,，城里的守軍則一心想在餓死之前逃出城,。然而，他們并沒有成功,。經(jīng)過七天七夜的殺戮與混亂,、驚慌與刀刃相擊，九月十三日夜,，一切突然結(jié)束,。英王死了替安慶解圍的念頭，放火燒掉集賢關(guān)的營壘,，退走,，讓安慶自求多福。 

幸存的守軍大部分似已在最后那一夜逃出城,。湘軍于九月五日進(jìn)城時(shí),，已無人防守。城里的慘狀,，再怎么身經(jīng)百戰(zhàn),、見慣不幸的人都想象不到。自從外國船不再補(bǔ)給,，就再?zèng)]有糧食運(yùn)進(jìn)城里,。最后，人肉價(jià)格最后漲到每斤半兩錢,。

關(guān)于安慶投降時(shí)該如何處置的問題,，曾國藩告訴曾國荃：“克城以多殺為妥，不可假仁慈而誤大事,，弟意如何,？” 愛民不表示愛那些與叛軍站在同一邊的人民。有人認(rèn)為攻破安慶時(shí),，城里總共幸存約一萬六千人,，其中即使不是全為平民，至少也大部分是平民,。有關(guān)他們后來遭遇的種種記述,，差異主要在曾國藩麾下軍官是否先將女人挑出，再殺光剩下的人。