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【陳巍學(xué)基因】視頻36:KRAS與腫瘤靶向治療

 cobra0537 2023-04-02 發(fā)布于山東

本視頻介紹KRAS基因:

  • 結(jié)構(gòu)與功能

  • 在腫瘤中的變異

  • 對腫瘤靶向用藥的指導(dǎo)作用

  • 設(shè)計針對KRAS基因的靶向藥物的難點,,和已取得的部分進展

視頻時長12分鐘,建議在Wifi條件下觀看:


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歡迎來到【陳巍學(xué)基因】,,我們這個節(jié)目主要是給大家介紹基因組學(xué),,和臨床分子診斷的最新技術(shù)進展。

今天,,會和大家談一下KRAS這個基因,。

之所以要談KRAS這個基因,是因為KRAS在細胞生長的信號調(diào)控當中,,起著一個樞鈕的作用,。上游的EGFR(ErbB1)、HER2(ErbB2),、ErbB3,、ErbB4等細胞表面受體,在接收到了外界信號之后,,會通過RAS蛋白,,把信號傳遞到下游。

而KRAS是RAS蛋白中的重要一員,,KRAS基因的突變,,會直接影響到針對EGFR基因的抗腫瘤藥物的療效。同時KRAS基因是否有突變,,也是腫瘤預(yù)后的一個重要指標,。

正是因為KRAS基因如此重要,所以今天我們就來說一下這個KRAS基因,。

今天,,我們會按照如下順序來講解:

  • 第1,,KRAS的基因,、和蛋白的結(jié)構(gòu)與功能

  • 第2,,KRAS參與的信號通路

  • 第3,,KRAS在腫瘤中的變異

  • 第4,,針對KRAS突變的基因檢測

  • 第5,,研制針對KRAS的藥物,,所面對的難點,和目前的一些研究進展

接下來,我們就按照這5個方面,來進行展開,。

KRAS基因,、和蛋白的 結(jié)構(gòu)與功能

KRAS基因的全名叫Kirsten rat sarcoma viraloncogene homolog,,翻成中文是“Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物”。

在人的基因組當中,,有2個KRAS基因,。一個是KRAS1,,位于第6號染色體的短臂上,;另一個是KRAS2,位于第12號染色體的短臂上,。其中,,KRAS1是一個“假基因”,也就是說它不能被轉(zhuǎn)錄成RNA,,所以它是沒有功能的,。而KRAS2才是“真基因”,是能夠轉(zhuǎn)錄、并且翻譯成蛋白的,,是有生物學(xué)活性的,。我們下文所談的KRAS基因和蛋白,都是指這個“KRAS2”基因和它的蛋白產(chǎn)物,。

KRAS基因?qū)儆赗AS基因家族,。RAS基因家族當中,還有NRAS(neuroblastoma-RAS)和HRAS(Harvey-RAS),。KRAS,、NRAS和HRAS,都參與細胞內(nèi)的信號傳遞,。

KRAS蛋白有2種變體,。這2種變體,是因為第4號外顯子在RNA的剪接過程當中,,有2種不同的剪接方式,,就得到了2種mRNA,進而翻譯出2種蛋白質(zhì)(變體),。這2種蛋白質(zhì)分別被稱為“KRAS4A”和“KRAS4B”,,KRAS4B的表達量明顯多于KRAS4A的表達量,一般情況下,,KRAS4B是KRAS4A的5倍,。

KRAS蛋白質(zhì)有188個氨基酸,它的分子量是21.6KD,。

KRAS蛋白定位在細胞膜的內(nèi)側(cè),,它是通過一個法呢酰基(Farnesyl)的修飾基團,,連到細胞膜上的,。那么,這個法呢?;?,是通過翻譯后的蛋白修飾,在法呢?;D(zhuǎn)移酶的作用下,,加到KRAS蛋白上的。我們后面還會再次講到這個法呢?;男揎?。

KRAS的正常信號通路

在正常細胞當中,細胞膜上的EGFR,、HER2,、ErbB3,、ERbB4等受體單體,在與細胞膜外的配體結(jié)合之后,,就會變成二聚體,。這些二聚體先自身磷酸化,再磷酸化下游的信號蛋白,。其中一條信號通路就是激活Grb2-Shc,,再激活SOS蛋白。SOS蛋白會激活KRAS蛋白,。

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KRAS蛋白在沒有被激活的時候,,是與GDP緊密結(jié)合;在被SOS蛋白激活之后,,轉(zhuǎn)到與GTP結(jié)合,,變成有激酶活性的狀態(tài),。這里GDP是指鳥嘌呤核苷二磷酸,,而GTP是指鳥嘌呤核苷三磷酸。

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與GTP結(jié)合的KRAS蛋白,,就有了磷酸激酶的活性,,進一步激活下游的蛋白。

被激活的下游信號蛋白,,包括:Raf蛋白家族,、PI3K蛋白、PLC-ε,、RALGDS,、TIAM1、RIN1,,這些下游蛋白,。

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這些下游的信號通路打開之后,會進一步激活再下游的信號通路,,進而啟動細胞增殖,、細胞遷移等細胞功能。

KRAS在腫瘤當中的變異

接下來,,我們來說KRAS在腫瘤當中的變異,。

根據(jù)統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),在胰腺癌當中,,61%有KRAS突變;在結(jié)腸癌當中,,43%有KRAS突變,;在子宮內(nèi)膜癌當中,21%有KRAS突變,;在肺腺癌當中,26%有KRAS突變,。也就是說,在上述4種癌癥中,,有高比例的KRAS基因突變,。

在KRAS的基因突變中,,97%是第12號或者第13號氨基酸殘基發(fā)生了突變。其中最主要的是G12D,、G12V,、G13D這三種突變。

KRAS與GDP或者GTP的結(jié)合力是非常強的,,它(KRAS)與GTP結(jié)合的親合系數(shù)在PicoMolar(皮摩爾濃度)級。當KRAS與GDP結(jié)合時候,,沒有激酶活性;而當KRAS與GTP結(jié)合時候,有激酶活性,。野生型的KRAS是與GDP結(jié)合,還是與GTP結(jié)合,,是受到上游信號調(diào)控的,。

當KRAS發(fā)生G12D、G12V,、G13D這幾種突變之后,,KRAS就會一直保持與GTP結(jié)合,也就是說,,KRAS一直保持在有酪氨酸激酶活性的狀態(tài),,并且不斷激活它下游的信號通路。這些下游的信號通路打開之后,,就會刺激細胞增殖、遷移,。

我們打個比方來說明這種突變的后果:KRAS就象是銀行金庫(細胞增殖、遷移能力)的保管員,。正常情況下,,只有銀行行長(上游信號蛋白)帶著鑰匙(激活信號)來,,保管員(KRAS)才能打開金庫(細胞增殖、遷移)?,F(xiàn)在這個金庫保管員(KRAS)偷配了金庫鑰匙,,把金庫大門大開,那么金庫(細胞增殖,、遷移)也就失控了,。

如果一個腫瘤病人的腫瘤當中有KRAS的激活突變,那么針對EGFR的靶向治療藥,,例如:西妥昔,、易瑞沙等,,它們的治療效果,,一般都不會太好,。因為KRAS把藥物對EGFR的抑制作用給繞開了。

并且,,這些有KRAS激活突變的腫瘤病人,,他們的預(yù)后一般也不太好,,生存期往往會明顯短于那些沒有KRAS激活突變的病人。

所以,,腫瘤當中的KRAS基因,,是否有激活突變,,對于預(yù)判EGFR抑制劑類的藥物(的治療)是否會奏效,,很重要,。

正因為如此,,對KRAS基因的激活突變的檢測,現(xiàn)在已經(jīng)是腫瘤靶向藥物的重要伴隨診斷之一,。

針對KRAS基因突變的檢測

2012年的1月,F(xiàn)DA批準Qiagen公司的KRAS突變檢測方法可以用作西妥昔的伴隨診斷,。2015年5月,,F(xiàn)DA批準羅氏公司的KRAS突變檢測方法可以用于轉(zhuǎn)移的結(jié)腸癌的診斷。

中國的廈門艾德公司,、武漢友芝友公司,、武漢海吉力公司、蘇州為真公司等,,都有提供針對KRAS基因激活突變的檢測試劑盒,。

上述這些針對KRAS突變的檢測方法,都是基于實時熒光定量PCR方法的原理,。

開發(fā)針對KRAS藥物所面對的難題,、和一些進展

既然KRAS這么重要,而且KRAS基因上有哪些致癌突變也很清楚,,那么,,為什么到現(xiàn)在為止,還沒有一個直接針對KRAS基因的靶向藥物上市呢,?

困難點在于:

1,、KRAS的作用泛圍很廣,KRAS的正?;钚砸彩窃S多正常細胞功能所需要的活性,如果有一個直接抑制KRAS的藥物,,那么這個藥物的毒性也可能會很大,,副作用也可能會很強。并且,,KRAS與NRAS,、HRAS有很高的同源性,,能抑制KRAS活性的藥物,就很可能會抑制NRAS,、HRAS的活性,。那么,這個藥物的毒性就可能很大,。

第2,,目前已知的KRAS的活性功能域,主要是KRAS與GDP,、或者GTP結(jié)合的那個口袋狀的功能域,。而KRAS與GTP、或者GDP的結(jié)合非常強,,親合系數(shù)達到Pico Molar(皮摩爾濃度,,10^-12)級。而正常細胞里面的GDP與GTP的濃度,,達到了MicroMolar(微摩爾濃度,,10^-6)級。也就是說,,細胞內(nèi)正常的GDP與GTP的濃度,,比與KRAS結(jié)合所需的濃度,高了10的6次方倍,。要做出一種小分子化合物,,其與KRAS的結(jié)合能力,要能與GDP,、或者GTP相匹敵,,是非常難的。

第3,,要設(shè)計一種藥物,,只針對地抑制突變KRAS蛋白的活性,而盡可能少地影響正常KRAS蛋白的活性,,這就需要這種化合物對突變的KRAS有很好的選擇性,。這也是這個藥物設(shè)計當中,所面對的又一個難題,。

上述三點,,就是到目前為止,還沒有直接針對KRAS的靶向藥物上市的主要原因,。

但是,,針對KRAS的藥物設(shè)計,并不是完全沒有進展。

到目前為止,,還是取得了一些階段性的成果,,我們來介紹其中的一些。

第一,、先說選擇性抑制突變KRAS基因的研究結(jié)果,。經(jīng)過研究發(fā)現(xiàn),下面這4個化合物,,

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對有KRAS突變的細胞的半效抑制濃度(IC50),,是對沒有KRAS突變的細胞的半效抑制濃度(IC50)的1/6。那么,,半效抑制濃度“IC50”(halfmaximal inhibitory concentration),,它的濃度值越低,說明這個藥物的抑制效果越好,。

第二,,我們剛才提到,KRAS要定位到細胞膜上,,要通過一個法呢?;幕鶊F,才能定位到細胞膜上,。而KRAS蛋白只有定位到細胞膜上,,它才能較好被其上游信號蛋白所激活,所以,,科學(xué)家考慮是否可以通過抑制法呢?;D(zhuǎn)移酶的活性,來抑制KRAS蛋白的法呢?;?,進而減少其定位到細胞膜上,這樣就可以達到抑制KRAS活性的目的?,F(xiàn)在,,已經(jīng)有一些針對法呢酰基轉(zhuǎn)移酶的化合物被計設(shè)出來,,但是這些化合物在后期的實驗當中,,并不能表現(xiàn)出足夠的對腫瘤的抑制作用。

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第三,,KRAS的正常激活,,需要有SOS蛋白的參與,所以,,另一個設(shè)計思路,,就是設(shè)計針對KRAS-SOS結(jié)合區(qū)域的抑制劑,。這兩個化合物,被發(fā)現(xiàn)能夠抑制KRAS與SOS蛋白的結(jié)合,。

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到目前為止,雖然科學(xué)家針對KRAS做了很多努力,,但是,,還沒有一個針對KRAS的靶向藥物上市。

也因為設(shè)計直接針對KRAS的抑制劑較難,,許多科學(xué)家,,把更多的精力,放到設(shè)計針對KRAS下游的信號通路的靶向藥物當中去,。例如,,設(shè)計針對B-RAF的靶向藥物。

以上是本期節(jié)目的全部內(nèi)容,。謝謝您的收看,,我們下期節(jié)目再見。


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