基因組考古學(xué)（Genome Archaeology）是以基因組為對(duì)象,，利用科學(xué)方法破譯其非編碼DNA和編碼DNA等遺傳物質(zhì)的信息,，探究物種在歷史上所經(jīng)歷的進(jìn)化事件,、外在環(huán)境的變遷和內(nèi)在結(jié)構(gòu)與功能的演變信息及其演變規(guī)律的學(xué)科。

       基因組是指生物體所擁有的編碼DNA（或RNA）,、非編碼DNA（或非編碼RNA）,、線粒體DNA和葉綠體DNA等所有遺傳物質(zhì)的總和。

       學(xué)界主要關(guān)注的是基因組中的編碼DNA（或RNA）,，而將基因組中存在著的大量非編碼DNA（或非編碼RNA）稱之為垃圾基因（junk DNA）,。本基因組考古學(xué)的創(chuàng)意認(rèn)為：基因組中的編碼DNA（或RNA）、非編碼DNA（或非編碼RNA）等遺傳物質(zhì)共同保留著物種在歷史上所經(jīng)歷的進(jìn)化事件,、外在環(huán)境的變遷和內(nèi)在結(jié)構(gòu)與功能的演變等信息,，特別是非編碼DNA（或非編碼RNA）并非垃圾基因，而是物種在歷史演變過程中曾經(jīng)具有某些功能隨后由于演變而被閑置的遺傳物質(zhì)的沉積,，是活生物體內(nèi)的“基因化石”,，是隱藏在生物體內(nèi)的考古學(xué)證據(jù)的寶藏。發(fā)明出適當(dāng)?shù)目茖W(xué)方法,，就可以將這些歷史信息逐步破譯出來,，從而創(chuàng)建一門不同于化石考古學(xué)和古分子考古學(xué)的基因組考古學(xué)新學(xué)科。

       關(guān)鍵詞：基因組考古學(xué),；非編碼 DNA,；垃圾 DNA；基因化石

       “基因組考古學(xué)”是1984年研究生物學(xué)哲學(xué)問題時(shí),，從本人提出來的某種關(guān)于生命本質(zhì)的理論（至今尚未發(fā)表）中推導(dǎo)出來的推論之一,。由于此后一直忙于世俗瑣事，就還沒有把精力集中在這方面作深入研究。2003年8月18~22日,，由浙江大學(xué)承辦的“第十一屆全國(guó)科學(xué)哲學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議”在浙江雁蕩山舉行,，本人在會(huì)議上講的是成果制話題，會(huì)上也有生物學(xué)哲學(xué)主題討論,，促使本人會(huì)后把“基因組考古學(xué)”創(chuàng)意掛在了奉公創(chuàng)新網(wǎng)站（www.fenggong.com）上,，有網(wǎng)友陳新曾經(jīng)在網(wǎng)站上留言予以贊同。由于個(gè)人網(wǎng)站管控方面的繁瑣和自媒體平臺(tái)的崛起,，奉公創(chuàng)新網(wǎng)站的運(yùn)營(yíng)已由本人于幾年前關(guān)閉了,。

       2010年，研究生鄒亞文和我聯(lián)合完成了學(xué)術(shù)論文“基因組考古學(xué)：從現(xiàn)存物種尋找祖先生活的遺跡”,，發(fā)表于“自然辯證法研究”2010年11月第11期上（后面有論文全文圖片）,。段勇老師當(dāng)時(shí)參加了一些研討。

Genome Archaeology：Digging for Vestiges of the Ancestors from the Existing Organisms

ZOU Ya-wen,，F(xiàn)ENG Gong

（College of Humanities and Development,，China Agricultural University，Beijing,，100193,，China）

Abstract：Based on the fact that in the genome there are genes which can code for RNAs and numerous non-coding DNAs，the authors consider that：both genes and non-coding DNAs of a species’ genome contain the information of (1)evolution events that species underwent,(2)changes of the environment,(3) shifts of the organism’s structure and function. These information can be decoded from genome if some proper approaches are devised,，thus gives rise to genome archaeology, a new discipline which is completely different from fossil archaeology and ancient DNA archaeology． 

Key words：genome archaeology; gene; non-coding DNAs; junk DNA; gene fossils     

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