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Gut: 轉(zhuǎn)錄和免疫表型分析揭示結(jié)直腸癌發(fā)生的分子和免疫學(xué)特征

 子孫滿堂康復(fù)師 2022-12-14 發(fā)布于黑龍江

來(lái)源:生物谷原創(chuàng) 2022-12-14 15:45

在結(jié)直腸癌(CRC)的發(fā)展中,,腺瘤-癌序列的范例通常集中在癌細(xì)胞上;然而,現(xiàn)在清楚的是,,癌癥進(jìn)展涉及轉(zhuǎn)化細(xì)胞與其周?chē)h(huán)境之間的異源相互作用,。

結(jié)直腸癌(CRC)的發(fā)展中,腺瘤-癌序列的范例通常集中在癌細(xì)胞上,;然而,,現(xiàn)在清楚的是,癌癥進(jìn)展涉及轉(zhuǎn)化細(xì)胞與其周?chē)h(huán)境之間的異源相互作用,。到目前為止,,大多數(shù)研究都依賴于結(jié)直腸癌晚期的批量圖譜來(lái)識(shí)別癌癥驅(qū)動(dòng)基因并定義與癌癥相關(guān)的生物學(xué)過(guò)程。

圖片來(lái)源:https://pubmed.ncbi.nlm./36442992/

近日,,來(lái)自萊頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院病理學(xué)系的研究者們?cè)贕ut雜志上發(fā)表了題為“Transcriptomic and immunophenotypic profiling reveals molecular and immunological hallmarks of colorectal cancer tumourigenesis”的文章,,該研究揭示了早期結(jié)直腸癌腫瘤發(fā)生的分子和免疫學(xué)景觀,。研究者確定了與疾病進(jìn)展密切相關(guān)的生物標(biāo)志物,,以及可在臨床環(huán)境中利用的有針對(duì)性的免疫過(guò)程。

對(duì)結(jié)直腸癌(CRC)的逐步發(fā)展和進(jìn)展的生物學(xué)洞察對(duì)于開(kāi)發(fā)針對(duì)這種疾病的早期發(fā)現(xiàn)和最佳臨床處理的量身定制的方法是必不可少的,。在本研究中,,研究者的目標(biāo)是剖析伴隨著結(jié)直腸癌惡變的轉(zhuǎn)錄和免疫學(xué)改變,并通過(guò)對(duì)PT1結(jié)直腸癌樣本的空間圖譜來(lái)識(shí)別臨床相關(guān)的生物標(biāo)記物,。

研究者在8個(gè)PT1癌組織上使用數(shù)字空間圖譜(GeoMx)來(lái)研究不同組織學(xué)區(qū)域的上皮和間質(zhì)節(jié)段的基因表達(dá),,包括正常黏膜、低度和高度不典型增生和癌,。連續(xù)的組織切片通過(guò)成像質(zhì)量細(xì)胞儀進(jìn)行分析,,以揭示免疫環(huán)境。最后,,對(duì)公開(kāi)獲得的單細(xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,,以確定相關(guān)轉(zhuǎn)錄本的細(xì)胞來(lái)源。

對(duì)PT1結(jié)直腸癌樣本中不同區(qū)域的基因表達(dá)的比較發(fā)現(xiàn),,在不同的組織結(jié)構(gòu)中,,差異表達(dá)的基因在上皮(n=1394個(gè)基因)和間質(zhì)段(n=1145個(gè)基因)中。通路分析發(fā)現(xiàn),,在惡性轉(zhuǎn)化過(guò)程中,,炎癥反應(yīng)較早發(fā)生,典型的表現(xiàn)為基因信號(hào)上調(diào),,如先天免疫感應(yīng),。

研究者檢測(cè)到骨髓細(xì)胞浸潤(rùn)增加,巨噬細(xì)胞通過(guò)發(fā)育不良從正常組織向癌癥轉(zhuǎn)移,,從親炎癥的HLA- DR+CD204 -巨噬細(xì)胞向HLA- DR - CD204+免疫抑制亞群轉(zhuǎn)移,,同時(shí)CD47/ SIRPα“不吃我信號(hào)”上調(diào)。

早期結(jié)直腸癌候選生物標(biāo)志物的差異蛋白豐度

圖片來(lái)源:https://pubmed.ncbi.nlm./36442992/

總之,這項(xiàng)研究展示了數(shù)字空間剖面圖在早期結(jié)直腸癌中的應(yīng)用,,并對(duì)伴隨結(jié)直腸癌逐步進(jìn)展的生物學(xué)過(guò)程提供了見(jiàn)解,。本研究的結(jié)果表明先天免疫在結(jié)直腸癌發(fā)病中起著重要作用。此外,,該研究的方法提供了一個(gè)框架,,用于識(shí)別在結(jié)直腸癌發(fā)生過(guò)程中持續(xù)變化的生物標(biāo)記物。這些見(jiàn)解為改善早期結(jié)直腸癌患者的臨床管理鋪平了道路,。(生物谷 Bioon.com)

參考文獻(xiàn)

Jessica Roelands et al. Transcriptomic and immunophenotypic profiling reveals molecular and immunological hallmarks of colorectal cancer tumourigenesis. Gut. 2022 Nov 28;gutjnl-2022-327608. doi: 10.1136/gutjnl-2022-327608.


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