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諾獎(jiǎng)得主斯萬特·帕博訪談

 【風(fēng)雅軒】 2022-11-04 發(fā)布于廣東

?摘自《穿越古今:海外考古大家訪談》

李水城 主編

溫成浩 副主編

上海古籍出版社

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斯萬特·帕博(1955年-)是世界著名進(jìn)化遺傳學(xué)家,現(xiàn)任美國國家科學(xué)院,、瑞典皇家科學(xué)院等多個(gè)國家科學(xué)院的院士以及中國科學(xué)院研究生院,、萊比錫大學(xué)等多所著名大學(xué)的名譽(yù)教授。迄今,,他已做過400多次頗具影響力的演說,,并獲得多項(xiàng)科學(xué)獎(jiǎng),包括1992年德國科學(xué)基金會(huì)授予他的德國最高研究榮譽(yù)獎(jiǎng)——萊布尼茨獎(jiǎng),。1997年,他開始擔(dān)任德國馬普學(xué)會(huì)萊比錫進(jìn)化人類學(xué)研究所所長至今,。帕博教授的研究工作和學(xué)術(shù)進(jìn)展始終被世界著名媒體所關(guān)注,,如《紐約時(shí)報(bào)》《時(shí)代》《新聞周刊》《經(jīng)濟(jì)學(xué)家》等均對(duì)他有過報(bào)導(dǎo)。帕博教授在古dna領(lǐng)域做了大量的研究工作,,其研究對(duì)象涉及樹獺,、洞熊、恐鳥,、猛犸象和尼安德特人等,。他曾在cell,、nature、science,、pnas等重要刊物發(fā)表了一系列研究成果,,并在美國芝加哥田野考古博物館(field museum)、舊金山展覽館及紐約自然歷史博物館展出,。鑒于帕博教授在科學(xué)研究上的杰出貢獻(xiàn),,2007年,他被《時(shí)代》雜志評(píng)選為“全球最具影響力的一百人”之一,。2008年,,他被new scientist評(píng)選為8位年度科學(xué)英雄之一。2009年2月,,他所引領(lǐng)的科研團(tuán)隊(duì)已初步完成超過30億堿基對(duì)序列的尼安德特人基因組,。無疑,這個(gè)科學(xué)項(xiàng)目的完成將使人們對(duì)現(xiàn)代人的進(jìn)化史有更新的認(rèn)識(shí),。

2022年,,斯萬特·帕博榮獲諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。

本文選自上海古籍出版社《穿越古今:海外考古大家訪談》,,采訪者付巧妹,,師從斯萬特·帕博教授,在德國馬普進(jìn)化人類學(xué)研究所獲得博士學(xué)位,,現(xiàn)為中國科學(xué)院古脊椎動(dòng)物與古人類研究所古dna實(shí)驗(yàn)室主任,、研究員。

付巧妹(以下簡稱付) :古dna研究至2009年已走過20多年的歷程,。您不僅是這一歷史進(jìn)程的見證者,,更是這一領(lǐng)域的先驅(qū)和奠基者。2009年5月,,中國科學(xué)院與德國馬普學(xué)會(huì)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室在北京古脊椎動(dòng)物與古人類研究所掛牌成立,,它將有力地推動(dòng)人類起源與演化的研究。值此之際,,有機(jī)會(huì)對(duì)您進(jìn)行采訪,,我感到十分榮幸。20世紀(jì)80年代,,“分子克隆古埃及木乃伊dna”是您踏入古dna研究領(lǐng)域的第一步,。這一工作不僅引起世界的關(guān)注,也是人類歷史上首次將克隆技術(shù)應(yīng)用于古dna的創(chuàng)舉,。請(qǐng)問,,是什么原因促使您投身這一特殊的領(lǐng)域?在研究過程中,,您遇到的挑戰(zhàn)主要有哪些,?

斯萬特·帕博(以下簡稱帕博):這與我的求學(xué)經(jīng)歷有關(guān),。在攻讀醫(yī)藥學(xué)博士和分子生物學(xué)博士之前,我研究的是埃及學(xué),。因此,,我清楚在埃及的博物館中收藏了數(shù)以千計(jì)的木乃伊,而且每年還有近百件新的木乃伊被發(fā)現(xiàn),。另外,,細(xì)菌克隆dna在當(dāng)時(shí)是相當(dāng)新的技術(shù),還沒有相關(guān)文獻(xiàn)表明這個(gè)技術(shù)曾被應(yīng)用于考古遺存,。顯而易見,,將dna克隆應(yīng)用于木乃伊是一個(gè)值得嘗試研究和應(yīng)用的領(lǐng)域。當(dāng)時(shí),,最大的挑戰(zhàn)是如何證明木乃伊中的dna歷經(jīng)數(shù)千年仍能存在,。主要的證據(jù)來自兩個(gè)方面:顯微鏡下觀察到木乃伊細(xì)胞核中存在被染色的dna;通過細(xì)菌成功克隆了從木乃伊組織中提取的dna,,并在所克隆的dna中發(fā)現(xiàn)了人類的dna,。盡管當(dāng)時(shí)我還不知道dna的污染程度。但現(xiàn)在看來,,木乃伊受到外源人類dna的污染,,其可能性還是存在的。

付:當(dāng)您的分子克隆古埃及木乃伊dna研究引起世界學(xué)術(shù)界關(guān)注之時(shí),,20世紀(jì)80年代末,,您帶領(lǐng)您的團(tuán)隊(duì)毅然轉(zhuǎn)向了滅絕物種的系統(tǒng)發(fā)育及其與現(xiàn)存相鄰物種之間關(guān)系等領(lǐng)域的研究。請(qǐng)問,,這又是什么原因促使您作出研究方向重大轉(zhuǎn)移的決定,?在這個(gè)新的學(xué)術(shù)領(lǐng)域,,您有哪些振奮人心的成果呢,?

帕博:我發(fā)現(xiàn),,人類dna普遍存在于出土及館藏的古代遺物中,,若采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(pcr)擴(kuò)增技術(shù)研究古人類dna,其污染問題在所難免,,其所得結(jié)果也很難令人信服,。然而,,將研究對(duì)象改為非人類物種時(shí),,外源人類dna的污染則不難鑒別和剔除,。此時(shí),利用pcr技術(shù),,擴(kuò)增特定dna片段,開展這些物種的研究,,應(yīng)該沒有難以逾越的困難,。鑒于此,,我開始將注意力轉(zhuǎn)向了滅絕動(dòng)物,并應(yīng)用相關(guān)的技術(shù),,探索其與現(xiàn)存動(dòng)物之間的遺傳關(guān)系,。多年來,我們?cè)谶@一領(lǐng)域取得了一系列令人矚目的成果,。例如,,遠(yuǎn)古時(shí)代,南美有一種與澳大利亞滅絕袋狼相近的有袋動(dòng)物,。然而,,研究發(fā)現(xiàn),相比于這種南美的有袋類動(dòng)物,,澳大利亞的滅絕袋狼與當(dāng)?shù)噩F(xiàn)存有袋類動(dòng)物的關(guān)系更加緊密,。再如,新西蘭有一種不能飛行的滅絕恐鳥,,我們的研究發(fā)現(xiàn),,新西蘭當(dāng)?shù)氐臒o翼鳥,即現(xiàn)存的不能飛行鳥,,較之這種當(dāng)?shù)販缃^的恐鳥更接近于澳大利亞及非洲現(xiàn)存的不能飛行鳥,。這表明滅絕恐鳥與現(xiàn)存無翼鳥盡管都在新西蘭,但兩者可能擁有不同的祖先,。再如,,加利福尼亞沙漠百年以前即有袋鼠存在,依據(jù)博物館的記錄和百年前的地圖,,我們確定了博物館收藏的近百件袋鼠所捕獲的地點(diǎn),,再選取同一地點(diǎn)的現(xiàn)存袋鼠,首次通過dna分析,,揭示了種群隨時(shí)間的遺傳變化規(guī)律,。

付:1997年以來,您的研究又主要轉(zhuǎn)向了尼安德特人基因組及其遺傳關(guān)系,。您為何作出這一選擇,?它是否有助于解答現(xiàn)代人的起源問題?根據(jù)已有的研究,,您如何認(rèn)識(shí)現(xiàn)代人和尼安德特人之間的關(guān)系,?

帕博:利用古dna技術(shù),探索人類的進(jìn)化過程,,始終是我的夢(mèng)想,。作為最接近現(xiàn)代人的滅絕旁系親屬,尼安德特人無疑是研究這一進(jìn)程的理想對(duì)象。通過比較現(xiàn)代人自身和尼安德特人的dna序列,,我們可以了解,,人類基因組在近幾十萬年里所發(fā)生的變化。而這些遺傳變化的背后,,應(yīng)該隱藏著它對(duì)人類文化和技術(shù)發(fā)展的推動(dòng)作用,。至2009年,我們已完成了尼安德特人線粒體dna的研究,。以往的研究似乎表明,,尼安德特人線粒體dna對(duì)現(xiàn)代人線粒體dna沒有明顯貢獻(xiàn)。目前,,我們正在分析整個(gè)尼安德特人的基因組,,相信它最終能夠全面揭示尼安德特人與現(xiàn)代人之間的遺傳關(guān)系。其中,,最為關(guān)鍵的是,,它能告訴我們,究竟是尼安德特人的基因?qū)ΜF(xiàn)代人的遺傳變異有一定貢獻(xiàn),,還是現(xiàn)代人祖先對(duì)他們的基因庫有所貢獻(xiàn),?我相信,往后的幾個(gè)月里,,我們的研究將有突破性的進(jìn)展,。


付:古dna分析中,真實(shí)性至關(guān)重要,。您是如何確保尼安德特人dna的真實(shí)性的,?

帕博:首先,我們的dna分析是在極其清潔的環(huán)境下進(jìn)行的,,以避免實(shí)驗(yàn)室內(nèi)引入dna的污染,。例如,在專用實(shí)驗(yàn)室內(nèi)提取dna,,實(shí)驗(yàn)室設(shè)備皆要經(jīng)過嚴(yán)格的消毒處理,;每天用紫外線照射實(shí)驗(yàn)室;實(shí)驗(yàn)室人員必須穿防護(hù)服等,。不難理解,,這些措施仍不能消除已存在于樣品內(nèi)的dna污染,所以必須對(duì)dna的受污染程度作認(rèn)真的評(píng)估,。

業(yè)已證明,,尼安德特人基因組的大部分片段與現(xiàn)代人相近,但其線粒體dna則與現(xiàn)代人之間存在一定差異,。這樣,,分析尼安德特人線粒體基因組中不同于現(xiàn)代人的位點(diǎn),,即可評(píng)估樣品所提取線粒體dna的污染程度,進(jìn)而判斷該樣品線粒體dna分析的有效性,。一般說來,,根據(jù)已知線粒體dna的污染程度,,尚可推算內(nèi)源的核dna含量,。然而,由于線粒體dna與核dna的污染程度不一定相同,,為了確保分析的可靠性,,通常還需要采用其他方法驗(yàn)證核dna的污染程度,例如,,分析尼安德特人女性骨骼樣品時(shí),,擬尋找她是否有y染色體dna。若有,,則可確定存在男性污染,,這是因?yàn)槲ㄓ心行圆糯嬖趛染色體。目前,,我們正在致力于探明尼安德特人核基因組中不同于現(xiàn)代人的位點(diǎn),。相信在不久的將來,人們根據(jù)這些位點(diǎn)的分析,,即可直接評(píng)估有無外來核dna的污染,。

付:當(dāng)前,您所開展的研究項(xiàng)目是完成尼安德特人的完整基因組序列,,它對(duì)于認(rèn)識(shí)人類進(jìn)化史具有難以估量的意義,。請(qǐng)問,完整的基因組序列,,比如人類和黑猩猩的完整基因組序列,,能提供哪些重要的信息?當(dāng)然,,人們應(yīng)該更關(guān)心尼安德特人完整基因組序列的工作進(jìn)展和具體意義,。

帕博:首先,完整的基因組序列能夠成為生物學(xué)家的工具,。生物學(xué)家可以使用計(jì)算機(jī)和互聯(lián)網(wǎng),,分析基因組中任一感興趣的片段或結(jié)構(gòu),而不需要再次進(jìn)行繁瑣的基因測(cè)序,。我們擁有共同的祖先,,即4百萬年到7百萬年前的猿類。而不同基因組的比較,,如人類基因組與黑猩猩或其他猿類基因組的比較,,可望了解到基因組發(fā)生變化的具體位點(diǎn)和變化規(guī)律,。假如人類的基因組不同于黑猩猩的基因組,則表明人類基因組確實(shí)發(fā)生了不可忽視的變化,。具體說來,,欲標(biāo)定進(jìn)化分支上人類所相應(yīng)的基因變化,尼安德特人完整基因組的研究顯然具有極為重要的意義,。如果早在尼安德特人出現(xiàn)之前,,一些人類基因已經(jīng)發(fā)生了變化,則表明現(xiàn)代人與尼安德特人的基因序列相近,。反之則表明,,較之于現(xiàn)代人,尼安德特人更接近于猿,。需要指出的是,,尼安德特人完整基因組的研究,還可以作為一種新的方法和新的思路,,以探尋人類基因組中受正向選擇(物種受外界環(huán)境的影響,,在已突變的基因中篩選,淘汰不適應(yīng)環(huán)境的基因,,選擇可有效適應(yīng)環(huán)境的基因)影響的區(qū)域,。即將尼安德特人基因組與現(xiàn)代人及近親物種的基因組進(jìn)行對(duì)比,了解那些與人類進(jìn)化密切相關(guān)并保留于現(xiàn)代人中的基因區(qū)域,。


付:目前,,您還致力于研究一些特定基因,如對(duì)現(xiàn)代人類語言具有重要作用的foxp2基因,。請(qǐng)您解釋一下,,判定foxp2基因與人類語言相關(guān),其根據(jù)是什么,?尼安德特人的foxp2變異是否與現(xiàn)代人相同,?如果是,是否意味尼安德特人具有說話的能力,?

帕博:現(xiàn)代人的foxp2基因中,,任一染色體的突變都將導(dǎo)致嚴(yán)重的語言障礙。諸如口齒不清,;無法區(qū)分一些基本音節(jié),;不能理解語法和句子等。此外,,foxp2基因表達(dá)蛋白的演變也十分重要,,應(yīng)給予關(guān)注。事實(shí)上,,所有哺乳動(dòng)物皆保留有foxp2基因表達(dá)的蛋白,。不過,,現(xiàn)代人的蛋白中,已有兩個(gè)氨基酸發(fā)生了變化,。最近的研究表明,,尼安德特人foxp2基因的表達(dá)蛋白同樣具有相似的變化。由此可推測(cè),,這兩個(gè)氨基酸的變化要么發(fā)生在現(xiàn)代人和尼安德特人分化之前,,要么是早期現(xiàn)代人將其遺傳給了較晚的尼安德特人。這些氨基酸是否對(duì)語言很重要呢,?最近,,我們所做的相關(guān)實(shí)驗(yàn)給出了肯定答案。首先,,將老鼠的foxp2基因作了改動(dòng),讓其表達(dá)出本質(zhì)上與現(xiàn)代人一樣的foxp2蛋白,,其結(jié)果不僅促使老鼠發(fā)出了不同聲音,,也增強(qiáng)了這些老鼠腦細(xì)胞之間的聯(lián)系,并導(dǎo)致其功能發(fā)生變化,。盡管這些變化的機(jī)制不甚清晰,,但仍可通過動(dòng)物模型去探索。我堅(jiān)信,,這些方面的研究將會(huì)取得更多的進(jìn)展,。然而,這些結(jié)果并非意味著,,擁有相同foxp2表達(dá)蛋白的尼安德特人能像我們一樣說話,。目前,人們對(duì)語言的遺傳背景知之甚少,,現(xiàn)在假設(shè)或推測(cè)尼安德特人能夠說話還為時(shí)尚早,。應(yīng)該說,還有許多不清楚的基因?qū)φZ言有著重要影響,。一旦有關(guān)未知基因被破解了,,不僅可檢驗(yàn)?zāi)岚驳绿厝嘶蚪M序列中是否存在相似的基因,還有望解答他們能否說話的問題,。

付:現(xiàn)如今,,您引領(lǐng)著馬普學(xué)會(huì)萊比錫進(jìn)化人類學(xué)研究所的進(jìn)化遺傳學(xué)系。您認(rèn)為遺傳學(xué)系中什么問題至關(guān)重要,?不同背景的科學(xué)家如何解決這個(gè)問題,?

帕博:事實(shí)上,我們的工作和所里大多數(shù)專家一樣,,都注重探索現(xiàn)代人與近親物種間的相同和不同之處,。這里的近親物種主要指現(xiàn)存猿類和滅絕旁系(如古老的尼安德特人及其他古人類),。我們的研究內(nèi)容主要有兩大方面:一方面,比較現(xiàn)代人和近親物種基因組,;另一方面,,分析不同組織的不同基因所產(chǎn)生的核糖核酸(rna)含量,探討相關(guān)基因的活性,。目前,,我們已開始采用基因組測(cè)序、微陣列,、rna高通量測(cè)序/質(zhì)譜高通量分析蛋白質(zhì)等一系列方法,,研究相關(guān)基因表達(dá)蛋白的含量。

付:2009年5月,,中國科學(xué)院與德國馬普學(xué)會(huì)人類演化和科技考古聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室在北京正式掛牌成立,,有關(guān)學(xué)術(shù)界對(duì)此表示了高度關(guān)注。請(qǐng)您結(jié)合古dna和食譜研究,,談?wù)剬?duì)這一合作前景的看法,。

帕博:中國科學(xué)院與德國馬普學(xué)會(huì)人類演化和科技考古聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室的成立,讓我激動(dòng)不已,。對(duì)我們而言,,這是一個(gè)與中國科學(xué)院,尤其是中國科學(xué)院古脊椎古動(dòng)物與古人類研究所,、中國科學(xué)院研究生院的科學(xué)家們一起工作的極好機(jī)會(huì),。這兩個(gè)機(jī)構(gòu)擁有獨(dú)一無二的材料和專長,并一直利用這些材料和專長詳盡地解答中國甚至整個(gè)世界的人類進(jìn)化問題,。我深信,,聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室將會(huì)發(fā)展成為一個(gè)卓越的人類進(jìn)化科學(xué)研究中心。中國科學(xué)院與馬普學(xué)會(huì)建立的聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,,將使雙方的科學(xué)家彼此緊密聯(lián)系,,共同研究重大課題。與此同時(shí),,聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室還將注重培養(yǎng)dna技術(shù),、食譜分析和石器微痕分析方面的年輕科學(xué)家。不難理解,,化石樣品可有效地開展古代食譜和dna分析,,并可從不同的側(cè)面了解樣品的保存情況。當(dāng)然,,最為重要的是:聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室可望在中國境內(nèi)古人類的進(jìn)化方面不斷獲得令世人矚目的重大成果,。

付:您如何認(rèn)識(shí)中國境內(nèi)人類化石dna測(cè)序的可能性,例如北京人,?

帕博:我相信,,中國境內(nèi)的一些人類化石中,,應(yīng)含有足以提取并用于分析的dna。和歐洲及亞洲其他地區(qū)一樣,,只有dna保存得足夠好的遺址才有可能提取到dna,。因此,我們首先要著手尋找這些遺址,。一般而言,,低于20萬年或10萬年的人類化石很可能存在dna。北京人雖不在其中,,但其后的人類化石中,,其dna仍可讓我們了解到中國境內(nèi)人類的進(jìn)化歷程。

付:最后,,對(duì)于有興趣研究古dna的年輕一代學(xué)者,,您可否給些建議?

帕博:古dna研究不僅需要學(xué)習(xí)大量的技術(shù),,還需要在洞察學(xué)術(shù)前沿問題的基礎(chǔ)上,,畢生致力于相關(guān)技術(shù)的改進(jìn)。因此,,我對(duì)有志于從事古dna研究的年輕學(xué)者的建議是:不僅要研究化石,而且還要具備堅(jiān)實(shí)的分子生物學(xué)知識(shí)和技能,。我還認(rèn)為,,學(xué)生和青年科學(xué)家應(yīng)該認(rèn)真思考他們工作中所遇到的問題,并能對(duì)他們的教授和其他學(xué)者的觀點(diǎn)提出質(zhì)疑,。從我個(gè)人的經(jīng)驗(yàn)而言,,一個(gè)團(tuán)隊(duì)最好的發(fā)展,即取得最大進(jìn)步的最好方式是:每個(gè)人都可以對(duì)相關(guān)項(xiàng)目進(jìn)行討論,、提出問題和發(fā)表意見,。

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