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ctDNA

 patrickliuzhen 2022-09-14 發(fā)布于上海

KEY POINT

對(duì)112例PDAC患者的ctDNA和66例患者的組織DNA進(jìn)行NGS測(cè)序分析,評(píng)估突變數(shù)量,、ctDNA百分比,、ctDNA與組織DNA的一致性以及ctDNA與預(yù)后的相關(guān)性;

PDAC患者ctDNA中最常見(jiàn)的突變基因是TP53和KRAS,;晚期PDAC患者ctDNA突變的數(shù)量明顯高于可手術(shù)切除病灶的患者,;ctDNA與組織DNA中主要驅(qū)動(dòng)基因突變一致;ctDNA和轉(zhuǎn)移灶組織DNA突變一致性顯著高于原發(fā)灶,;高ctDNA水平是晚期PDAC生存期短的獨(dú)立預(yù)后因素,;

研究結(jié)果顯示,晚期PDAC患者的ctDNA突變可以同時(shí)指導(dǎo)臨床用藥及患者預(yù)后,。

在胰腺癌中,,80%-90%的患者屬于胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)。大多數(shù)PDAC患者在診斷時(shí)已處于疾病晚期,,只有15-20%的PDAC患者在確診時(shí)被認(rèn)為是可以進(jìn)行手術(shù)治療的,,這是導(dǎo)致PDAC死亡率高居不下的重要原因[1]。

5-氟尿嘧啶,、亞葉酸鈣,、伊立替康、奧沙利鉑(FOLFIRINOX)方案和吉西他濱聯(lián)合白蛋白紫杉醇的多藥全身化療可以明顯改善患者的生存率,,但中位無(wú)進(jìn)展生存期和總生存期仍有待提高[2],。

除了手術(shù)和化療,靶向治療也逐漸走向人們的視野,。2020年NCCN指南推薦將奧拉帕利用于攜帶gBRCA基因突變的轉(zhuǎn)移胰腺癌患者的維持治療,。此外,胰腺癌中最常見(jiàn)的突變基因?yàn)镃DKN2A,、SMAD4,、TP53和KRAS,相關(guān)信號(hào)通路的改變可以幫助臨床更好的明確患者胰腺癌的發(fā)生發(fā)展機(jī)制,,但尚未直接應(yīng)用于臨床治療[3],。

本研究利用NGS技術(shù)得到了PDAC患者中ctDNA的突變譜,評(píng)估了組織和血液中DNA突變的一致性和ctDNA對(duì)臨床用藥及預(yù)后的指導(dǎo)意義[4],。

1,、PDAC的ctDNA和組織樣本基因組突變譜

本研究納入了112例PDAC患者,其中94名晚期PDAC患者,,18例手術(shù)患者(10例術(shù)前取樣,,8例術(shù)后取樣)。112名患者ctDNA中總共檢出了194個(gè)突變位點(diǎn),,78例患者檢出了超過(guò)1個(gè)突變位點(diǎn),,34例陰性樣本。

最常見(jiàn)的突變基因是TP53(46%,,N=51),、KRAS(44%,N=49),、CDKN2A(7%,,N=8)和GNAS(7%,N=8),。配對(duì)的組織樣本共有66例,,最常見(jiàn)的突變基因是KRAS(91%,N=60),、TP53(77%,,N=51)和CDKN2A/B(55%,,N=36)。

胰管腺癌基因突變的發(fā)生率

2,、相比于可手術(shù)切除病灶的患者,,

晚期PDAC患者有更高的ctDNA突變率

75%的晚期PDAC患者有檢出基因突變,50%的可手術(shù)患者體內(nèi)檢出突變,。相比于可手術(shù)切除病灶的患者,,晚期PDAC患者有更高的ctDNA突變數(shù)(2 vs. 0.5,P= 0.04),、最大ctDNA突變頻率(0.4 vs. 0.0,,P=0.02)和總ctDNA突變頻率(0.6 vs. 0.0,P= 0.007),。

在66例患者中,,4例患者(6.1%)ctDNA和組織DNA突變基因一致,31例患者(47%)部分一致(有1個(gè)相同的基因突變),;不同樣本類(lèi)型中,,TP53和KRAS總基因組一致性為61%和52%。

3,、晚期PDAC患者的ctDNA分析結(jié)果顯示,,ctDNA水平越高,生存期越短

生存分析共納入了94例晚期PDAC患者,,中位隨訪時(shí)間為18.2個(gè)月,。在單變量分析中,ctDNA中KRAS基因突變的患者具有更短的生存期(7.5個(gè)月 vs. 11.4個(gè)月,,P=0.03),,高水平的ctDNA突變頻率(≥0.6%)與更差的OS相關(guān)(6.3個(gè)月 vs. 11.7個(gè)月,P=0.001),;多變量分析結(jié)果顯示,,高水平的ctDNA突變頻率和至少進(jìn)行過(guò)1次全身治療與更差的OS顯著相關(guān)(P=0.001)。

4,、案例討論:ctDNA與PDAC靶向治療選擇

患者ID:111,,男,83歲,,局部晚期PDAC伴背腹部疼痛(ECOG-PS=2),。CT掃描顯示胰體6.5 X 3.2厘米腫塊,擴(kuò)散至腹膜后腔,,侵犯主動(dòng)脈,、腹腔動(dòng)脈、胰管,未見(jiàn)膽道梗阻,。組織活檢失敗,,血漿ctDNA顯示EGFR G1022S、GNAS R201C,、KRAS G12D,、MTOR D258fs和NF1 D1976fs位點(diǎn)突變。

患者由于年齡較大,,未進(jìn)行化療;基于ctDNA分析結(jié)果,,患者體內(nèi)存在多個(gè)MEK通路的激活突變,,因此選擇曲美替尼進(jìn)行一線治療?;颊咧委熜Ч己?,疼痛減輕,15周時(shí)PET-CT結(jié)果顯示腫瘤無(wú)進(jìn)展,,CA19-9水平顯著降低,。

治療19周后再次進(jìn)行血漿ctDNA檢測(cè),結(jié)果顯示NF1的突變水平下降,,未見(jiàn)EGFR,、GNAS、KRAS和MTOR基因突變,。治療持續(xù)大于26周,,患者耐受性良好。

結(jié) 論

本研究利用NGS技術(shù)得到了PDAC患者中ctDNA的突變譜,,評(píng)估了組織和血漿中DNA突變的一致性和ctDNA對(duì)臨床用藥及預(yù)后的指導(dǎo)意義,,得出的主要結(jié)論有:

1

大多數(shù)PDAC患者(70%)體內(nèi)存在基因突變,超過(guò)40%的患者ctDNA中有TP53或KRAS突變,;

2

晚期PDAC患者ctDNA突變的數(shù)量明顯高于可手術(shù)切除病灶的患者,;

3

ctDNA與組織DNA中主要驅(qū)動(dòng)基因突變一致;

4

ctDNA與轉(zhuǎn)移灶組織DNA突變一致性顯著高于原發(fā)灶,;

5

高ctDNA突變水平是晚期PDAC患者生存期較短的獨(dú)立預(yù)后因素,。

該研究表明,ctDNA狀態(tài)可以指導(dǎo)胰腺導(dǎo)管腺癌患者的轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)以及術(shù)后生存期預(yù)測(cè),。同時(shí)表明,,MEK信號(hào)通路多個(gè)基因的突變,可能導(dǎo)致胰腺導(dǎo)管腺癌患者對(duì)MEK抑制劑敏感,,還需要更大范圍的臨床試驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,。

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