在明朝時(shí)期，也就是北元時(shí)期,，呼市及周邊地區(qū)的蒙古部落比較強(qiáng)大,，現(xiàn)呼市的創(chuàng)建人阿拉坦汗就曾兵臨北京城下，威脅明朝達(dá)成“隆慶議和”,，藏傳佛教的格魯派也是在阿拉坦汗的推動(dòng)下傳播到蒙古各地。

    呼市周邊的烏蘭察布市和錫林郭勒盟北元時(shí)期是察哈爾部（包括張家口的部分）,，察哈爾部首領(lǐng)是眾部蒙古的宗主,。最后一任察哈爾大汗即著名的林丹汗，也曾帶兵攻破過呼和浩特,。

    礙于這兩大部落的影響和余威,，清政府對(duì)這兩地管理甚嚴(yán)。尤其是呼和浩特,。在清朝入關(guān)前,，歸化城土默特首領(lǐng)卜石圖汗之子俄木布洪臺(tái)吉曾密謀與漠北喀爾喀蒙古、明朝三路反擊后金,，以及漠北喀爾喀車臣汗碩壘通過土默特部致額澤（林丹汗之子）的書信被后金多爾袞,、岳托發(fā)現(xiàn)，這就埋下了后來“廢爵事件”的伏筆,，多爾袞,、岳托收降額澤后岳托留居歸化城來監(jiān)視土默特蒙古的動(dòng)向,，這時(shí)一個(gè)極為特殊人物古祿格的出現(xiàn)可以說是改變了土默特蒙古甚至整個(gè)蒙古的命運(yùn)，古祿格出身于滿洲葉赫部之主納喇氏金臺(tái)什家族恰恰又與岳托為姑表親,，葉赫部金臺(tái)什家族被后金吞并后,，古祿格走投無路就投靠了歸化城土默特卜石圖汗并被卜石圖汗之子俄木布洪臺(tái)吉委以重任。由于古祿格與岳托的特殊關(guān)系,，古祿格雖與后金有奪地之仇,，毀家之恨，但考慮到個(gè)人的政治利益就與杭高（土默特部的一個(gè)小頭目）合伙向岳托告密俄木布洪臺(tái)吉謀叛,，俄木布洪臺(tái)吉被俘后送往盛京（今沈陽）下獄受審,，當(dāng)時(shí)后金考慮到多數(shù)蒙古部眾還沒有歸附，俄木布洪臺(tái)吉又是達(dá)延汗,，阿拉坦汗的子孫,，他在眾蒙古當(dāng)中也頗有影響，因此,，就沒有殺他,。后來皇太極登基時(shí)古祿格到盛京朝賀，后金將俄木布洪臺(tái)吉貶為庶人交由古祿格帶回本旗管束,，同時(shí)委任古祿格,、杭高為土默特左、右兩翼都統(tǒng),。從此,，土默特部阿拉坦汗后裔的勢(shì)力就這樣被瓦解了。

   后金以聯(lián)姻,、懷柔,、拉攏的手段首先收服了兵強(qiáng)馬壯的科爾沁等部，這時(shí)勢(shì)單力孤的林丹汗沒能擊敗后金的聯(lián)合部隊(duì),。同族相殘,，使得林丹汗向西敗走，后來林丹汗不幸病故于大草灘（今青海）,，其子額澤（當(dāng)時(shí)才十幾歲）無奈率察哈爾部歸降后金,，額澤被封親王，部眾被安置在義州（今遼寧省義縣）邊外,?？墒穷~澤不久病逝，由其弟阿布奈接任親王,，阿布奈個(gè)性倔強(qiáng)不忘祖訓(xùn),，且對(duì)先人的恥辱耿耿于懷，就以種種借口不去朝拜清朝皇帝,，最終以“無藩臣禮”被撤職下獄,，囚禁在盛京,。其后委任其長子布爾尼為親王,，這時(shí)清朝皇帝萬萬也沒有想到一個(gè)小小的布爾尼,，差點(diǎn)兒成了滿清的掘墓人，這是因?yàn)樯员牒返牟紶柲岵桓市那訚M清統(tǒng)治之下,，以及父親阿布奈被囚禁,，使得布爾尼對(duì)滿清更加仇恨，布爾尼就乘三藩反清,，京城空虛的有利時(shí)機(jī)組織了這次起義,，但這次起義被孝莊給剿滅了，布爾尼在起義的前期除去沒有和科爾沁等部聯(lián)絡(luò),，與東部其他蒙古各部做了大量的工作,，要聯(lián)合在同一時(shí)間同時(shí)起義，可是到了緊要關(guān)頭只有奈曼旗達(dá)爾罕郡王扎木禪,，喀爾喀輔國公垂扎布積極響應(yīng),，其他蒙古各部出于對(duì)滿洲的威懾和自身的利益考慮，把約定早已拋在腦后,，有的蒙古王公甚至紛紛請(qǐng)求出兵鎮(zhèn)壓,。可憐的布爾尼,、扎木禪,、垂扎布沒有多日就被滿蒙聯(lián)合部隊(duì)給剿滅了，布爾尼,、羅卜藏（布爾尼之弟）陣亡,，其子于“軍前正法”，后來在盛京囚禁的阿布奈不久也被殺害,，布爾尼等人被殺,，清朝徹底鏟除滅絕了察哈爾汗室，分封察哈爾世襲爵位被撤銷,，察哈爾部眾被拆散移出原牧地,，編成八旗建制，還有部眾被迫充軍到開封府,以后又有部分部眾被遷移到新疆現(xiàn)在的博爾塔拉蒙古自治州,。

  清朝在內(nèi)蒙古設(shè)置的都統(tǒng)旗,，總管旗分別所指，都統(tǒng)旗為土默特部,；被編為左,、右兩翼兩個(gè)旗，稱歸化城土默特左翼都統(tǒng)旗,、歸化城土默特右翼都統(tǒng)旗（今呼和浩特市地區(qū),，除去武川縣的大藍(lán)旗鄉(xiāng)以及包頭市地區(qū),，除去白云礦區(qū)、達(dá)爾罕茂明安聯(lián)合旗,、固陽縣的部分地區(qū),，上述地區(qū)為清入關(guān)以后的區(qū)域）。

  總管旗為察哈爾部,；被編為左,、右兩翼八個(gè)旗（大體為現(xiàn)今烏蘭察布市地區(qū)，除去四子王旗,。呼和浩特市武川縣的大藍(lán)旗鄉(xiāng),。錫林郭勒盟的正藍(lán)旗、鑲黃旗,、正鑲白旗,、太仆寺旗、多倫縣,。河北省的固原縣,、尚義縣、張北縣,、康保等縣的部分,。），右翼四旗為正黃旗,、正紅旗,、鑲紅旗、鑲藍(lán)旗,，左翼四旗為鑲黃旗,、正白旗、鑲白旗,、正藍(lán)旗,。

都統(tǒng)旗，總管旗在清王朝統(tǒng)治時(shí)期是有別于其他旗制下的末等旗,，它一無政治地位,，二無自主權(quán)。察哈爾八個(gè)旗之間相互交錯(cuò)設(shè)置的禮部,、兵部,、太仆寺、慶豐寺等的牧場(chǎng),、牧人的管理總管,。