奇點糕想先問一個問題:有多少人之前聽過轉染重排(RET)激酶這個詞呢,? 不管聽沒聽過,都可以看看《柳葉刀》來補課。最近《柳葉刀-腫瘤學》和《柳葉刀-糖尿病與內分泌學》同一天刊文,,介紹了新型靶向藥普拉替尼(pralsetinib),,精準治療RET變異非小細胞肺癌(NSCLC)和甲狀腺癌的ARROW臨床研究。 這種高規(guī)格的報道待遇,,也說明RET基因變異是當前癌癥靶向治療的新熱點,,那么問題緊接著就來了:RET基因功能是什么?為什么會發(fā)生RET基因變異,?RET基因變異是如何導致癌癥發(fā)生的,?且聽奇點糕一一分解。 RET基因是如何被發(fā)現的,? RET基因的發(fā)現,,是在1985年由哈佛大學醫(yī)學院的三位科學家完成的,他們使用DNA轉染法,,以人T細胞淋巴瘤DNA轉染小鼠的NIH-3T3細胞,。如果轉染后有此前尚未發(fā)現的新“集落”形成,就提示可能激活了新的癌基因,。 Ras家族的多個基因,,就是這樣被發(fā)現的[1]。哈佛團隊在研究中發(fā)現,,被轉染誘導形成的新基因,,包含兩個在正常人體細胞或淋巴瘤細胞內,原本不連接在一起的DNA片段,。 下圖中F條帶即為經轉染發(fā)現的RET重排基因,,與正常人腎臟細胞DNA(條帶e、J)或淋巴瘤細胞DNA(條帶d,、i、m)相比,,這個條帶缺少長度>16kb的DNA片段,,提示可能發(fā)生了內部缺失,或不相連DNA片段的重組,。 F條帶與腎臟細胞或淋巴瘤細胞DNA存在明顯區(qū)別,,如不存在6.3Kb/2.3 Kb處的Eco RI片段,卻與轉染后的NIH3T3細胞DNA(b,、c,、g、h)條帶更接近 (圖片來源:Cell) 此后研究證實[3],,RET基因是一種能促進癌細胞增殖和存活的原癌基因,,但它真正被重視是在2011年底,韓國研究團隊最早報告了一例檢出KIF5B-RET融合的NSCLC患者[4]。 肺癌患者的群體之龐大,,遠遠不是之前RET基因變異比較多見的甲狀腺癌,、多發(fā)性內分泌腺瘤病2型(MEN2)等癌癥能比的,這使得相關的科研探索和藥物研發(fā)瞬間加速,,也讓科學界對RET基因有了更多的了解,。 正常機體內,RET基因都在做什么,? RET基因位于人類的10號染色體長臂上,,在胚胎發(fā)育期它對器官生成、神經發(fā)育等過程有重要的作用[5-6],,有研究顯示敲除RET基因的小鼠出生1天后,,就會因為腎臟不發(fā)育和先天性巨結腸死亡[7]。而在成年人體組織內,,RET基因主要在腎上腺髓質,、甲狀旁腺、小腦,、外周血單核細胞等位置表達[8-9],,但對機體功能影響相對胚胎發(fā)育期較小,如特異性敲除中腦多巴胺神經元的RET基因,,可能會對其長期生存有一定影響[10-11],。 總而言之,正常的RET基因在胚胎發(fā)育期的生理意義相對較大,,在成年人體內影響有限,。一般情況下RET蛋白的活化需要依賴其配體——神經膠質細胞源性神經營養(yǎng)因子(GDNF)家族受體(GFLs),但GFLs并不直接結合到RET蛋白上,,而是先結合GDNF家族受體α-共受體(GFRα1-4),,形成配體-共受體復合物。 配體-共受體復合物再結合到RET蛋白上,,介導RET同源二聚體(Homodimer)形成,,然后經胞內結構域磷酸化(autophosphorylation)完成活化,活化的RET蛋白能夠激活Ras/ERK,、PI3K/AKT等信號通路促進細胞增殖,,從而在器官發(fā)育和組織穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮作用。 RET蛋白正常的活化過程 (圖片來源:Nature Reviews Cancer) RET基因變異是怎么促癌的,? 如果出現融合(RET fusion,,又稱RET重排/RET rearrangement)、點突變等促癌變異時,,RET蛋白會發(fā)生不依賴配體的異常過度激活,。例如MEN2A中常見的RET錯義突變,,往往發(fā)生在細胞外富含半胱氨酸的結構域,使RET蛋白不結合配體就形成同源二聚體并活化(如下圖b所示),。 RET促癌變異時的活化過程,,與正常活化過程的對比 (圖片來源:Nature Reviews Endocrinology) RET基因點突變還可能發(fā)生在細胞內的激酶結構域,,例如MEN2B型中最常見的M918T突變,,活化RET蛋白就不需要形成同源二聚體,而是通過增強RET蛋白與ATP的親和力,,并使RET的活化單體更加穩(wěn)定,,激活下游信號通路促癌的(如上圖c所示)[12]。 而在發(fā)生RET融合時,,雖然RET基因細胞外的結構域會丟失,,但KIF5B、CCDC6等伴侶基因往往帶有卷曲螺旋結構域(coiled-coil domain),,其會在新蛋白中誘導同源二聚化過程,,從而使RET激酶結構域不依賴配體就持續(xù)激活促癌(如上圖d所示)[13]。 NSCLC,、甲狀腺乳頭狀癌(PTC)中,,最常見的RET基因促癌性變異是RET融合,而甲狀腺髓樣癌(MTC),、MEN2中較常見的則是體細胞/生殖細胞點突變[14],。其中RET融合的發(fā)生相對復雜,也是近年來科研探索的重點,,那么導致基因融合的機制是什么呢,? RET融合的發(fā)生機制是怎樣的? 機體受到各種內源性/外源性因素的刺激,,細胞內的DNA每時每刻都可能出現損傷,,其中DNA雙鏈斷裂是最嚴重的損傷之一[15],會直接威脅細胞的生存,,細胞內有兩條修復通路用來減少DNA復制錯誤和損傷,,分別是同源重組修復(HR)和非同源末端連接(NHEJ)。 HR通路屬于“慢工出細活”式的精準修復,,而NHEJ就有點不管三七二十一,先把DNA雙鏈連上再說,,這樣修復就可能導致染色體的基因重排,,使融合基因出現。 2014年日本學者對14例檢出RET融合的肺腺癌患者進行分析,,發(fā)現這些患者RET基因斷裂的位點,,基本都位于11號內含子(intron 11)上,而且一大半都是NHEJ機制修復的結果,最終表現為RET基因的3’端激酶結構域,,和KIF5B等基因發(fā)生了融合[16],。 NHEJ對KIF5B、RET基因斷裂的異常修復,,導致KIF5B-RET融合發(fā)生 (圖片來源:Journal of Thoracic Oncology) 除NHEJ修復外,,RET或伴侶基因出現DNA單鏈斷裂,引發(fā)的斷裂誘導復制(BIR)也可能參與了RET融合的發(fā)生[16],。在結直腸癌等癌癥中,,還有研究報告了位于7號、10號內含子等較罕見的RET融合斷裂位點[17-18],。 而輻射則是RET融合發(fā)生的已知危險因素,,有學者分析了曾在切爾諾貝利核事故區(qū)居住的26例PTC患者,其中15例就檢出了RET融合[19],,遠高于正常環(huán)境下PTC患者中RET融合7-20%的發(fā)生率[20],。 不同種類的癌癥中,與RET基因融合的“伴侶基因”也不同,,NSCLC中大多數都是KIF5B,,而PTC中以CCDC6、NCOA4為主,,此外還有幾十個基因可能與RET融合,,這些伴侶基因對RET融合腫瘤生物學行為的影響,還有待進一步研究,。 RET點突變/融合的具體促癌機制都還沒有被徹底闡明,,但目前認為這兩種變異都會強力激活下游的PI3K/AKT、RAF/MEK/ERK等信號通路,,延長細胞生存,、促進細胞增殖,還會增強侵襲性并促進新生血管生成[14],。 RET基因變異或能調節(jié)免疫微環(huán)境 被促癌性基因變異或GFLs激活后,,RET還會誘導促炎性蛋白,如細胞因子,、趨化因子及相應受體的表達,,這些促炎性蛋白可能直接作用于腫瘤細胞或腫瘤微環(huán)境,促使腫瘤相關炎癥發(fā)生,。 RET活化誘導的促炎性蛋白表達,,還可能招募更多淋巴細胞、中性粒細胞,、巨噬細胞等免疫細胞向腫瘤浸潤,,這些免疫細胞也有一定水平的RET表達,,從而可能在GFLs的激活下,參與促癌增殖和侵襲性轉移的過程[21],。已有研究提示在MEN2中,,對應類型的RET突變會導致抑制性腫瘤微環(huán)境,從而不利于免疫治療[22],。 RET基因變異對免疫微環(huán)境影響的可能機制 (圖片來源:Frontiers in Physiology) 2021年美國NCCN非小細胞肺癌臨床實踐指南中,,也將RET融合列為可能導致免疫檢查點抑制劑治療缺乏獲益的原癌基因之一,與EGFR,、ALK等驅動基因并列,,不過這是否與免疫微環(huán)境的改變相關,還需要更多研究探索[23],。 該如何找到RET變異的患者,? 從發(fā)生頻率來說,RET基因變異是不折不扣的罕見突變:2017年美國學者分析了39種組織學類型不同癌癥,,共4871例腫瘤組織樣本的測序結果,,其中只有88例檢出了RET基因變異,包括34例點突變,、27例融合和22例擴增,,整體的檢出頻率為1.8%[20]。 RET基因異常的檢出率和類別分布 (圖片來源:Clinical Cancer Research) 而如果具體到癌癥類型的話,,RET融合在PTC和NSCLC中的檢出頻率,,分別約為5-10%和1-2%,在其它癌癥中都極其罕見[18],;而在較多見RET點突變的MTC患者中,,報告的檢出率在43-90%不等[18,20]。 一些真實世界大樣本分析則顯示,,RET融合NSCLC患者一般有著年輕,、不吸煙、組織學類型非鱗癌等特點[24-26],,與ALK融合等罕見突變的患者相似,,可以對這類患者重點開展二代測序(NGS),爭取找到RET融合等有藥可用的突變,。 在NSCLC治療已經全面進入精準化,、個體化時代的今天,以基因檢測結果指導用藥已經不是稀罕事,。哪怕是RET基因變異這樣相對罕見的位點,,也應該納入到必須檢測的基因范圍,從而為患者找到改善治療結果的機會,。 我國2021年版《非小細胞肺癌分子病理檢測臨床實踐指南》,,就將RET基因的檢測內容納入其中,而6月份最新的《中國非小細胞肺癌RET基因融合臨床檢測專家共識》發(fā)布,,能夠進一步指導臨床將RET檢測實踐規(guī)范化 [27-28],。 從發(fā)現RET融合肺癌患者,到有特異性的抑制劑可用,,十年也不過是彈指一揮間,。而在有藥可用的同時,也需要遵循指南和共識,,樹立對RET基因的檢測意識,。醫(yī)生積極檢測,患者主動配合,,才能真正讓RET基因變異的靶向治療走上快車道,。 參考文獻: 1.Cox A D, Der C J. 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