前言
俗話說“文獻是最好的老師”,,但是隔行如隔山,,在科研界,隔著一個領域就有一個巨大的鴻溝,。就比如就算做腫瘤研究的人,,看免疫學領域的文章還是會頭皮發(fā)麻,看到總是記不住的CD4+ T細胞,,CD8+ T細胞,,各種CD分子就能讓人頭禿。不做表觀遺傳的人,,看到甲基化,,泛素化,乙?;秃ε碌南胪笸?。但學習的過程,,就是把自己那膽小的腦細胞安撫一下,客服困難后獲取知識的感覺如沐春風,。
m6A甲基化,,咋一聽名字我就是拒絕的。甲基化我可以理解,,m6A又是什么,?它的功能是什么? m6A甲基化,對我來說就是一張白紙,,我除了一個名字,,全然不知。
以下將是一個m6A甲基化小白的拆解式了解
本文參考的文章有:RNA甲基化修飾——m6A概念,,重磅前沿 https://www./newsf/2018-5/201857103154270.htm (這是一篇非常言簡意賅的文章,,請一定要閱讀)
m6A甲基化是什么?
一看到甲基化就想到修飾,,這個原因不加解釋了,。一直以為我從未關注過中心法則中的RNA,也未考慮過RNA也需要修飾,。實際上已知RNA已經(jīng)存在超過100中修飾,,下面是我在谷歌中找到的圖
RNA processing begins with the addition of a 5'-cap and a 3'-poly(rA) tail to the pre-mRNA. The protein coding region contains coding sequences called exons. The exons are spliced together to form the mature mRNA.
圖中所示的5’cap和3'的Poly A尾,就是RNA修飾,,加帽和加尾肯定會使得這條RNA和pre-mRNA的功能有了變化,,由此我們聯(lián)想到RNA,也是有不同的變化(狀態(tài))的,。結(jié)合果子老師之前的推文介紹,,我大概了解到,RNA可以從前體變成熟,,可以翻譯也可以不翻譯,,可以蓄積也可以降解。而m6A甲基化就是一種可以改變RNA狀態(tài)的修飾,。
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這張圖里,,m6A甲基化就像是RNA的標簽,由WTAP,,METTL3和METTL14組成的復合物寫入,,之后會由閱讀器過來閱讀從而發(fā)揮作用,不同的閱讀器發(fā)揮的功能不一樣,,我們比較熟悉的是YTHDF2,,他閱讀m6A甲基化后促進RNA降解,。寫入的m6A甲基化如果不擦除會失調(diào),,所以還有一些蛋白作為擦除器,,專門擦除m6A甲基化,已知的兩個是FTO和ALKBH5,。
這張圖解決了,,它是誰,它從哪里來,,將要哪里去的問題
(1)m6A甲基化,,由Pre-mRNA-splicing regulator WTAP , N6-adenosine-methyltransferase 70 kDa subunit (METTL3) 和METTL14等蛋白寫入。好吧,,這些可都是剪接調(diào)節(jié)因子或者甲基轉(zhuǎn)移酶呀,。有甲基化,自然也就有去甲基化,,那么就是通過the first m6A demethylase, fat mass and obesity-associated protein (FTO),,the 2nd m6A demethylase--m6A demethylase alkB homolog 5 (ALKBH5)起作用。 FTO是第一個被發(fā)現(xiàn)的m6A去甲基化酶,,ALKBH5是第二個,。
(2)m6A甲基化的mRNA,經(jīng)過閱讀器(猜測是核糖體之類的東西,,如有錯誤,,請不吝賜教)閱讀后,該mRNA可能會翻譯,,可能會保持穩(wěn)定不變或者降解,,可能會被剪切,可能也會發(fā)生核轉(zhuǎn)位(出核)
(3)既然m6A甲基化對蛋白表達,、剪接體的形成還有mRNA定位都有重大影響,,這就預示著m6A甲基化會對非常多的生物學過程具有重要意義。
看到這里,,不由的點點頭,,嗯,m6A甲基化真的很重要呢,!