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法醫(yī)物證鑒定Y-STR檢驗(yàn)規(guī)范SF/Z JD0105007-2018

 gsrsluohe 2021-04-28

《法醫(yī)物證鑒定X-STR檢驗(yàn)規(guī)范SF/Z JD0105006-2018》由中華人民共和國司法部公共法律服務(wù)管理局于2018年11月8日發(fā)布,,歸口單位司法部公共法律服務(wù)管理局,自2019年1月1日起施行,。Specification of Y-STR testing for forensic purpose

目  次

  

  

1   

2 規(guī)范性引用文件

3 術(shù)語和定義

4 基本要求

5 檢驗(yàn)程序

6 鑒定意見

7 鑒定文書

8 特別說明

參考文獻(xiàn)

·前  言

本技術(shù)規(guī)范按照GB/T 1.1-2009給出的規(guī)則起草,。

本技術(shù)規(guī)范由司法鑒定科學(xué)研究院提出。

本技術(shù)規(guī)范由司法部公共法律服務(wù)管理局歸口,。

本技術(shù)規(guī)范起草單位:司法簽定科學(xué)研究院,、四川大學(xué)華西基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與法醫(yī)學(xué)院、北京市公安局,、中山大學(xué),。

本技術(shù)規(guī)范主要起草人:李成濤、侯一平,、邊英男,、張素華、劉雅誠,、孫宏鈺,、李莉,、劉希玲。

本技術(shù)規(guī)范為首次發(fā)布,。

·  

本技術(shù)規(guī)范運(yùn)用法醫(yī)物證學(xué),、遺傳學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)等學(xué)科的理論和技術(shù),結(jié)合法醫(yī)物證鑒定的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)而制訂,,為法醫(yī)學(xué)Y-STR檢驗(yàn)提供科學(xué)依據(jù)和統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),。

1   

本技術(shù)規(guī)范規(guī)定了法醫(yī)學(xué)DNA實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行Y-STR基因座檢測的基本要求、檢驗(yàn)程序,、鑒定意見和鑒定文書。

本技術(shù)規(guī)范適用于法醫(yī)學(xué)DNA實(shí)驗(yàn)室采用Y-STR基因座進(jìn)行同一父系親緣簽定和家系排查.

2規(guī)范性引用文件

下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的,。凡是注日期的引用文件,,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件,。

GA/T 383-2014 法庭科學(xué)DNA實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)規(guī)范

3術(shù)語和定義

下列語和定義適用于本文件,。

3.1 Y染色體 Y chromosome
決定生物個(gè)體性別的一種性染色體,,僅存在于男性個(gè)體細(xì)胞中;屬近端著絲粒染色體,,由長臂Yq和微小的短臂Yp組成,,DNA長度約60Mb;呈男性伴性遺傳,。
 
3.2 Y染色體STR基因座 Y-STR locus
Y染色體上一類遺傳標(biāo)記,,大多數(shù)具有復(fù)雜的串聯(lián)重復(fù)結(jié)構(gòu):一個(gè)基因座內(nèi)常含有兩種以上不同的重復(fù)單位,恒定重復(fù)序列和可變重復(fù)序列同時(shí)存在,。
注:Y-STR基因座總體平均突變率與常染色體STR基因座的突變率相近,。由于突變的逐代累積。同一父系越遠(yuǎn)的親屬之間Y-STR差異越大,,即便父子之間也可能在多個(gè)基因座發(fā)生突變,。
 
3.3 Y-STR單倍型 Y-STR haplotype
Y-STR基因座組合在一起作為一個(gè)整體遺傳給子代,應(yīng)視為一個(gè)遺傳標(biāo)記,,個(gè)體Y-STR基因座上等位基因的組合稱為單倍型,。
 
3.4 單倍型頻率 haplotype frequeney
在一個(gè)群體中,某一個(gè)特定的Y-STR單倍型出現(xiàn)的頻率,。
注:一般可以采用計(jì)數(shù)法來評估,,計(jì)算公式為:
圖片
式中:x為該單倍型觀察到的次數(shù),N為總樣本量,。
3.5 單倍型匹配概率 haplotype match probability,,HIP
群體中隨機(jī)抽取兩個(gè)個(gè)體,,兩者擁有相同的Y-STR單倍型的概率。
注1:單倍型匹配概率為每個(gè)單倍型頻率的平方之和,,計(jì)算公式為:
圖片 
式中:p為第i個(gè)單倍型的頻率,,k為單倍型數(shù)量。
注2:群體中的單倍型種類越多,,單倍型匹配概率就越小,,單倍型差異度就越大。
 
3.6 單倍型差異度 haplotype diversity,,HD
用于評估Y-STR分型系統(tǒng)鑒別能力的指標(biāo),。
注:計(jì)算公式為;
圖片
式中:pi為第i個(gè)單倍型的頻率,,k為單倍型數(shù)量,,N為總樣本量。
 
3.7 分辨能力 discrimination capacity,,DC
用于評估Y-STR分型系統(tǒng)鑒別能力的指標(biāo),。
注:可以用單倍型數(shù)量與總樣本量的比值進(jìn)行評估,計(jì)算公式為:

圖片

4基本要求

4.1 鑒定機(jī)構(gòu)應(yīng)具有從事法醫(yī)物證的執(zhí)業(yè)范圍,,且應(yīng)滿足如下要求:

a)定期參加能力驗(yàn)證相關(guān)計(jì)劃并考核合格,;

b)對所有影響鑒定結(jié)果的人員崗位規(guī)定相應(yīng)的能力要求,包括教育,、資質(zhì),、培訓(xùn)、專業(yè)知識(shí),、技能等,,并保留相關(guān)記錄;制定適宜的培訓(xùn)計(jì)劃并組織實(shí)施,;

c)依據(jù)鑒定方法和要求對鑒定人以及參與鑒定工作的人員進(jìn)行監(jiān)督,,以評價(jià)其鑒定工作的符合性和滿意程度;監(jiān)督的結(jié)果應(yīng)作為培訓(xùn)需求評價(jià)的依據(jù)之一,;

d)具有能識(shí)別樣本的標(biāo)識(shí)系統(tǒng),,并確保樣本在鑒定過程期間能得到持續(xù)的識(shí)別;

e)建立樣本的運(yùn)輸,、接收,、處置、保護(hù),、存儲(chǔ),、保留和/或清理的規(guī)定,應(yīng)對接收,、內(nèi)部傳遞,、處置,、保留、返還和清理等過程進(jìn)行記錄,,確保記錄的完整性和可追溯性,。

4.2 鑒定人應(yīng)具有法醫(yī)物證鑒定執(zhí)業(yè)資格,熟悉并掌握Y-STR檢驗(yàn)的方法和原理,,并能正確評價(jià)結(jié)果,。

4.3 鑒定活動(dòng)應(yīng)包括檢驗(yàn)(采樣、DNA提取和純化,、DNA定量分析,、PCR擴(kuò)增與PCR產(chǎn)物分型)、系統(tǒng)評估,、似然率計(jì)算,、鑒定意見判斷、鑒定文書撰寫等環(huán)節(jié),。鑒定活動(dòng)完畢后,應(yīng)將各個(gè)環(huán)節(jié)的記錄進(jìn)行歸檔,。

5檢驗(yàn)程序

5.1 采樣要求

樣本的采集,、包裝及保存應(yīng)按照以下要點(diǎn):

a)樣本可以是血液(斑)或口腔拭子(唾液斑),也可以是其它人體生物學(xué)樣本,,如精液(斑),、帶毛囊毛發(fā)、羊水,、組織塊等,;

b)對于接受了外周血干細(xì)胞移植的被鑒定人,應(yīng)避免采集其血樣作為檢驗(yàn)樣本,,宜取其口腔拭子(唾液斑)或毛發(fā)進(jìn)行檢驗(yàn),;

c)樣本應(yīng)分別包裝,注明被鑒定人姓名,、編號(hào),、采樣日期等;

d)樣本采集后應(yīng)冷藏或冷凍保存,。

5.2 DNA提取和純化

按照GA/T 383-2014中附錄A的方法執(zhí)行,。

5.3 DNA定量分析

按照GA/T 383-2014中6.1~6.3的方法執(zhí)行。

5.4 PCR擴(kuò)增與PCR產(chǎn)物分型

5.4.1 X-STR基因座

選用多態(tài)性X-STR基因座進(jìn)行PCR擴(kuò)增,,基因座選擇宜參照如下條件:

a)已有基因座定義和其特征的文獻(xiàn)報(bào)道,;

b)已實(shí)施種屬特異性、靈敏性,、穩(wěn)定性研究,;

c)已有可供使用并公開發(fā)表的群體遺傳數(shù)據(jù),,包括從有關(guān)人群中獲得的基因座等位基因頻率或單倍型頻率及突變率等;

d)串聯(lián)重復(fù)單位為三,、四或五核苷酸:

e)X-STR基因座可選用DXS7132,、DXS7423、DXS8378,、DXS10074,、DXS10079、DXS10101,、DXS10103,、DXS10134、DXS10135,、DXS10146,、DXS10148、HPRTB等,??稍黾游墨I(xiàn)報(bào)道且經(jīng)驗(yàn)證的其它X-STR基因座,以提高系統(tǒng)效能,。

5.4.2 PCR擴(kuò)增

應(yīng)選用商品化的試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,,每批擴(kuò)增均應(yīng)有陽性對照樣本(已知濃度和基因型的對照品DNA或以前檢驗(yàn)過的、已知基因型的樣本)以及不含人基因組DNA的陰性對照樣本,。PCR擴(kuò)增體系與PCR擴(kuò)增參數(shù)宜按試劑盒的操作說明書進(jìn)行,。

5.4.3 PCR產(chǎn)物分型與結(jié)果判讀

使用遺傳分析儀對PCR產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳。按照操作手冊使用相關(guān)軟件進(jìn)行結(jié)果判讀,。

對YSTR基因座進(jìn)行分型檢測時(shí),,通常男性樣本在單拷貝Y-STR基因座上僅表現(xiàn)為1個(gè)等位基因峰,女性樣本表現(xiàn)為無可檢見等位基因峰,。若出現(xiàn)異?,F(xiàn)象,結(jié)果判讀宜考慮以下情形:

a)由于Y染色體存在較多的回文結(jié)構(gòu),,部分Y-STR基因座在染色體上存在多個(gè)拷貝,,采用基因座特異性熒光標(biāo)記引物擴(kuò)增后會(huì)產(chǎn)生多個(gè)PCR產(chǎn)物,即多拷貝Y-STR基因座,,可以表現(xiàn)為1個(gè)或多個(gè)等位基因峰,,如基因座DYS385、DYS459,、DYD464等,,命名時(shí)參考多拷貝基因座命名原則。

注:多拷貝基因座命名原則:在染色體上存在多個(gè)拷貝的基因座表現(xiàn)出多個(gè)擴(kuò)增產(chǎn)物峰,,在所用分型方法無法區(qū)分各等位基因具體的基因座來源時(shí),,多拷貝基因座采用單一搭因座名,,觀察到的所有等位基因作為一個(gè)基因型處理,按由小到大的原序共同報(bào)告,,中間以連字符分開,,例如DYS38511-14、DYS4598-11,、DYS46413-14-15-16等,。采用特殊檢驗(yàn)法可以明確等位基因來源的,應(yīng)根據(jù)實(shí)際基因座來源進(jìn)行命名,,如DYS385a 14和DYS385b11,。

b)由于Y染色體基因組的不穩(wěn)定性,某些Y-STR基因座(如DYS19,、DYS390,、DYS391等)可能出現(xiàn)2個(gè)或3個(gè)拷貝,導(dǎo)致擴(kuò)增產(chǎn)物在圖譜中呈現(xiàn)多個(gè)等位基因峰,。這種情形下,,不應(yīng)誤判所檢樣本為不同男性混合樣本。命名時(shí)參考多拷貝基因座命名原則,。

c)由于X和Y染色體部分序列具有相似性,,如果擴(kuò)增引物選擇不當(dāng),對某些Y-STR基因座(如DYS391和DYS393)進(jìn)行分型時(shí),,在X染色體上也能檢出擴(kuò)增產(chǎn)物,因此不僅男性樣本可檢見額外的產(chǎn)物峰,,女性樣本也可檢見產(chǎn)物峰,。

d)Y染色體的微缺失現(xiàn)象導(dǎo)致異常分型結(jié)果。如含有AMEL-Y的DNA片段缺失,,可同時(shí)伴有鄰近DYS458或(和)DYS456基因座的缺失,。又如復(fù)合擴(kuò)增過程中,DYS448基因座側(cè)翼區(qū)缺失能導(dǎo)致其擴(kuò)增產(chǎn)物大小移位至另一個(gè)基因座檢測區(qū)范圍,,使另一個(gè)基因座出現(xiàn)兩個(gè)等位基因峰,。


6鑒定意見

6.1 根據(jù)分型結(jié)果,鑒定意見常表述為“符合同一父系遺傳規(guī)律”,、“不符合同一父系遺傳規(guī)律”和“無法判斷”,。

6.2 通常情況下,同一父系的所有男性個(gè)體具有相同的Y-STR單倍型,。Y-STR基因座在遺傳過程中有發(fā)生突變的可能性,,不能僅以單個(gè)Y-STR基因座分型結(jié)果的不一致來否定親緣關(guān)系。

6.3 無關(guān)個(gè)體可能表現(xiàn)出相同的Y-STR單倍型,,不能僅以Y-STR單倍型的匹配認(rèn)定親緣關(guān)系,。


7鑒定文書

7.1 簽定人根據(jù)檢驗(yàn)結(jié)果和鑒定意見撰寫鑒定文書,。

7.2 鑒定文書的格式要求宜按照主管部門或司法鑒定標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)頒布的相關(guān)規(guī)范執(zhí)行。


8特別說明

8.1 使用Y-STR多重?cái)U(kuò)增檢測試劑盒時(shí),,應(yīng)對試劑盒的法醫(yī)學(xué)效能進(jìn)行總體評估,,可通過單倍型差異度、單倍型匹配概粹或分辨能力進(jìn)行評估,。

8.2 在需要提高對同一父系親屬的區(qū)分能力時(shí),,可以考慮使用具有較高突變率的Y-STR基因座,如DYS570和DYS576等,。

8.3 應(yīng)用Y-STR基因座對混合物中男性成分進(jìn)行分型檢測時(shí),,若發(fā)現(xiàn)混合物涉及多名男性個(gè)體,可根據(jù)Y-STR分型結(jié)果推斷男性嫌疑人人數(shù),,根據(jù)峰高對主要組份和次要組份進(jìn)行分析,。


·參考文獻(xiàn)

[1] 侯一平,法醫(yī)物證學(xué)[M].北京:人民衛(wèi)生出版社,,2016.

[2] 李成濤,,侯一平等.英漢法醫(yī)遺傳學(xué)詞典[M].北京:科學(xué)出版社,2012.

[3] Scientific Working Group on DNA Analysis Methods.SWGDAM Interpretation Guidelines for Y-Chromosome STR Typing by Forensic DNA Laboratories[S].2014

[4] Gilla P,,Brennerb C,,Brinkmannc B,et,,al.DNA Commission of the International Society of Forensic Genetics:recommendations on forensic analysis using Y-chromosome STRs J].Forensic Sci lnt,,2001,(124):5-10.

[5] Gusmao L,,Butler JM,,Carracedo A,et,,al.DNA Commission of the International Socicty of Forensic Genetics(ISFG):An update of the recommendations on the use of Y-STRs in forensic analysis[J].Forensic Sci Int,,2006,(157):187-197.

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