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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析“龜板

 11jiuge 2020-11-09

文題釋義:

“龜板-鹿角”藥對(duì):是龜鹿二仙膠、左歸丸等經(jīng)典補(bǔ)腎方劑發(fā)揮治療作用的核心,,具有補(bǔ)腎強(qiáng)骨之功,,常用于治療骨質(zhì)疏松癥。

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué):融合多向藥理學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)思維,,通過(guò)對(duì)生物系統(tǒng)分子的網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建分析,,探索藥物的成分-靶點(diǎn)-通路-疾病之間的整體作用關(guān)系,,預(yù)測(cè)藥物在體內(nèi)的作用機(jī)制。

背景:“龜板-鹿角”藥對(duì)是治療骨質(zhì)疏松癥的經(jīng)典中藥配伍方式,,臨床被廣泛應(yīng)用,,但其藥理學(xué)分子作用機(jī)制目前尚不明確。

目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,,探討經(jīng)典補(bǔ)腎中藥藥對(duì)“龜板-鹿角”治療骨質(zhì)疏松癥的分子作用機(jī)制,。

方法:從BATMAN-TCM、TCM-MESH,、化學(xué)專(zhuān)業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)及手工檢索文獻(xiàn)獲取“龜板-鹿角”藥對(duì)的活性成分及治療作用靶點(diǎn),。從毒理組學(xué)比較數(shù)據(jù)庫(kù)、人類(lèi)基因數(shù)據(jù)庫(kù)獲取藥物治療骨質(zhì)疏松癥作用靶點(diǎn),,與“龜板-鹿角”作用靶點(diǎn)取交集確定治療作用靶標(biāo)基因,。通過(guò)STRING網(wǎng)站構(gòu)建靶標(biāo)基因間蛋白互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)系;采用Cytoscape軟件構(gòu)建藥對(duì)-活性成分-靶標(biāo)基因網(wǎng)絡(luò),、核心靶標(biāo)基因互作網(wǎng)絡(luò),;借助DAVID、KOBAS等在線工具對(duì)靶標(biāo)基因進(jìn)行基因本體論及通路富集分析,,篩選具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的過(guò)程或通路(P < 0.05),;通過(guò)SwissDock進(jìn)行核心基因與活性成分分子對(duì)接驗(yàn)證。

結(jié)果與結(jié)論:①檢索篩選得到“龜板-鹿角”藥對(duì)含天冬氨酸,、苯丙氨酸等21個(gè)有效活性成分,,對(duì)應(yīng)183個(gè)骨質(zhì)疏松癥治療靶標(biāo)基因,藥對(duì),、活性成分,、靶標(biāo)基因形成緊密聯(lián)系的互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)系;②篩選出INS,、ALB,、TNF等10個(gè)核心基因,靶標(biāo)基因主要富集于衰老,、藥物反應(yīng)等66個(gè)基因本體論過(guò)程,,缺氧誘導(dǎo)因子1、卵巢類(lèi)固醇生成等27個(gè)信號(hào)通路,;③靶標(biāo)基因INS與丙氨酸,、雄激素,ALB與丙氨酸等獲得了較高的分子對(duì)接評(píng)分,,親和力較好,;④結(jié)果表明,“龜板-鹿角”藥對(duì)的活性成分及其治療骨質(zhì)疏松癥作用靶標(biāo)基因存在復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,,靶標(biāo)基因富集于多個(gè)聯(lián)系密切且復(fù)雜的信號(hào)通路,涉及細(xì)胞增殖分化凋亡、炎癥反應(yīng),、性激素調(diào)控等多層次以調(diào)節(jié)骨修復(fù)重建的動(dòng)態(tài)平衡,,值得繼續(xù)深入研究發(fā)展。

ORCID: 0000-0003-0247-9863(李紹爍)

中國(guó)組織工程研究雜志出版內(nèi)容重點(diǎn):組織構(gòu)建,;骨細(xì)胞,;軟骨細(xì)胞;細(xì)胞培養(yǎng),;成纖維細(xì)胞,;血管內(nèi)皮細(xì)胞;骨質(zhì)疏松,;組織工程

關(guān)鍵詞: 網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué), “龜板-鹿角”藥對(duì), 骨質(zhì)疏松癥, 靶標(biāo)基因, 分子機(jī)制

文章來(lái)源:李紹爍, 顧一丹, 尹 恒, 郭 楊, 馬 勇, 王建偉. 基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析“龜板-鹿角”藥對(duì)活性成分治療骨質(zhì)疏松癥的分子機(jī)制[J]. 中國(guó)組織工程研究, 2020, 24(35): 5668-5674.

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