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NEJM:張鋒團隊發(fā)布簡易CRISPR新冠檢測2.0版,提高檢測靈敏度

 zjshzq 2020-09-17

▎藥明康德內(nèi)容團隊編輯

今日,,Broad研究所的著名學(xué)者張鋒教授和合作伙伴一起,,公布了他們進一步改良的基于CRISPR技術(shù)的新冠病毒簡易檢測流程。這一流程被稱為STOPCovid.V2,,此前,,張鋒團隊和其合作伙伴已經(jīng)公布了稱為STOPCovid的簡易新冠病毒檢測流程,這一流程不需要從患者樣本中純化RNA,,并且將檢測新冠病毒所需的化學(xué)反應(yīng)步驟在一個試管中完成,。(這一流程的詳情請看張鋒教授團隊推出新一代新冠病毒CRISPR檢測技術(shù),讓即時檢測更便捷,。)

2.0版的STOPCovid在原有檢測的基礎(chǔ)上更進一步,,在樣本制備的過程中通過加入磁珠富集樣本中的RNA,從而通過提高PCR反應(yīng)的起始RNA數(shù)量,,進一步提高了STOPCovid.V2的檢測靈敏度,。

在最初的STOPCovid檢測流程中,,張鋒團隊將擴增RNA數(shù)目的等溫PCR步驟和使用Cas酶檢測新冠病毒特定序列的化學(xué)反應(yīng)合并在同一個試管中進行,。這一檢測步驟不需要復(fù)雜儀器,只需要在60攝氏度的恒溫反應(yīng),,就可以通過側(cè)流試紙讀出檢測結(jié)果,。然而,在進一步檢測中,,研究人員發(fā)現(xiàn),,這一簡易版流程只能發(fā)現(xiàn)60.5%傳統(tǒng)RT-PCR檢測出的陽性患者。

為了提高檢測的靈敏度,,STOPCovid.v2的流程中加入了通過磁珠富集鼻咽拭子中新冠病毒RNA的步驟,,使用普通實驗室中用于富集RNA的磁珠,研究人員可以收集鼻咽拭子中包含的所有病毒RNA作為反應(yīng)的起始材料,,而且研究人員同時精簡了磁珠富集RNA的操作步驟,,去除了乙醇清洗和洗脫過程,,讓整個RNA富集過程不超過15分鐘。

▲STOPCovid.V2的操作流程(圖片來源:參考資料[1])


在華盛頓大學(xué)進行的一項設(shè)盲檢測中,,研究人員檢測了STOPCovid.V2檢驗202個新冠病毒陽性和200個新冠病毒陰性鼻咽拭子樣本的結(jié)果,。研究人員發(fā)現(xiàn),STOPCovid.V2能夠達到93.1%的靈敏度和98.5%的特異性,。陽性樣本只需15-45分鐘就能獲得結(jié)果,。

▲STOPCovid.V2的檢測結(jié)果,B:新冠病毒陽性樣本,;C:新冠病毒陰性樣本,,紅色虛線為判斷樣本為陽性還是陰性的閾值(圖片來源:參考資料[1])

研究人員在文章中表示,這一簡化版的STOPCovid.V2流程適于沒有復(fù)雜儀器的臨床實驗室使用,。同時,,研究人員還開發(fā)了一款智能手機APP,幫助檢測人員對側(cè)流試紙的結(jié)果進行解讀,。
 
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參考資料:
[1] Joung et al, (2020). Detection of SARS-CoV-2 with SHERLOCK One-Pot Testing. NEJM, DOI: 10.1056/NEJMc2026172

注:本文旨在介紹醫(yī)藥健康研究進展,,不是治療方案推薦。如需獲得治療方案指導(dǎo),,請前往正規(guī)醫(yī)院就診,。

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