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抽絲剝繭:一篇nature 牛文是如何煉成的,?

 解螺旋 2020-08-27

作者:解螺旋.大廚

如需轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明來源:解螺旋·醫(yī)生科研助手

導(dǎo)語

之前研究表明,在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中,,存在MYCN的遺傳擴(kuò)增,,MYCN又受LIN28B調(diào)控。但新的研究發(fā)現(xiàn),,對(duì)于某些MYCN片段擴(kuò)增的神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系,,盡管let-7的表達(dá)被抑制,但是LIN28B卻是可有可無的,,而let-7的遺傳缺失卻反向伴隨MYCN的擴(kuò)增,。

摘要
神經(jīng)母細(xì)胞瘤的不良預(yù)后主要伴隨著MYCN的遺傳擴(kuò)增而MYCN本身在多種腫瘤中,是抑癌microRNAs家族中l(wèi)et-7的作用靶點(diǎn),。LIN28B是let-7生物合成中的抑制劑,,在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中的表達(dá)水平增高,并調(diào)控MYCN,。

然而,,在本文中,作者發(fā)現(xiàn)對(duì)于某些MYCN片段擴(kuò)增的神經(jīng)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系,,盡管let-7的表達(dá)被抑制,,但是LIN28B卻是可有可無的。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),,MYCN轉(zhuǎn)錄出來的mRNA水平在已擴(kuò)增的疾病中是出奇的高,,并可以像海綿一樣吸收let-7,,從而抵消LIN28B缺失的影響。在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中,,let-7的遺傳缺失很常見,,但是卻反向伴隨MYCN的擴(kuò)增,并有著很糟糕的不良預(yù)后,,從而揭示了神經(jīng)母細(xì)胞瘤中存在全新的染色質(zhì)丟失模式,。

綜上,在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中,,通過LIN28B活性,、MYCN的海綿吸收或者遺傳缺失等多種手段,達(dá)到相同目的,,即抑制let-7,。這一發(fā)現(xiàn)讓我們對(duì)神經(jīng)母細(xì)胞的發(fā)生、發(fā)展和設(shè)計(jì)新治療策略有了重新的認(rèn)識(shí),,同時(shí),,這一模型也可能是其他癌癥的一種更普遍特征。
背景介紹
首先介紹一下本文的通訊作者George Q. Daley,,他是哈佛醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)和分子藥理學(xué)教授,,波士頓兒童醫(yī)院血液學(xué)教授,兒童白血病部門副主管,,干細(xì)胞移植中心主任,。在干細(xì)胞領(lǐng)域和血液學(xué)領(lǐng)域可謂大牛中大大牛。這也是我為什么好奇,,他怎么突然發(fā)表了一篇與自己完全不相關(guān)的領(lǐng)域,,即神經(jīng)母細(xì)胞瘤方向發(fā)表文章。

讀完論文,,就一個(gè)關(guān)鍵字,,let-7,一個(gè)在血液系統(tǒng)具有重要作用的微小RNA,。相當(dāng)于專注某個(gè)基因功能,,檢測(cè)其在不同組織、器官或系統(tǒng)中的作用,,從而不難理解這位大牛和本文的由來了,,這也為我們科研提供了一種非常值得借鑒的課題轉(zhuǎn)換思路。
 
簡(jiǎn)單介紹一下microRNAs和let-7,,在研究致癌和抑癌的功能中,,microRNA失調(diào)是重要的組成元件,雖然研究的人較少。高度保守的let-7家族在調(diào)控胚胎發(fā)育和維持分化組織中起著重要的作用,,是最為豐富表達(dá)的microRNAs之一,。其通過轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào),抑制多個(gè)致癌基因mRNA,,包括RAS,、MYC和HMGA2等,相當(dāng)于抑癌因子,。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn),,let-7家族在多個(gè)腫瘤類型中表達(dá)水平下調(diào),與腫瘤發(fā)生和發(fā)展存在負(fù)向關(guān)聯(lián),。因此,,揭示let-7功能的破壞機(jī)制對(duì)于認(rèn)識(shí)癌癥發(fā)病機(jī)制及新療法存在積極的意義。
論文解析
首先,,在神經(jīng)母細(xì)胞瘤中,,發(fā)現(xiàn)LIN28B和let-7調(diào)控MYCN。

 

其次,,發(fā)現(xiàn)在某類MYCN擴(kuò)增的細(xì)胞中,,LIN28是缺失的。

 

再次,,在上述基礎(chǔ)之上,,證明擴(kuò)增MYCN的ceRNA可以像海綿一樣吸收let-7。

 

第四,,在神經(jīng)膠質(zhì)瘤里面檢測(cè)到let-7家族的7a2和7g經(jīng)常出現(xiàn)丟失。
 

最后,,利用MYCN的aceRNA吸收模型來預(yù)測(cè)let-7的染色體丟失類型,。


大廚點(diǎn)評(píng)一二
1、正如本文一開始提到的,,當(dāng)你研究一個(gè)基因的功能已經(jīng)爐火純青時(shí),,將這一基因與不同的疾病、不同的動(dòng)物種屬模型,、不同的組織或器官,、不同的靶基因或信號(hào)通路聯(lián)合作用時(shí),往往都可以產(chǎn)生不同的結(jié)果和效應(yīng),,好比一貼“狗皮膏藥”,,貼到哪里都好使,這樣既豐富了你的靶基因功能研究,,也產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)(即文章),,非常值得學(xué)習(xí)。
 
2,、對(duì)于本文出現(xiàn)的ceRNA,,即competitive endogenous RNA(競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA),,作為一個(gè)新詞,它是一種新的基因表達(dá)調(diào)控模式,,是指mRNA之間可以通過miRNAs反應(yīng)原件達(dá)到相互調(diào)控的目的,。值得關(guān)注!
 
全文鏈接:Multiple mechanisms disrupt the let-7 microRNA family in neuroblastoma. Nature. 2016 Jul 6;535(7611):246-51. doi: 10.1038/nature18632.

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