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張靜:MRI影像組學在腦膠質(zhì)瘤中的臨床應用進展

 pppsss 2020-04-07



來源:磁共振成像傳媒

歐陽紅, 劉光耀, 白玉萍, 韓娜, 張靜. MRI影像組學在腦膠質(zhì)瘤中的臨床應用進展. 磁共振成像, 2020, 11(1): 74-76.

張靜,蘭州大學第二醫(yī)院核磁共振科主任,,博士研究生,,主任醫(yī)師、教授,、博士研究生導師
教育背景:1990/09-1995/06,,蘭州醫(yī)學院,臨床醫(yī)學系,,學士,;2000/09-2003/07,蘭州醫(yī)學院,,影像醫(yī)學與核醫(yī)學,,碩士;2006/09-2009/07,,天津醫(yī)科大學,,影像醫(yī)學與核醫(yī)學,博士,;2013/02-2013/08,,美國俄克拉荷馬州Baptist Hospital學習交流
專業(yè)特長:中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病影像診斷,磁共振成像,,磁共振功能成像
獲得獎勵或榮譽稱號:甘肅省領(lǐng)軍人才,、甘肅省科技進步二等獎一項、甘肅省醫(yī)學科技二等獎兩項
研究方向:神經(jīng)影像,,功能磁共振成像,,影像組學
社會兼職:甘肅省醫(yī)學會放射學專業(yè)委員會副主任委員、甘肅省醫(yī)師協(xié)會放射醫(yī)師分會副主任委員,、中華醫(yī)學會放射學分會全國青年委員,、中華醫(yī)學會放射學分會兒科學組委員、甘肅省醫(yī)學會放射專業(yè)委員會磁共振學組副組長,、中國抗癌協(xié)會腫瘤影像專委會青年委員,、《磁共振成像》雜志審稿專家

腦膠質(zhì)瘤起源于神經(jīng)膠質(zhì)細胞,是最常見的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤,,約占顱腦腫瘤的50%~60%,,發(fā)生率有逐年上升的趨勢[1-2]。世界衛(wèi)生組織將膠質(zhì)瘤分為低級別(Ⅰ和Ⅱ)和高級別(Ⅲ和Ⅳ),。Ⅳ級膠質(zhì)母細胞瘤惡性度最高,,10年的生存率不到3%[3],中位生存約12~14個月[4],。盡管常規(guī)MRI特征及先進的功能磁共振技術(shù)有助于膠質(zhì)瘤的分級及患者生存期的預測,,但對腫瘤的分子狀態(tài)及治療反應的評估仍然有挑戰(zhàn)性[5],。目前,腦組織活檢仍然是組織學和遺傳分類的主要標準,。但是該方法有創(chuàng),,且膠質(zhì)瘤中的異質(zhì)性可能影響其診斷的準確性和預后判斷。此外,,在立體定向活檢中,,約7%~15%的患者病理結(jié)果仍不明確[6]。影像組學是一種非侵入性的診斷方法,,借助計算機通過深度挖掘人類肉眼不能識別的深層次腫瘤信息,,全面地評估腫瘤異質(zhì)性[7]。近年來,, MRI影像組學在腦膠質(zhì)瘤中的應用較廣泛,。本文就影像組學概念、MRI影像組學在腦膠質(zhì)瘤中臨床應用,、面臨的問題予以介紹,。

1
影像組學概述及工作流程

影像組學是由Lambin等[8]最先提出。它是一種新興的,、無創(chuàng)的醫(yī)學影像診斷方法,,將計算機技術(shù)與X線、MRI,、CT,、正電子發(fā)射型計算機斷層顯像(positronemission tomography,PET),、超聲檢查等醫(yī)學影像數(shù)據(jù)相結(jié)合,,通過特征值來反映病灶的形狀大小、紋理等信息,,以量化的方式揭示人類肉眼無法識別的與微觀組織異質(zhì)性間接相關(guān)的宏觀組織異質(zhì)性,,并可與病理,、基因等其他臨床資料相結(jié)合,,輔助醫(yī)師做出較準確的診斷[9]。影像組學的臨床應用廣泛,,如疾病的分子表型估計,、分期、預后判斷等[10-12],,顯示出了較大潛力,。

MRI影像組學也是影像組學是一部分,大概包括以下流程:MRI圖像的采集,、感興趣區(qū)勾畫及病灶分割,、MRI影像特征提取,、影像特征選擇、預測模型的建立及驗證,。

圖像采集參數(shù)如磁場強度,、空間分辨率、信噪比及不同的脈沖序列等都會影響MRI影像組學特征,。但是,,MRI軟組織分辨率高,多序列成像可以使紋理信息相互補充,,這點優(yōu)于CT或PET等其他成像模式,。采集后的圖像借助開源或商業(yè)軟件進行感興趣區(qū)的勾畫及圖像分割、強度標準化,、灰度級降級等預處理,,可增強像素特征及信號強度標準化、統(tǒng)一化,。勾畫感興趣區(qū)是影像組學分析的基礎,,有手動、半自動及全自動勾畫方式,。手動勾畫被認為是最準確的方法,,費時費力,有個體差異,。全自動勾畫省時省力,,對于邊界模糊、周圍有水腫的腫瘤,,勾畫范圍并不能與實際情況匹配,。下一步是影像特征的提取,包括對描述病變形狀和大小等語義特征,,無需計算機輔助就可得到,;另一方面是非語義特征,主要是反應病變像素強度的紋理特征,,可以基于統(tǒng)計,、模型、變換等數(shù)學方法提取,。常用的基于統(tǒng)計方法的紋理特征包括一階(描述單個體素的分布),、二階及高階特征(描述兩個或兩個以上像素之間空間分布強度關(guān)系,通過灰度共生矩陣和灰度游程矩陣等方法獲取),。紋理特征的普遍應用致影像組學特征數(shù)目很多,,故需對特征初步篩選后進行統(tǒng)計分析,以解決冗余及過度擬合問題。提取的影像特征與臨床資料,、基因等進行相關(guān)性分析后,,建立預測模型,通過模型完成對病變病理生理,、生物學等特性的預測,。

2
MRI影像組學在腦膠質(zhì)瘤中的臨床應用
2.1
腦腫瘤的術(shù)前分級及鑒別診斷

Qin等[13]利用影像組學方法對膠質(zhì)瘤進行術(shù)前分級, 對提取的114個影像組學特征進行篩選,,其中T1增強序列灰度共生矩陣(gray level co-occurence matrix,,GLCM)的熵和ADC圖GLCM的均勻性在區(qū)分高低級膠質(zhì)瘤中有較大潛力,最終提取了8個顯著相關(guān)性特征值,,受試者工作特征(receiver operating characteristic,,ROC)的曲線下面積(areaunder curve,AUC)為0.943,。Su等[14]發(fā)現(xiàn)多模態(tài)MRI影像組學特征可區(qū)分膠質(zhì)瘤亞型,,其中區(qū)分低和高級別膠質(zhì)瘤中,最佳AUC為0.911,。同時,,在一些影像鑒別診斷中,MRI影像組學也顯示出較大臨床價值,。Kim等[15]分析了143例患者術(shù)前包括擴散加權(quán)成像在內(nèi)的多模態(tài)MR影像組學特征,,基于邏輯回歸分類器對膠質(zhì)母細胞瘤和原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)淋巴瘤進行鑒別,結(jié)果發(fā)現(xiàn)AUC,、靈敏度和特異性分別為0.979,、0.938、0.944,。此外,,F(xiàn)etit等[16]發(fā)現(xiàn)影像組學紋理特征可以對兒童幕下腦腫瘤包括髓母細胞瘤、毛細胞星形細胞瘤和室管膜瘤進行的鑒別分類,。也有學者基于病灶對氟代脫氧葡萄糖攝取多少,,利用PET相關(guān)的紋理特征對病灶良惡性進行判斷的研究[17]。值得注意的是,,盡管影像組學在輔助醫(yī)生進行成人或兒童腦膠質(zhì)瘤分級,、同影不同腫瘤的鑒別及良惡性判斷方面提供了診斷依據(jù),但是大多是基于單中心或較少模態(tài)的回顧性研究,,如與磁共振灌注成像及彌散張量成像等相關(guān)組學研究較少,。

2.2
膠質(zhì)瘤基因表達狀態(tài)的判斷

因為外科活檢獲取腦膠質(zhì)瘤基因數(shù)據(jù)的方式有一定局限性,,所以有學者研究影像組學與基因相關(guān)性,,非侵入性地量化腫瘤基因異質(zhì)性。如Han等[18]對Ⅱ級和Ⅲ級膠質(zhì)瘤的染色體1p/19q共缺失狀態(tài)進行單中心回顧性術(shù)前預測研究,, 利用支持向量機(supportvector machines,,SVM)分類后發(fā)現(xiàn)MRI影像組學特征能夠?qū)Φ图墑e膠質(zhì)瘤的1p/19q狀態(tài)進行有效識別,。除此之外,其還可以對膠質(zhì)母細胞瘤進行相關(guān)基因預測,。如Li等[19]利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(convolutional neural network,,CNN)方法對多個機構(gòu)膠質(zhì)母細胞瘤患者的術(shù)前MRI圖像中4個亞區(qū)(壞死區(qū)、水腫區(qū),、強化區(qū)域及非強化區(qū)域)進行分析,,最終篩選出與MGMT甲基化狀態(tài)相關(guān)的6個影像組學特征,并建立預測模型,,AUC值及準確率分別為0.88 和80%,。Chang等[20]從TCIA數(shù)據(jù)庫中獲取了256個包括高、低級別膠質(zhì)瘤患者的MRI圖像數(shù)據(jù),,基于CNN算法提取ROI內(nèi)與基因相關(guān)聯(lián)的影像組學特征,,發(fā)現(xiàn)預測IDH狀態(tài)的準確度達到94%,1p/19q共同缺失狀態(tài)達到92%,,MGMT啟動子甲基化狀態(tài)達到83%,。所有影像組學特征可以直接從深層神經(jīng)網(wǎng)絡算法中獲取,避免了特征分析帶來額外誤差,。

2.3
膠質(zhì)瘤療效預測及預后評估

以往的研究通過患者的年齡,、腫瘤的部位、大小,、切除范圍及傳統(tǒng)影像學方法等作為預后預測因子,,特別是僅基于病灶大小及有無強化來評估神經(jīng)膠質(zhì)瘤的治療反應,有一定的局限性[21],。影像組學能挖掘深部肉眼無法識別的紋理特征,,更有助于評價病變療效及預測預后[22-23]。Xi等[24]高通量提取經(jīng)替莫唑胺化療后的MGMT甲基化膠質(zhì)母細胞瘤療效的相關(guān)MRI影像組學特征,,降維后建立SVM分類模型,,分類特異性及敏感性分別為88.80%、83.84%,,驗證集有相似的結(jié)果,。Brynolfsson等[25]對高級別膠質(zhì)瘤患者放化療術(shù)前和術(shù)后的ADC圖進行紋理分析,來評估腫瘤對放化療的反應性,,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ADC紋理特征可以作為影像學標記物有效鑒別高級別膠質(zhì)瘤治療后進展情況,。Sanghani等[26]基于腫瘤的形態(tài)、體積及紋理特征對多形性膠質(zhì)母細胞瘤的總生存期進行預測研究,,發(fā)現(xiàn)SVM分類器在患者組(生存時間≤400 d和>400 d)的總生存期預測準確性為98.7%,。Macyszyn等[27]也報道了MRI 紋理特征可以預測對膠質(zhì)母細胞瘤的生存期,發(fā)現(xiàn)SVM模型可以將患者的生存分為短期、中期及長期類別,,準確度大80%以上,。

2.4
膠質(zhì)瘤術(shù)后真性和假性進展區(qū)分

鑒別真性和假性進展對腦膠質(zhì)瘤患者后期的治療非常重要。目前,,唯一準確的鑒別方法是組織活檢和短期臨床影像隨訪,,這會造成患者二次創(chuàng)傷或延誤治療時機。常用的RANO標準又不能完全準確識別假性進展病例[28],。而可以定量的MRI影像組學為二者鑒別提供了新的方法,。如Hu等[29]對31例患者的多參數(shù)MRI數(shù)據(jù)分析,利用傳統(tǒng)的SVM方法建立了真假性進展分類器,,靈敏度為89.9%,,特異性為93.7%, ROC曲線下面積為0.944,。同時,,有文獻提到深度神經(jīng)網(wǎng)絡學習方法有助于提高影像組學分析結(jié)果的準確性。如Jang等[30] 首次利用長短時記憶模型與卷積神經(jīng)網(wǎng)絡相結(jié)合的模型進行膠質(zhì)瘤術(shù)后真假性進展研究,,并建立包含MRI影像組學特征和臨床資料的預測模型,,發(fā)現(xiàn)預測模型在驗證集中的AUC值為0.83。該文獻也證明了CNN相關(guān)模型的預測性能優(yōu)于傳統(tǒng)隨機森林模型,??梢娪跋窠M學在鑒別膠質(zhì)瘤真假性進展方面有一定的潛力。

3
問題及展望

近年來,,相關(guān)綜述報道了影像組學在腫瘤診療中價值和潛力,,但在臨床實踐中仍然存在問題[31-32]。首先,,影像組學相關(guān)紋理提取及分析軟件不一,,有開放的、商業(yè)的及內(nèi)部研發(fā)的,,相應的多機構(gòu)研究結(jié)果之間不易對比,,軟件性能不易鑒別;其次,,MRI采集設備,、掃描參數(shù)和后處理方法等有差異,對腫瘤相關(guān)研究結(jié)果有影響,,包括多中心研究,。因此, 影像組學研究方法規(guī)范化,、數(shù)據(jù)采集和成像參數(shù)標準化至關(guān)重要,,才能保證研究結(jié)果有很好的重復性和普遍性,。此外,有關(guān)機器學習的理論基礎尚未完全建立起來[33],。在某中意義上說,MRI影像組學是將數(shù)學計算機與影像及相關(guān)臨床數(shù)據(jù)進行分析,,進行統(tǒng)計學比較,。這些統(tǒng)計學的重要意義與生理學相關(guān)性目前尚不清楚,有待被證實和驗證,。盡管MRI影像組學存在諸多不足,,但其作為一種新興的量化診斷方式為腦腫瘤精準診斷、療效評估,、預后預測等提供了突破口,。隨著研究方法的規(guī)范化、MRI數(shù)據(jù)大量積累及采集標準化,,以及相關(guān)機器學習理論的不斷完善,,影像組學將有助于加深對腦膠質(zhì)瘤的了解,推動臨床轉(zhuǎn)化,,更好地輔助臨床診療,。

利益沖突:無。

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