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另辟蹊徑,!“基因魔剪”靶向RNA

 紫微o太微o天市 2020-03-18
來源:科技日報2020-03-18 09:24
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  科技日報北京3月17日電(記者劉霞)美國研究人員在今天出版的《自然·生物技術(shù)》雜志上報告稱,,現(xiàn)有的CRISPR基因篩查方法只能編輯或靶向DNA,他們另辟蹊徑,,開發(fā)出一種靶向RNA的新型CRISPR篩查技術(shù),,最新研究有望促進(jìn)基因組學(xué)和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展。

  研究人員解釋稱,,現(xiàn)有基于CRISPR的遺傳篩查方法幫助科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了癌癥免疫療法及多種其他疾病的關(guān)鍵基因,,但這些方法只能編輯或靶向DNA。對人類基因組的許多區(qū)域來說,,靶向DNA可能無效,,而且,冠狀病毒或流感之類的RNA病毒也根本無法借助現(xiàn)有CRISPR篩選方法來應(yīng)對,。

  據(jù)物理學(xué)家組織網(wǎng)16日報道,,有鑒于此,紐約基因組中心和紐約大學(xué)內(nèi)維爾·桑賈納博士實(shí)驗(yàn)室開發(fā)出了這種靶向RNA的新型CRISPR篩查技術(shù),。

  在最新研究中,,科研團(tuán)隊(duì)用到了一種最近被表征的CRISPR酶Cas13,該酶靶向RNA而非DNA,。他們使用Cas13設(shè)計(jì)了一個優(yōu)化平臺,,用于在人類細(xì)胞內(nèi)的RNA水平上開展大規(guī)模平行基因篩選。這一篩選技術(shù)可用于了解RNA調(diào)節(jié)的多個方面,,并確定非編碼RNA(被蛋白產(chǎn)生但不編碼蛋白的RNA分子)的功能,。

  通過靶向人類RNA轉(zhuǎn)錄物中數(shù)千個不同位點(diǎn),他們開發(fā)出一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)的預(yù)測模型,,以更快鑒定出最有效的Cas13引導(dǎo)RNA,。他們表示,可以通過交互式網(wǎng)站和開源工具箱使用這項(xiàng)新技術(shù),,預(yù)測用于定制RNA靶標(biāo)的向?qū)NA的效率,,并為所有人類蛋白編碼基因提供預(yù)設(shè)向?qū)NA。

  桑賈納博士說:“我們預(yù)計(jì),靶向RNA的Cas13酶將對分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)應(yīng)用產(chǎn)生重大影響,,但我們現(xiàn)在對于如何設(shè)計(jì)出高靶向效力的引導(dǎo)RNA知之甚少,,我們打算通過系統(tǒng)深入的研究來改變這一點(diǎn),開發(fā)出最有效的設(shè)計(jì)指南和預(yù)測模型,。”

  紐約基因組中心首席執(zhí)行官湯姆·馬尼亞蒂斯表示:“最新CRISPR技術(shù)對推動基因組學(xué)和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展意義重大,?!?/p>

  研究人員稱,新型冠狀病毒包含一個RNA而非DNA基因組,,使用他們的大規(guī)模平行篩查模型,,他們確定了可用于未來檢測和治療新冠病毒的最佳引導(dǎo)RNA。

[ 責(zé)編:張夢凡 ]

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