新型冠狀病毒的檢測在過去一段時(shí)間內(nèi)成為了被大家所關(guān)心的話題,。一方面,,早在1月上旬,科學(xué)家們對(duì)新型冠狀病毒完成測序之后就有好幾家企業(yè)加班加點(diǎn)兩三天內(nèi)完成了“核酸檢測試劑盒”,,并且產(chǎn)能看起來頗為足夠,。但另一方面,即使中旬后放開了檢測標(biāo)準(zhǔn),,不需要通過國家疾控中心才能確診,,仍然有大量患者無法得到確診。這其中的檢測卡口以及使用試劑盒檢測的難點(diǎn)到底在哪呢,? 乍聽起來,,試劑盒好像是類似于化學(xué)課上酸堿試紙那樣的東西,滴一滴就會(huì)變色,??蓪?shí)際上它的用法與最初的想象大不相同,復(fù)雜多了,。 確診由病毒引起的疾病有幾種方式,。從大類上分,可以直接檢測病毒的核酸,,或者檢測病毒中會(huì)讓人產(chǎn)生免疫反應(yīng)的抗原,,或是檢測人體免疫反應(yīng)所產(chǎn)生的抗體。由于科學(xué)家迅速對(duì)病毒完成了測序,,因此這次最早完成設(shè)計(jì)生產(chǎn)的試劑盒也是屬于檢測核酸的類別,。它使用的方法叫做PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)),能夠快速對(duì)微量DNA進(jìn)行檢測,,并且相當(dāng)靈敏,。除了生物領(lǐng)域以外,它在法醫(yī)和考古等領(lǐng)域也有著重要的應(yīng)用,。順帶一提,,這兩天出現(xiàn)的一種能在15分鐘內(nèi)完成檢查的快速檢測盒是屬于檢測抗體的類型,不過關(guān)于那種測試方法,,就需要另外一篇文章來解釋了,。 檢測冠狀病毒的時(shí)候會(huì)采取病人的鼻咽拭子、痰液,、肺泡灌洗液等作為樣本——換言之就是可能包含有病毒的東西,。之后,需要用試劑提取出其中的核酸部分,。由于冠狀病毒的遺傳物質(zhì)是單鏈的RNA,,因此還需要使用逆轉(zhuǎn)錄酶將RNA逆轉(zhuǎn)錄為DNA,。 回顧一下中學(xué)生物有關(guān)DNA的內(nèi)容:DNA是生物體內(nèi)記錄信息的物質(zhì),呈雙鏈結(jié)構(gòu),。每條鏈都由一系列核苷酸組成,。每個(gè)核苷酸會(huì)攜帶四種堿基之一:A,T,,C和G,。兩條鏈之間按A-T和C-G的堿基互補(bǔ)規(guī)則匹配。檢測病毒時(shí),,樣本內(nèi)不只有病毒的核酸,,還有人體細(xì)胞以及其他各種正常存在的細(xì)菌、病毒的核酸,。打個(gè)比方的話,,就好像是要求從一個(gè)雜亂無章的圖書倉庫里找出有沒有西游記一樣。PCR的想法就是對(duì)需要的DNA片段進(jìn)行復(fù)制,。如果有一種專門負(fù)責(zé)抄寫西游記的小妖怪,,一本抄兩本,兩本抄四本,,那只要倉庫里有一本西游記,,很快就能讓倉庫里出現(xiàn)大量的西游記,到時(shí)候再檢測就容易多了,。 這種小妖怪聽起來很神奇,,實(shí)際上模擬的正是我們體內(nèi)每天都在進(jìn)行的DNA復(fù)制。PCR首先會(huì)用高溫讓DNA變成單鏈,,然后利用兩種物質(zhì)進(jìn)行DNA復(fù)制過程:一種叫“引物”,是一小串核苷酸鏈,,能自動(dòng)結(jié)合到能夠匹配的DNA片段上,。可以把它想像成一個(gè)神奇書簽,。預(yù)先往書簽上寫好幾個(gè)字,,它就可以自動(dòng)找出倉庫里寫有這幾個(gè)字的書頁粘上去。另一種叫“聚合酶”,,會(huì)從引物開始,,為單鏈DNA補(bǔ)齊另外一條。它相當(dāng)于一個(gè)抄書匠,,會(huì)從神奇書簽開始抄書,。這樣就產(chǎn)生了“擴(kuò)增”“特定”DNA片段的效果。設(shè)計(jì)病毒的核酸檢測試劑盒的過程主要是根據(jù)病毒的測序結(jié)果選擇其中的幾個(gè)有特征的基因,,并在每個(gè)基因靠近頭尾的地方選取兩串引物,。為了保證實(shí)驗(yàn)效果,,對(duì)引物還有一些額外的要求,比如活性溫度必須適當(dāng),,引物之間不能結(jié)合等等,。 除了復(fù)制以外,還需要檢測擴(kuò)增過程是否順利,。目前的試劑盒采用的是熒光探針法,。熒光探針是帶有兩個(gè)額外基團(tuán)的小串核苷酸鏈,其中一個(gè)能放出熒光,。但是,,探針完整時(shí)熒光會(huì)被另一個(gè)基團(tuán)吸收。在DNA復(fù)制過程中,,聚合酶會(huì)將熒光探針分解,,產(chǎn)生熒光。這就像是一個(gè)有著熒光膜的神奇書簽,。抄書匠在抄書過程中一旦發(fā)現(xiàn)就會(huì)撕掉,。DNA每擴(kuò)增一次理論上就會(huì)多一倍熒光分子,這樣就可以根據(jù)熒光的強(qiáng)度看出DNA擴(kuò)增的次數(shù),。如果原始樣品里有目標(biāo)片段,,熒光的強(qiáng)度就會(huì)隨著擴(kuò)增次數(shù)指數(shù)增長。如果沒有目標(biāo)片段,,就不會(huì)產(chǎn)生新的熒光分子,。 這整套測試過程需要實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)來完成,它有著溫度控制和實(shí)時(shí)檢測熒光強(qiáng)度的功能,。分解DNA成單鏈,、引物結(jié)合和聚合酶工作的反應(yīng)溫度均不相同,儀器需要以固定的時(shí)間間隔在兩個(gè)溫度間循環(huán)(后兩者所需溫度差不超過3攝氏度時(shí)可以用一個(gè)溫度),。檢測熒光強(qiáng)度則需要包含光源和探測器的裝置,。光源能夠精密地照射到每一個(gè)樣品上,然后由探測器檢測熒光的強(qiáng)度,。隨著擴(kuò)增循環(huán),,熒光強(qiáng)度就會(huì)畫出一條曲線,用以判斷目標(biāo)DNA片段是否存在,。按照目前新聞的報(bào)道,,PCR每批測試時(shí)間需要2-4個(gè)小時(shí),普通PCR儀一次可以對(duì)96個(gè)樣本進(jìn)行測試,,高級(jí)的PCR儀可以一次做384個(gè)樣本,,武漢市內(nèi)十個(gè)實(shí)驗(yàn)室每天總共可以檢測2000多例。(到文章發(fā)布為止,湖北省內(nèi)據(jù)說每天可以檢測4000多例) 除此之外,,由于PCR技術(shù)異常靈敏,,因此需要專門的實(shí)驗(yàn)室和人員進(jìn)行操作。在基本的實(shí)驗(yàn)室布置中,,儲(chǔ)藏試劑,、準(zhǔn)備樣品和進(jìn)行PCR需要在三個(gè)不同的房間進(jìn)行,并且還需要PCR室保持負(fù)壓潔凈狀態(tài),,即PCR室的空氣不會(huì)流入其他房間,,這樣才可以保證樣品不會(huì)受到擴(kuò)增后的DNA產(chǎn)物污染。而如果針對(duì)病毒處理的話,,還要求實(shí)驗(yàn)室需要具備相應(yīng)的病毒防護(hù)資質(zhì)才可以(當(dāng)然不需要P4級(jí)別那么高),。整套下來并非所有醫(yī)院都能輕松配備。 而針對(duì)病人,,一個(gè)病人在病程中可能需要經(jīng)歷至少三次測試:一次確診(結(jié)果陽性,,視病程不同也可能因?yàn)榧訇幮远貜?fù)幾次)與判斷治愈需要的兩次測試(要求結(jié)果陰性),而目前每天新增的疑似病人也超過了湖北省內(nèi)的處理能力,。所以雖然生產(chǎn)試劑盒的數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于疑似人數(shù),,但實(shí)際做測試的數(shù)目還是非常有限的。 PS:近期同時(shí)還會(huì)更新Lagniappe,,是關(guān)于抗體是怎么通過試紙檢測的,。大家在家需要注意自己的心態(tài)調(diào)節(jié),出門請(qǐng)格外注意防護(hù),,我們一起共度時(shí)艱,。 PSPS:本篇得到了Vincentheo的大力協(xié)助,愛你,。 熒熒鬼火色滿城亂象皆噤聲哀哀哭新墳 如果你喜歡這個(gè)系列的漫畫,,點(diǎn)個(gè)贊吧!歡迎把它推薦給你的朋友,,也歡迎關(guān)注公眾號(hào)TILcomic(掃下面^_^)~ |
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