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CELL重磅-單細(xì)胞測(cè)序揭示GBM異質(zhì)性的關(guān)鍵因素

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-08-05

膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的細(xì)胞狀態(tài)模型及其遺傳和微環(huán)境決定因素

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【Ref: Neftel C, et al.  2019, Cell 178, 1–15 August 8, 2019 .doi:10.1016/j.cell.2019.06.024.】


研究背景


原發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(IDH野生型GBM)是最常見(jiàn)的顱內(nèi)原發(fā)惡性腫瘤,,預(yù)后極差,。目前主要的治療方法包括:手術(shù)切除,以及術(shù)后同步放化療,。盡管如此,,GBM患者的中位生存時(shí)間仍低于20個(gè)月,5年生存率不足5%,。治療效果不佳的主要原因是腫瘤細(xì)胞的高度異質(zhì)性,。關(guān)于GBM的高異質(zhì)性,早在10年前來(lái)自哈佛大學(xué)的團(tuán)隊(duì),通過(guò)對(duì)近500例GBM患者基因表達(dá)譜的分析,,發(fā)現(xiàn)可以依據(jù)其基因表達(dá)譜的不同,,將GBM患者分為4種類型,分別是:神經(jīng)元型(N),,前神經(jīng)元型(PN),,經(jīng)典(CL)和間充質(zhì)(MES)。并且,,不同類型的GBM患者對(duì)于治療的反應(yīng)也是不一樣的,,相較于其他類型的GBM患者,經(jīng)典型GBM的治療效果最佳,。

隨著單細(xì)胞基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,,我們對(duì)于疾病在基因水平的認(rèn)識(shí)提升到了單個(gè)細(xì)胞水平。而這一進(jìn)步優(yōu)勢(shì),,對(duì)于腫瘤異質(zhì)性的研究至關(guān)重要,。近期,在CELL上發(fā)表了題為An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma的研究成果,,該研究通過(guò)對(duì)GBM腫瘤組織進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序及相關(guān)分析和體內(nèi)外驗(yàn)證實(shí)驗(yàn),,揭露了GBM異質(zhì)性的關(guān)鍵因素。

研究方法


該研究通過(guò)對(duì)20例成年人GBM和8例兒童GBM樣本進(jìn)行單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-Seq),,同時(shí)整合TCGA 401例GBM患者的大體測(cè)序數(shù)據(jù),,發(fā)現(xiàn)在GBM中存在四種不同類型的細(xì)胞狀態(tài),而這是驅(qū)動(dòng)GBM異質(zhì)性的關(guān)鍵所在,。接著,,本研究從遺傳物質(zhì)和腫瘤微環(huán)境層面,對(duì)四種狀態(tài)細(xì)胞之間的關(guān)系進(jìn)行了探索研究,;最后通過(guò)體外細(xì)胞,、體內(nèi)小鼠和PDX模型實(shí)驗(yàn),進(jìn)一步驗(yàn)證遺傳和微環(huán)境因素是導(dǎo)致GBM的四種細(xì)胞狀態(tài)異質(zhì)性的主要驅(qū)動(dòng)力,。

研究結(jié)果


本研究發(fā)現(xiàn),,GBM中的惡性細(xì)胞主要存在四種不同的細(xì)胞狀態(tài),分別是:少突膠質(zhì)祖細(xì)胞樣,、神經(jīng)祖細(xì)胞樣,、星形細(xì)胞樣和間質(zhì)細(xì)胞樣的狀態(tài)。盡管在不同GBM患者中,,四種狀態(tài)細(xì)胞的比例各不相同,。但是,這四種狀態(tài)的細(xì)胞之間是可以相互轉(zhuǎn)變的,。也就是說(shuō),,這些狀態(tài)不同的細(xì)胞類型,,受腫瘤微環(huán)境的影響,表現(xiàn)出極強(qiáng)的可塑性,。此外,,本研究發(fā)現(xiàn)這4種狀態(tài)細(xì)胞也可以由同一種細(xì)胞轉(zhuǎn)化而來(lái)。不同狀態(tài)下細(xì)胞的分別受到基因CDK4,,EGFR,,PDGFRA及NF1的影響,,因此,,對(duì)這些基因狀態(tài)的檢測(cè),有助于明確GBM中惡性細(xì)胞的狀態(tài),。

研究結(jié)論


本研究闡明在GBM中存在四種狀態(tài)的細(xì)胞,,而這四類細(xì)胞可能是驅(qū)動(dòng)GBM惡性本質(zhì)的關(guān)鍵。同時(shí)發(fā)現(xiàn),,GBM中的特定遺傳背景能夠影響四種狀態(tài)細(xì)胞的組成比例,。該研究從單細(xì)胞水平對(duì)GBM的異質(zhì)性進(jìn)行了全新的闡述,為GBM的治療提供新的理論依據(jù),。

參考文獻(xiàn)


1. Neftel Cyril,Laffy Julie,Filbin Mariella G et al. An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma.[J] .Cell, 2019, undefined: undefined.
2. Verhaak Roel G W,Hoadley Katherine A,Purdom Elizabeth et al. Integrated genomic analysis identifies clinically relevant subtypes of glioblastoma characterized by abnormalities in PDGFRA, IDH1, EGFR, and NF1.[J] .Cancer Cell, 2010, 17: 98-110.
(闊然基因陳永武博士編譯,,復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院吳帥博士審校,復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院吳勁松教授終審)

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