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楊毅寧:長鏈非編碼RNA在心血管疾病中的研究進展

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-01-13

  哺乳動物基因組高通量測序結果顯示,除小部分RNA分子被翻譯成為蛋白質之外,,還存在大量不編碼蛋白質的RNA序列,,稱為非編碼 RNA(non—coding RNA,ncRNA),,約占哺乳動物基因組轉錄產(chǎn)物的98%,,包括微小RNA(microRNA,miRNA)和長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,,lncRNA)等,。其中長鏈非編碼核糖核酸(long noncoding RNA,lncRNA)是一類長度大于200 nt,,幾乎沒有翻譯功能的核糖核酸,。由于科學技術的飛速發(fā)展,高通量測序以及微陣列技術的成熟,,越來越多的研究發(fā)現(xiàn),,lncRNA參與多種生命活動及疾病的進展,與腫瘤,、心血管疾病,、神經(jīng)退行性病變及代謝性疾病等具有密切關系。

1,、LncRNA的生物學特性及功能

  LncRNA主要由RNA聚合酶Ⅱ轉錄,種類和功能眾多,,可存在于細胞質和細胞核內(nèi),,以初始轉錄的RNA或剪接RNA形式發(fā)揮功能,。基因座非常類似于信使核糖核酸(mRNA),,但編碼lncRNA的基因更傾向位于基因內(nèi)含子中,,這樣可以減少共轉錄剪接的效率,比起進化中傳統(tǒng)的重復序列,,lncRNA面臨著更高的選擇壓力,。lncRNA通過順式作用及反式作用調(diào)控基因的轉錄過程。lncRNA可通過表觀遺傳,、轉錄調(diào)控以及轉錄后調(diào)控等多種機制調(diào)控DNA甲基化,、組蛋白修飾或染色質重構,使基因沉默或激,。它可以作為支架結合多種蛋白從而發(fā)揮生物學功能,,它還可以形成一個錨定點,通過征集或扣押某些蛋白因子,,參與核酸序列的合成和重構,,從而調(diào)節(jié)不同的生命活動。此外有研究顯示lncRNA 還可以作為微小核糖核酸海綿吸附microRNA,,從而調(diào)控細胞的生命活動,。

2、lncRNA與心血管疾病的關系

  研究發(fā)現(xiàn),,lncRNAs的表達或功能異常與人類疾病的發(fā)生密切相關,,包括癌癥、退行性神經(jīng)疾病,、炎癥性疾病在內(nèi)的多種重大疾病,。隨著研究的逐步深入,越來越多的與心血管疾病相關的lncRNAs進入我們的視野,,這些lncRNAs在心血管疾病患者和小鼠心臟病理模型中不斷被發(fā)現(xiàn),,在心肌梗死、心力衰竭等疾病中差異表達的心臟特異性lncRNAs可能在心臟結構重塑,、心肌再生,、心功能改變及心血管疾病中發(fā)揮重要作用,為心血管疾病的發(fā)病機制及干預機制提供了新的思路,。


2.1 lncRNAs與急性心肌梗死


??2010年日本科學家Rapicavoli等研究發(fā)現(xiàn)了一種新的lncRNA,,并將其命名為心肌梗死相關轉錄本(Myocardial infarction-associated transcript,MIAT),,其長度約為9kb,,主要表達于神經(jīng)系統(tǒng),在視網(wǎng)膜細胞發(fā)育中發(fā)揮重要作用。全基因組單核苷酸多態(tài)性研究表明MIAT中存在的SNP位點rs2301523與心肌梗死及多種疾病易感性高度相關,。在心肌梗死組中非ST段抬高型心肌梗死MIAT水平比ST段抬高型心肌梗死高,,并進一步證明MIAT與心肌梗死有關且可能作為預防或治療心肌梗死的靶點。動物實驗表明,,應用小鼠心肌梗死模型許多l(xiāng)ncRNAs產(chǎn)生改變,,其中MIAT1和MIAT2上調(diào),心肌梗死24小時后 MIAT1和MIAT2表達達到高峰且48小時后回落到基礎水平,。進一步通過原位雜交發(fā)現(xiàn)MIAT1定位在心肌梗死模型小鼠的左心室且MIAT1和MIAT2表達與心室重塑,、心臟射血分數(shù)相相關。除此之外,,來源于線粒體基因的LIPCAR被認為是AMI后重塑的一個標志物,。MDRL,H19,、UCA1等lncRNAs已被證明和在急性心肌梗死中發(fā)揮作用,。為心肌梗死和診斷的治療提供了新的靶點和方向。


2.2 lncRNAs與心肌肥厚


??心肌肥厚常伴隨不良的心肌重塑降低了心肌順應性,,增加了心力衰竭的危險性,,目前大量研究正在探索lncRNAs對心肌肥厚和心肌重構的作用。通過對心肌肥厚小鼠模型進行表達譜功能分析,,發(fā)現(xiàn)存在lncRNA-mRNA共表達網(wǎng)絡體系,,進而發(fā)現(xiàn)與心肌肥大、橫紋肌肥大,、肌肉肥厚等心肌肥厚病理過程相關的多種lncRNAs,。科學家在主動脈弓縮窄和人心力衰竭模型中發(fā)現(xiàn)高表達的lncRNA AK04845,,將其命名為心肌肥厚相關因子(CHRF),,廣泛表達在心血管和其他組織,通過直接與拮抗心肌肥厚分子miRNA489結合并下調(diào)其表達水平,,通過上調(diào)下游髓樣分化初級應答基因進一步激活NF-?B系統(tǒng)來誘導心肌肥厚發(fā)生,,在心肌細胞誘導心肌肥厚、凋亡,。


??心臟成纖維細胞有助于改善壓力負荷所致心肌細胞肥大和隨后出現(xiàn)的心力衰竭,,具有心臟保護功能。lncRNA微陣列芯片技術分析發(fā)現(xiàn),,在一些神經(jīng)內(nèi)分泌信號如血管緊張素II等作用下,,心臟成纖維細胞lncRNA表達會發(fā)生顯著改變,進一步實時定量PCR證實在心臟成纖維細胞中發(fā)生改變的6個lncRNAs中,,lncRNA-NR024118表達隨著時間延長而下降,。在ANGII誘導的心肌細胞肥大模型中發(fā)現(xiàn)lncRNA BC088254和Phb2表達降低,,表明BC088254和Phb2與心肌肥厚有關,進一步的研究表明lncRNA BC088254在壓力性負荷誘導心肌肥厚模型中有重要調(diào)控作用,。


2.3 lncRNAs與心力衰竭


??心力衰竭是心血管疾病的終末階段,,也是心臟疾病的重要死因,在世界范圍內(nèi)具有較高死亡率,。在心力衰竭的進展過程中,一些胎兒型基因表達增加,,一些成人型基因表達降低,,這種基因表達紊亂導致心肌重構。心肌肥厚是心力衰竭的結構改變,,也是心力衰竭的治療靶點,。lncRNA不僅參與心力衰竭的發(fā)展,研究表明它還可以作為預測心力衰竭患者心血管事件發(fā)生的標志物之一,。lcnRNA uc022bqs.1 與心力衰竭患者遠期心血管死亡事件具有顯著相關性,。研究者們在小鼠心力衰竭模型中發(fā)現(xiàn)的參與心力衰竭發(fā)病,具有心臟特異性的lncRNAs,,被命名為肌球蛋白重鏈相關的RNA轉錄物(Myheart或Mhrt) ,。Mhrt是一種心臟保護性lncRNA,為ATP依賴的染色質重塑因子,。Mhrt通過在DNA水平阻止相關復合物識別靶DNA,,抑制染色質結合DNA和染色質重塑,進行基因水平調(diào)控,。在其他一些關于心力衰竭的研究中,,CDKN2B-AS1/ANRIL, HOTAIR和LOC285194/TUSC7表現(xiàn)出作為心力衰竭生物學標志物的潛力。

3,、前景與展望

  目前l(fā)ncRNAs的研究取得了迅猛進展,,隨著科技的進步,研究技術及研究手段的不斷發(fā)展,,對lncRNAs研究以及醫(yī)學信息學發(fā)展的深入,,研究心血管疾病中l(wèi)ncRNAs的作用機制可能會成為心血管疾病發(fā)病和治療的突破口。目前的研究已經(jīng)揭示了部分lncRNAs生物生成機制和調(diào)控通路以及它們在心血管疾病中的作用,,但其介導的基因表達調(diào)控網(wǎng)絡及其作用機制仍然存在大量空白,。隨著科學技術的不斷進步和研究方法的穿心,我們期待能夠更快更高效地發(fā)現(xiàn)心血管疾病相關的功能性lncRNAs,,并進一步闡明它們影響心血管疾病發(fā)生的分子機制,,為心血管疾病提供新的診斷依據(jù)和防治手段。

專家簡介

  楊毅寧,,醫(yī)學博士,,博士生導師,教授/主任醫(yī)師,優(yōu)秀研究生導師,,新疆自然科學專家,,新疆醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院學科帶頭人,現(xiàn)任新疆醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院副院長,,新疆心血管病研究重點實驗室副主任,。

  2017年入選“國家百千萬人才工程”并授予“有突出貢獻中青年專家”榮譽稱號。先后入選自治區(qū)“天山雪松計劃”科技創(chuàng)新領軍人才后備,,教育部新世紀優(yōu)秀人才計劃,,新疆醫(yī)科大學“天山英才”培養(yǎng)計劃第一層次。兼任美國FACC榮譽會員,,中華醫(yī)學會心血管病學分會青年委員會委員,,中華醫(yī)學會心血管病學分會結構心臟病專業(yè)學組成員,中國醫(yī)師協(xié)會心血管病分會動脈粥樣硬化委員會委員,,新疆中西醫(yī)結合學會介入專業(yè)委員會第一屆副主任委員,,新疆醫(yī)科大學教學名師,衛(wèi)生部心血管疾病介入診療培訓基地導師,,亞洲心臟協(xié)會干事等,。擔任《JACC》中文版編委(2015.10)、《中國全科醫(yī)師雜志》,、《動脈粥樣硬化雜志》,、《新疆醫(yī)科大學學報》編委。

  每年平均完成經(jīng)皮冠狀動脈介入治療(PCI)1200余例,,先心病介入封堵術200余例,,開展IVUS、OCT等血管腔內(nèi)檢查,,引領實施TAVR技術,。主持國家重點研發(fā)計劃1項,國家自然科學基金5項,,教育部新世紀優(yōu)秀人才計劃項目1項,,自治區(qū)級科研項目6項,參與國家自然科學基金,、國家“十一五”計劃子課題及橫向課題,、自治區(qū)重大專項等20余項研究。榮獲自治區(qū)科技進步一等獎1項,,二等獎5項等,。以第一作者或通訊作者身份發(fā)表學術論文106篇,其中SCI論文45篇,。主編專著5部,,參編著作2部,;獲得實用新型專利1項,參與公開專利17項,。

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