今天是第616期日報。

Nature Reviews：結(jié)直腸癌治療新突破（2017年度回顧）

Nature Reviews Clinical Oncology[IF:20.693]

① 2017年結(jié)腸直腸癌的研究成果對于疾病治療及患者的生存結(jié)果產(chǎn)生巨大影響,；② 3個月化療可能被認作輔助治療新護理標準,，與目前6個月療程相比，在保證總體療效的同時降低了III期結(jié)腸癌患者的神經(jīng)毒性風險,；③ 針對PD-1的免疫檢查點抑制劑被FDA批準用于高不穩(wěn)定DNA錯配修復缺陷轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌,，成為患者進一步治療的新思路；④ 腫瘤側(cè)性作為具有預后及預測能力的新型生物標記物，可影響RAS野生型轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者一線治療生物制劑的選擇,。

Colorectal cancer in 2017: Practice-changing updates in the adjuvant and metastatic setting

2017-11-28  DOI: 10.1038/nrclinonc.2017.185

BJ：組學研究揭示雙歧桿菌益生作用的機制（綜述）

Biochemical Journal[IF:3.797]

① 二代測序和比較與功能組學方法為研究雙歧桿菌的功能提供了強大的工具,；② 雙歧桿菌的基因組著編碼多種元件（如分子伴侶、外排泵等）以抵抗消化道逆境（如滲透,、氧化,、膽汁酸等壓力），促進其穿過胃屏障及小腸而定殖于大腸中,；③ 其基因組中存在菌毛編碼基因,，介導菌體與宿主表面的粘附，調(diào)控宿主免疫功能,，有助于細菌之間的相互作用,；④ 鑒定到多種糖基水解酶編碼基因，提示雙歧桿菌屬中不同種的細菌能夠“相互喂養(yǎng)”,，共同定殖在宿主體內(nèi),。

Omics of bifidobacteria: research and insights into their health-promoting activities

2017-12-06  DOI: 10.1042/BCJ20160756

BJP：如何系統(tǒng)性鑒定精神益生菌（綜述）

British Journal of Pharmacology[IF:5.491]

① 腦-腸-菌群軸被認為是能為精神病患者提供創(chuàng)新療法的新范式，其重點是在臨床層面上系統(tǒng)性鑒別出精神益生菌（psychobiotics）,；② 精神益生菌指被攝入足夠數(shù)量時呈現(xiàn)精神健康益處的活細菌,，能為與壓力相關的焦慮和抑郁癥提供新療法；③ 在臨床前研究中或可發(fā)現(xiàn)對行為,、腸道通透性、神經(jīng)活性有益處和減少促炎癥與應激反應的菌株,；④ 通過最終在人身上做的隨機對照研究,，確定特定菌株的益生菌功效，終產(chǎn)品形態(tài)可為益生菌制劑,、益生元或合生元,。

Finding the needle in the haystack: systematic identification of psychobiotics

2017-12-15  DOI: 10.1111/bph.14127

Microbiome：甲基萘醌是人體腸道菌群的生長因子

Microbiome[IF:8.496]

① 將人體腸道菌群中生長較慢的群落與生長較快的群落共同培養(yǎng)，鑒定出8對在分類學上不同的細菌,，“幫手”細菌可促進另一種“被誘導的”細菌生長,；② 大腸桿菌可促進所有8株分離出的“被誘導的”細菌生長，利用敲除文庫進行篩選,，發(fā)現(xiàn)甲基萘醌生物合成途徑對其生長促進作用是必需的,；③ 純化出的甲基萘醌可促進8株分離出的被誘導的”細菌中的7株生長；④ 甲基萘醌是人體腸道菌群的一類主要生長因子,。

Quinones are growth factors for the human gut microbiota

2017-12-20  DOI: 10.1186/s40168-017-0380-5

NPJBM：對腸道中艱難梭菌進行定量分析的新方法

NPJ Biofilms and Microbiomes[IF:N/A]

① 用Resphera Insight分析平臺,，在菌種水平定量艱難梭菌在腸道菌群中的比例；② 艱難梭菌感染的初診人群中,，艱難梭菌的檢出率為131/156,，平均豐度為1.78%，對照組健康人群中，檢出率為18/211,，平均豐度為0.008%,；③ 斷奶前，約2/3的嬰兒腸道中存在艱難梭菌,，占總菌群的平均比例高于1%,；④ 艱難梭菌與Clostridium scindens及若干Blautia菌屬的數(shù)量呈負相關；⑤ 該方法有助于估計艱難梭菌的定植,，有利于開發(fā)新的預檢指標和治療方法,。

High-resolution profiling of the gut microbiome reveals the extent of Clostridium difficile burden

2017-12-05  DOI: 10.1038/s41522-017-0043-0

Cell子刊：鼠檸檬酸桿菌要定殖于腸粘膜，依賴特定共生菌群

Cell Reports[IF:8.282]

① 帶有卡那霉素抗性的鼠檸檬酸桿菌感染小鼠后,，若無卡那霉素存在,，鼠檸檬酸桿菌存在于結(jié)腸粘膜中；② 一次卡那霉素處理后,，具有毒性的鼠檸檬酸桿菌可在小鼠的盲腸內(nèi)腔中存在,，但結(jié)腸粘膜中無鼠檸檬酸桿菌；③ 持續(xù)性的卡那霉素處理后,，無毒性的鼠檸檬酸桿菌可在小鼠的盲腸內(nèi)腔中存在,，但結(jié)腸粘膜中無鼠檸檬酸桿菌；④ 萬古霉素或甲硝噠唑處理后,，鼠檸檬酸桿菌仍存在于結(jié)腸粘膜中,，提示其在結(jié)腸粘膜中的定殖依賴于特定共生菌群。

Citrobacter rodentium Relies on Commensals for Colonization of the Colonic Mucosa

2017-12-19  DOI: 10.1016/j.celrep.2017.11.086

ANM：適用于克羅恩病患者的營養(yǎng)篩查工具

Annals of Nutrition and Metabolism[IF:2.424]

① 為探究適用于克羅恩病患者的營養(yǎng)篩查工具,，選取40名患者的住院時間（LOS）及腸切除情況進行分析,；② 發(fā)現(xiàn)主觀整體評估、NRS 2002,、O-PNI,、營養(yǎng)控制狀況、血清白蛋白水平,、體重下降率等參數(shù)與LOS相關,，與腸切除無關；③ 而預后評價顯示血清白蛋白截止值為3.3g/dL,、O-PNI截止值為36.5,；④ 結(jié)合血清白蛋白截止值和NRS2002評分，4組患者中最差預后組LOS率為68.2%,；⑤ 結(jié)合NRS 2002及血清白蛋白水平的評估適用于克羅恩病住院患者的營養(yǎng)篩查,。

Nutritional Screening and Clinical Outcome in Hospitalized Patients with Crohn's Disease

2017-12-14  DOI: 10.1159/000485637

PNAS：大西洋海水菌群的溶質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白

PNAS[IF:9.661]

① 收集大西洋中100-5000米深的水樣，進行宏蛋白組及宏基因組分析,；② 在較淺處的透光層中,，溶質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白占鑒定出的蛋白序列的23%，在深海區(qū)，這一比例約為39%,，提示深海中異養(yǎng)的核心作用,；③ 通過菌群表達的轉(zhuǎn)運蛋白，對深海區(qū)菌群的底物偏好進行分析,，發(fā)現(xiàn)除了氨基酸外,，多肽、碳水化合物,、羧酸,、相容性溶質(zhì)均可能是菌群群落的必需底物；④ α-變形桿菌綱,、γ變形菌綱,、δ-變形菌綱的溶質(zhì)轉(zhuǎn)運蛋白表達量最高。

Organic matter processing by microbial communities throughout the Atlantic water column as revealed by metaproteomics

2017-12-18  DOI: 10.1073/pnas.1708779115