為什么說這個繪圖工具神奇,，因為它用起來簡單，畫出來的圖好看,，功能也很全面,。真的假的？這是個外掛吧,？下面Up主就來逐幀分析,，實錘這個工具Echart(http://www./ImageGP/)。

先看一下它能畫哪些圖：

是不是你想要的都在這里了,？

再看一下畫出來的圖效果如何呢,？

熱圖

火山圖

Venn圖

氣泡圖

是不是有童鞋不禁想說，自己敲了半天R語言代碼,，或者美工了半天,，效果也沒上面的效果好？

吹了半天,，還是來看一看每張圖到底要如何操作吧,！

線圖,、熱圖還有氣泡圖上次已經(jīng)介紹過高顏值的在線繪圖工具推薦，那會兒這個網(wǎng)站的功能還沒有弄好,，現(xiàn)在算是所有功能都能用了（雖然網(wǎng)站上還有些圖沒補上,，辛苦Y叔了！）

今天給大家介紹新上線的幾個圖的作法：

Boxplot在腫瘤研究的文章中見的是非常多的,，比如找了個基因,，PCR在腫瘤樣本中驗證基因表達差異性，結(jié)果展示的時候就用這么一個boxplot

Long non-coding RNA PCAT-1 over-expression promotes proliferation and metastasis in non-small cell lung cancer cells

在這里,， 這個圖畫起來也很簡單（今天所有演示的圖的數(shù)據(jù),，文末有網(wǎng)盤鏈接）

輸入Group和Expr兩列數(shù)據(jù)即可，再把題注什么的標識好就OK了,。

在這里我們可以輕松切換表現(xiàn)形式,，violin plot和jitter plot，以及各種組合

Jitter plot

Violin plot

這個圖常見于測序或者芯片結(jié)果的一個展示,，用于評估數(shù)據(jù)總體分布集中趨勢,，比如下面這張圖（X軸為基因在對照組中的表達，Y軸為基因在實驗組中的表達）

Genome-wide analysis of long noncoding RNA (lncRNA) expression in colorectal cancer tissues from patients with liver metastasis

這里我隨便編了一個數(shù)據(jù)進行演示,，Color定義顏色分組（直接按復制了Expr列數(shù)據(jù),，這樣顏色隨Expr漸變），colorlist選擇Rainbow,，這樣起到一個漸變的效果,，其它的參數(shù)默認。

效果圖如下

條形圖大家應該見的多啦,，這里不作太多闡述,，按照網(wǎng)站的示例隨便畫了一下：

關于火山圖的介紹，大家可以看下小張之前寫的這篇文章如何看懂和繪制火山圖,？,。

最簡單的火山圖只需要3列數(shù)據(jù)

結(jié)果如下

如果你要在火山圖中標注一些特殊基因比如TP53，那么你需要加一列Label

Label這一列的空白單元格需要用“-”全部替代掉

具體操作如下

復制該單元格

選中整個D列后

打開“查找和選擇”中的“定位條件”

選擇“空值”,，這樣就選中了D列中的全部空白單元格

然后粘貼即可

設置參數(shù)的時候,，上下對應起來即可

這樣TP53就在圖中標注出來啦！

Histogram這部分網(wǎng)站提供了線圖和直方圖兩種形式

直方圖+線圖

Venn圖就不必多說啦

目前網(wǎng)站只支持5個集合

UpsetView和Venn圖的作用有點類似,，不過見得可能會少一些,。

我們來看一下這個圖和數(shù)據(jù)是如何對應起來的，左邊藍色的條形圖表示不同Sampl中包含的ID數(shù)量,，比如Samp4只包括3個ID,，最短。下方的黑點表示該位置有數(shù)據(jù),，灰點表示沒有,，這些黑點灰點的排列組合構(gòu)成了Samp的全部組合關系，連線表示Samp間存在交集,，所以第一列數(shù)據(jù)的意思就是：Samp4,，Samp2和Samp5之間有交集么？上方的黑色條形圖給出答案是有,，并且只有一個共同交集——就是G5,。

有一種回到高中地理的感覺，有么有,？

主成分分析可以用在差異基因篩選之后,，評價差異基因?qū)颖痉纸M的好壞

下面就舉個栗子，上表是差異基因在樣本中的表達情況,，下面是樣本分組,。

然后把這里填一下，其它默認（顏色啥的自己想調(diào)一下也可以）

下面這個PCA的結(jié)果圖表示差異基因選的還可以吧,！

好了今天介紹了這么多,，大家是不是已經(jīng)迫不及待了？

網(wǎng)盤鏈接在這里喲：https://pan.baidu.com/s/1c2bGHdm

密碼：3f25