鑒于之前文章中錯(cuò)別字太多的問(wèn)題,,現(xiàn)在希望大家看到錯(cuò)別字給留言提出來(lái),, 小編會(huì)贈(zèng)送一份禮物。謝謝支持,。 之前給大家推送過(guò)一期Aspera軟件如何下載數(shù)據(jù)的文章,。但是呢貌似現(xiàn)在Aspera官網(wǎng)有所改版,大家按照那個(gè)操作去做,,估計(jì)會(huì)有些問(wèn)題,。 作為一個(gè)升級(jí)版吧,今天還是跟大家再次說(shuō)下如何利用Aspera快速的下載基因組序列,。 今天重點(diǎn)用一個(gè)實(shí)際的例子,,如何從NCBI下載人的基因組序列來(lái)講解aspera如何使用。 首先去Aspera官網(wǎng)下載windows Aspera http://downloads./connect2// 下載之后,,點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn),,然后安裝,安裝完成之后,,會(huì)看到電腦的快捷菜單有一個(gè)圖標(biāo),。 點(diǎn)擊運(yùn)行,會(huì)在電腦的右下角出現(xiàn)一個(gè)圖標(biāo) 點(diǎn)擊這個(gè)圖標(biāo)選擇首選項(xiàng),,可以進(jìn)行相關(guān)的配置,,比如說(shuō)下載的上限。 這里值得注意的是,,之前的軟件都是英文,,現(xiàn)在都支持中文了,可以間接的說(shuō)明,,這個(gè)東西好使,。 下面,我們?nèi)ハ螺d下人的基因組,。 知識(shí)點(diǎn) 在下載之前,,大家需要對(duì)下載的原理有所了解。 就是目前http和ftp都是基于互聯(lián)網(wǎng)TCP協(xié)議的。 TCP在遠(yuǎn)距離數(shù)據(jù)傳輸中存在一些先天的不足,,文件越大,、距離越遠(yuǎn),其丟包,、延時(shí)等問(wèn)題對(duì)于傳輸速度的影響就越大,。 但是呢IBM開(kāi)發(fā)了一種基于fasp 的技術(shù),不需要借助TCP協(xié)議,,可以實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)距離,,高速度,大文件的傳輸,。速度可以到達(dá)ftp的100多倍,。 上面話的重點(diǎn)在于,如果想用aspera進(jìn)行下載,,需要遵從fasp協(xié)議,。如果文件不支持,就沒(méi)有辦法下載,。 那啥片啥的,,就想想的了。 那么NCBI支持aspera下載嗎,? 支持的,。 如果你理解了,,剛才我說(shuō)的話,,相信你不會(huì)這樣去下載(右擊,保存為) 這是一種錯(cuò)誤的方式,,這樣啟動(dòng)的還是常規(guī)的ftp下載,。 如何調(diào)用超級(jí)暴力的aspera下載呢 以NCBI為例 http://www.ncbi.nlm./projects/faspftp/ 網(wǎng)址中注明了fasp的,是可以利用aspera進(jìn)行下載的,。 然后我們進(jìn)入這個(gè)網(wǎng)址 找到人的基因組 點(diǎn)擊進(jìn)去,,選擇seq中人的第一條染色體。點(diǎn)擊保存
跳出如下頁(yè)面 選擇允許,,啟動(dòng)下載(有人問(wèn)為啥有兩次已經(jīng)完成了,,因?yàn)樘炝耍瑳](méi)來(lái)的及截圖) 小編親測(cè),,速度高達(dá)30Mbs 到此數(shù)據(jù)下載完成,。 相信這次手把手的教學(xué),能幫助大家節(jié)省不少的時(shí)間,。
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