今天教一下大家如何更加快速的（可都是Mb/s的速度奧）下載NCBI數(shù)據(jù),，包括轉(zhuǎn)錄組,、基因組原始數(shù)據(jù)SRA文件和基因組組裝及注釋數(shù)據(jù)（genome和GFF文件），還有其他NCBI上所有數(shù)據(jù)大家自己發(fā)揮,，都能找到,，快速下載！

一,、window系統(tǒng)

1,、軟件下載。Aspera Connect下載, 下載地址：http://www./downloads,，選擇相應(yīng)版本,，安裝到本地電腦上；

2,、數(shù)據(jù)網(wǎng)址獲得,。所有適用于aspera下載的數(shù)據(jù)均在此網(wǎng)址內(nèi)http://www.ncbi.nlm./projects/faspftp/，你只需要找到對應(yīng)的數(shù)據(jù)點擊即可彈出aspera軟件下載界面,，下載即可（一個一個下,，不可貪多奧！）

SRA數(shù)據(jù)下載截圖,，找到對應(yīng)的SRR號,，點擊黃色部分SRR000001.sra即可完成下載

基因組相關(guān)信息網(wǎng)址：找到genome，然后找到對應(yīng)物種拉丁文即可,，注意點擊黃色部分向右的小箭頭,，會翻頁的奧！（別找不到自己的物種）

二,、linux系統(tǒng)

1. 進入linux服務(wù)器,，下載aspera。

輸入：wgethttp://downloads./download/sw/connect/3.1/aspera-connect-3.1.1.70545-linux-64.tar.gz

將會開始下載,。

2. 下載完畢后,，解壓，輸入： tar xvf aspera-connect-3.1.1.70545-linux-64.tar.gz

3. 安裝輸入：sh aspera-connect-3.1.1.70545-linux-64.sh

4. cd 到/home/usrname文件夾,，ls-a就能看到 .aspera

這就是安裝的文件夾,。

5. 重要一步，添加環(huán)境變量,，否則不能用,。輸入  

exportPATH=$PATH:/home/username/.aspera/connect/bin

6. 數(shù)據(jù)下載。

可以按照這個模板去下載了SRA數(shù)據(jù)（如果很多可以把所有命令寫到一個shell里面,，nohup提交睡大覺去就可以了,，明早一醒,，全部ok）

nohup /home/usrname/.aspera/connect/bin/ascp -i/home/usrname/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T [email protected].:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR949/SRR949627/SRR949627.sra./ &    

可以按照此模板下載基因組相關(guān)數(shù)據(jù)

~/.aspera/connect/bin/ascp -i~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T [email protected].:genomes/all/GCF_000147175.1_CamFlo_1.0/GCF_000147175.1_CamFlo_1.0_genomic.fna.gz./

其中GCF_000147175.1_CamFlo_1.0/GCF_000147175.1_CamFlo_1.0_genomic.fna.gz根據(jù)你要下載的基因組改成NCBI FTP上的基因組、GFF和CDS文件名字

其他類型數(shù)據(jù)類似