根據(jù)《合同法》規(guī)定，正常的合同變更受到法律的保護(hù),。但對一些以變更合同之名,，行簽訂“黑白合同”之實(shí)的行為，其目的不應(yīng)予以保護(hù),。當(dāng)事人對工程價(jià)款的重大變更,，應(yīng)認(rèn)定為變更合同的實(shí)質(zhì)性條款，依照《建設(shè)工程司法解釋》第21條規(guī)定,，當(dāng)事人就同一建設(shè)工程另行訂立的施工合同與備案的中標(biāo)合同實(shí)質(zhì)性內(nèi)容不一致,，應(yīng)以備案的中標(biāo)合同作為結(jié)算依據(jù)。

2009年3月5日,，甲公司通過公開招標(biāo)成為天津某物流園工程項(xiàng)目冷庫工程的中標(biāo)單位,，隨即與發(fā)包人乙公司簽訂《建設(shè)工程施工合同》,，合同簽訂后即向建設(shè)工程合同管理站備案。合同約定：乙公司將物流園項(xiàng)目一期工程發(fā)包給甲公司施工,，合同價(jià)款6500萬元,，采用可調(diào)價(jià)，進(jìn)度款按每月完工的工程量的85%支付,。2009年4月6日,，甲公司與乙公司簽訂《建設(shè)工程補(bǔ)充協(xié)議》一份，約定：合同價(jià)款暫定為5000萬元（以結(jié)算為準(zhǔn)）,，結(jié)構(gòu)封頂支付40%,，結(jié)構(gòu)砌筑墻體完成支付10%，內(nèi)外墻粉刷支付10%,，竣工后支付10%,，余款30%分三年付清。

2011年8月,，工程經(jīng)竣工驗(yàn)收合格,。因雙方對結(jié)算問題存在較大爭議，甲公司起訴至法院,，要求：1,、判令乙公司支付工程款3000萬元；2,、判令乙公司支付違約金1200萬元,；3、確認(rèn)乙公司就工程拍賣,、變賣所得價(jià)款享有優(yōu)先受償權(quán),。

案件的爭議的焦點(diǎn)為：

本案是以《建設(shè)工程施工合同》還是以《建設(shè)工程補(bǔ)充協(xié)議》作為結(jié)算依據(jù)。

一審法院認(rèn)為,，《建設(shè)工程施工合同》經(jīng)過備案,，為合法有效的合同?！督ㄔO(shè)工程補(bǔ)充協(xié)議》并未經(jīng)過備案,，且在工程價(jià)款上進(jìn)行了重大變更，而工程價(jià)款屬于合同的實(shí)質(zhì)性內(nèi)容,，該《建設(shè)工程補(bǔ)充協(xié)議》違反了《中華人民共和國招標(biāo)投標(biāo)法》第四十六條的強(qiáng)制性規(guī)定,，依法應(yīng)當(dāng)認(rèn)定為無效。

故判決：一,、乙公司支付工程款2500萬元,；二、乙公司支付違約金1050萬元；三,、乙公司就工程拍賣,、變賣所得價(jià)款享有優(yōu)先受償權(quán)。

建筑市場上大量存在發(fā)包人與承包人就同一建設(shè)工程簽訂兩份或兩份以上實(shí)質(zhì)性內(nèi)容不一致的“黑白合同”或多份“黑合同”的情形,，目的是規(guī)避招投標(biāo)程序,。

《中華人民共和國招標(biāo)投標(biāo)法》第四十六條規(guī)定：“招標(biāo)人和中標(biāo)人應(yīng)當(dāng)自中標(biāo)通知書發(fā)出之日起三十日內(nèi)，按照招標(biāo)文件和中標(biāo)人的投標(biāo)文件訂立書面合同,。招標(biāo)人和中標(biāo)人不得再行訂立背離合同實(shí)質(zhì)性內(nèi)容的其他協(xié)議”,。如何理解該法律規(guī)定的“實(shí)質(zhì)性內(nèi)容”，首先,，要看兩份合同中不一致的內(nèi)容是否屬于工程價(jià)款,、工程質(zhì)量、工期,、違約責(zé)任等影響當(dāng)事人基本權(quán)利義務(wù)的條款,，其次，要區(qū)分合同變更是否屬于正常的合同變更,，如果屬于正常的設(shè)計(jì)變更,，不應(yīng)理解為變更實(shí)質(zhì)性內(nèi)容。

《建設(shè)工程司法解釋》第二十一條明確規(guī)定：“當(dāng)事人就同一建設(shè)工程另行訂立的建設(shè)工程施工合同與經(jīng)過備案的中標(biāo)合同實(shí)質(zhì)性內(nèi)容不一致的,，應(yīng)當(dāng)以備案的中標(biāo)合同作為結(jié)算工程價(jià)款的根據(jù),。”“備案的中標(biāo)合同”是指履行招投標(biāo)程序后,，承發(fā)包雙方按照《中標(biāo)通知書》及招標(biāo)文件和投標(biāo)文件記載的實(shí)質(zhì)性內(nèi)容簽訂并備案的施工合同,。此份合同為法定結(jié)算依據(jù)，旨在保障公平競爭,，維護(hù)建筑市場秩序,。

因此，本案例中法院根據(jù)上述法律規(guī)定,，判決乙公司欠付的冷庫工程款與違約金的計(jì)算以經(jīng)過備案的《建設(shè)工程施工合同》為依據(jù)，不能以《建設(shè)工程補(bǔ)充協(xié)議》為依據(jù),。